RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586852.5

PTPRH-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type H, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRH, Length 680 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRH-204ENST00000586852 SDSP20132 328 aa18.37■□□□□ 0.53
PTPRH-204ENST00000586852 CALML3P27482 149 aa18.37■□□□□ 0.53
PTPRH-204ENST00000586852 NT5C2P49902 561 aa18.37■□□□□ 0.53
PTPRH-204ENST00000586852 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
PTPRH-204ENST00000586852 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
PTPRH-204ENST00000586852 ZNF543Q08ER8 600 aa18.37■□□□□ 0.53
PTPRH-204ENST00000586852 CCDC178Q5BJE1 867 aa18.37■□□□□ 0.53
PTPRH-204ENST00000586852 RNF207Q6ZRF8 634 aa18.37■□□□□ 0.53
PTPRH-204ENST00000586852 SMC5Q8IY18 1101 aa18.37■□□□□ 0.53
PTPRH-204ENST00000586852 ZNF576Q9H609 170 aa18.37■□□□□ 0.53
PTPRH-204ENST00000586852 IL23AQ9NPF7 189 aa18.37■□□□□ 0.53
PTPRH-204ENST00000586852 FGBP02675 491 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRH-204ENST00000586852 GRIN2CQ14957 1233 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRH-204ENST00000586852 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
PTPRH-204ENST00000586852 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
PTPRH-204ENST00000586852 CHD1LQ86WJ1 897 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRH-204ENST00000586852 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
PTPRH-204ENST00000586852 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
PTPRH-204ENST00000586852 POLR3EQ9NVU0 708 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRH-204ENST00000586852 MCM3APO60318 1980 aa18.35■□□□□ 0.53
PTPRH-204ENST00000586852 GRIN2DO15399 1336 aa18.35■□□□□ 0.53
PTPRH-204ENST00000586852 WDR19Q8NEZ3 1342 aa18.35■□□□□ 0.53
PTPRH-204ENST00000586852 SNHG28P0DPA3 235 aa18.35■□□□□ 0.53
PTPRH-204ENST00000586852 PTGS1P23219 599 aa18.35■□□□□ 0.53
PTPRH-204ENST00000586852 CPT1AP50416 773 aa18.35■□□□□ 0.53
PTPRH-204ENST00000586852 PSMC6P62333 389 aa18.35■□□□□ 0.53
PTPRH-204ENST00000586852 PDE4DQ08499 809 aa18.35■□□□□ 0.53
PTPRH-204ENST00000586852 TMEM63BQ5T3F8 832 aa18.35■□□□□ 0.53
PTPRH-204ENST00000586852 RASIP1Q5U651 963 aa18.35■□□□□ 0.53
PTPRH-204ENST00000586852 IQCA1Q86XH1 822 aa18.35■□□□□ 0.53
PTPRH-204ENST00000586852 DGKHQ86XP1 1220 aa18.35■□□□□ 0.53
PTPRH-204ENST00000586852 TBC1D10CQ8IV04 446 aa18.35■□□□□ 0.53
PTPRH-204ENST00000586852 CLEC4DQ8WXI8 215 aa18.35■□□□□ 0.53
PTPRH-204ENST00000586852 TRPV6Q9H1D0 765 aa18.35■□□□□ 0.53
PTPRH-204ENST00000586852 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa18.35■□□□□ 0.53
PTPRH-204ENST00000586852 HIP1O00291 1037 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRH-204ENST00000586852 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRH-204ENST00000586852 RPS6P62753 249 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
PTPRH-204ENST00000586852 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRH-204ENST00000586852 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
PTPRH-204ENST00000586852 DNERQ8NFT8 737 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRH-204ENST00000586852 HERVK_113Q902F9 699 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRH-204ENST00000586852 OSBPL3Q9H4L5 887 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRH-204ENST00000586852 MSRAQ9UJ68 235 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRH-204ENST00000586852 RAD50Q92878 1312 aa18.33■□□□□ 0.53
PTPRH-204ENST00000586852 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
PTPRH-204ENST00000586852 GRXCR1A8MXD5 290 aa18.33■□□□□ 0.52
PTPRH-204ENST00000586852 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP18.33■□□□□ 0.52
PTPRH-204ENST00000586852 B4GALT4O60513 344 aa18.33■□□□□ 0.52
PTPRH-204ENST00000586852 MYL3P08590 195 aa18.33■□□□□ 0.52
PTPRH-204ENST00000586852 CCL23P55773 120 aa18.33■□□□□ 0.52
PTPRH-204ENST00000586852 RAB30Q15771 203 aa18.33■□□□□ 0.52
PTPRH-204ENST00000586852 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
PTPRH-204ENST00000586852 SLC30A10Q6XR72 485 aa18.33■□□□□ 0.52
PTPRH-204ENST00000586852 OR6J1Q8NGC5 347 aa18.33■□□□□ 0.52
PTPRH-204ENST00000586852 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa18.33■□□□□ 0.52
PTPRH-204ENST00000586852 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
PTPRH-204ENST00000586852 PBX4Q9BYU1 374 aa18.33■□□□□ 0.52
PTPRH-204ENST00000586852 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.52
PTPRH-204ENST00000586852 KPNA6O60684 536 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRH-204ENST00000586852 KDM4AO75164 1064 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRH-204ENST00000586852 GOLGA8HP0CJ92 632 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRH-204ENST00000586852 NUCB1Q02818 461 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRH-204ENST00000586852 PPP2R5BQ15173 497 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRH-204ENST00000586852 RGS22Q8NE09 1264 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRH-204ENST00000586852 SCFD2Q8WU76 684 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRH-204ENST00000586852 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
PTPRH-204ENST00000586852 MAF1Q9H063 256 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRH-204ENST00000586852 KAT14Q9H8E8 782 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRH-204ENST00000586852 CTNNA3Q9UI47 895 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRH-204ENST00000586852 PBX2P40425 430 aa18.31■□□□□ 0.52
PTPRH-204ENST00000586852 PURAQ00577 322 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
PTPRH-204ENST00000586852 USH1GQ495M9 461 aa18.31■□□□□ 0.52
PTPRH-204ENST00000586852 OTOP2Q7RTS6 562 aa18.31■□□□□ 0.52
PTPRH-204ENST00000586852 PNMA1Q8ND90 353 aa18.31■□□□□ 0.52
PTPRH-204ENST00000586852 ANKS1AQ92625 1134 aa18.31■□□□□ 0.52
PTPRH-204ENST00000586852 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
PTPRH-204ENST00000586852 UBA5Q9GZZ9 404 aa18.31■□□□□ 0.52
PTPRH-204ENST00000586852 NEDD4P46934 1319 aa18.3■□□□□ 0.52
PTPRH-204ENST00000586852 UMODL1Q5DID0 1318 aa18.3■□□□□ 0.52
PTPRH-204ENST00000586852 IGHDP01880 384 aa18.3■□□□□ 0.52
PTPRH-204ENST00000586852 TXNP10599 105 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
PTPRH-204ENST00000586852 EDNRBP24530 442 aa18.3■□□□□ 0.52
PTPRH-204ENST00000586852 TTLL4Q14679 1199 aa18.3■□□□□ 0.52
PTPRH-204ENST00000586852 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
PTPRH-204ENST00000586852 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
PTPRH-204ENST00000586852 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
PTPRH-204ENST00000586852 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
PTPRH-204ENST00000586852 TNKSO95271 1327 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRH-204ENST00000586852 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
PTPRH-204ENST00000586852 FAM47CQ5HY64 1035 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRH-204ENST00000586852 MCF2L2Q86YR7 1114 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRH-204ENST00000586852 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
PTPRH-204ENST00000586852 DSCC1Q9BVC3 393 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRH-204ENST00000586852 KRT23Q9C075 422 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRH-204ENST00000586852 SLC28A3Q9HAS3 691 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRH-204ENST00000586852 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
PTPRH-204ENST00000586852 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
PTPRH-204ENST00000586852 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRH-204ENST00000586852 ABCB11O95342 1321 aa18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40 ms