RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570641.1

SPNS2-202, Transcript of sphingolipid transporter 2, humanhuman

TSL 5

Gene SPNS2, Length 783 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS2-202ENST00000570641 USP17L6PQ6QN14 398 aa20.66■□□□□ 0.9
SPNS2-202ENST00000570641 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
SPNS2-202ENST00000570641 CLEC4DQ8WXI8 215 aa20.66■□□□□ 0.9
SPNS2-202ENST00000570641 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
SPNS2-202ENST00000570641 PAGR1Q9BTK6 254 aa20.66■□□□□ 0.9
SPNS2-202ENST00000570641 HOMER2Q9NSB8 354 aa20.66■□□□□ 0.9
SPNS2-202ENST00000570641 POLR3EQ9NVU0 708 aa20.66■□□□□ 0.9
SPNS2-202ENST00000570641 BTBD7Q9P203 1132 aa20.66■□□□□ 0.9
SPNS2-202ENST00000570641 SPDYE3A6NKU9 549 aa20.65■□□□□ 0.9
SPNS2-202ENST00000570641 YEATS4O95619 227 aa20.65■□□□□ 0.9
SPNS2-202ENST00000570641 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
SPNS2-202ENST00000570641 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
SPNS2-202ENST00000570641 MUM1L1Q5H9M0 696 aa20.65■□□□□ 0.9
SPNS2-202ENST00000570641 TTC38Q5R3I4 469 aa20.65■□□□□ 0.9
SPNS2-202ENST00000570641 RIOX2Q8IUF8 465 aa20.65■□□□□ 0.9
SPNS2-202ENST00000570641 FAM43AQ8N2R8 423 aa20.65■□□□□ 0.9
SPNS2-202ENST00000570641 CHST13Q8NET6 341 aa20.65■□□□□ 0.9
SPNS2-202ENST00000570641 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
SPNS2-202ENST00000570641 SPATA32Q96LK8 384 aa20.65■□□□□ 0.9
SPNS2-202ENST00000570641 PTPN18Q99952 460 aa20.65■□□□□ 0.9
SPNS2-202ENST00000570641 SPATC1LQ9H0A9 340 aa20.65■□□□□ 0.9
SPNS2-202ENST00000570641 ACAD9Q9H845 621 aa20.65■□□□□ 0.9
SPNS2-202ENST00000570641 EHMT1Q9H9B1 1298 aa20.65■□□□□ 0.9
SPNS2-202ENST00000570641 CEP131Q9UPN4 1083 aa20.65■□□□□ 0.9
SPNS2-202ENST00000570641 NFIBO00712 420 aa20.64■□□□□ 0.89
SPNS2-202ENST00000570641 CNMDO75829 334 aa20.64■□□□□ 0.89
SPNS2-202ENST00000570641 SLC25A27O95847 323 aa20.64■□□□□ 0.89
SPNS2-202ENST00000570641 ATP2B1P20020 1258 aa20.64■□□□□ 0.89
SPNS2-202ENST00000570641 NASPP49321 788 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
SPNS2-202ENST00000570641 HSD17B4P51659 736 aa20.64■□□□□ 0.89
SPNS2-202ENST00000570641 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
SPNS2-202ENST00000570641 STK38Q15208 465 aa20.64■□□□□ 0.89
SPNS2-202ENST00000570641 NFKBIBQ15653 356 aa20.64■□□□□ 0.89
SPNS2-202ENST00000570641 INF2Q27J81 1249 aa20.64■□□□□ 0.89
SPNS2-202ENST00000570641 POTEEQ6S8J3 1075 aa20.64■□□□□ 0.89
SPNS2-202ENST00000570641 TMEM87AQ8NBN3 555 aa20.64■□□□□ 0.89
SPNS2-202ENST00000570641 TBCKQ8TEA7 893 aa20.64■□□□□ 0.89
SPNS2-202ENST00000570641 ANO3Q9BYT9 981 aa20.64■□□□□ 0.89
SPNS2-202ENST00000570641 RBPJLQ9UBG7 517 aa20.64■□□□□ 0.89
SPNS2-202ENST00000570641 FBXO40Q9UH90 709 aa20.64■□□□□ 0.89
SPNS2-202ENST00000570641 RCOR1Q9UKL0 485 aa20.64■□□□□ 0.89
SPNS2-202ENST00000570641 RIPK3Q9Y572 518 aa20.64■□□□□ 0.89
SPNS2-202ENST00000570641 CLIC4Q9Y696 253 aa20.64■□□□□ 0.89
SPNS2-202ENST00000570641 BMP15O95972 392 aa20.63■□□□□ 0.89
SPNS2-202ENST00000570641 CYP2C8P10632 490 aa20.63■□□□□ 0.89
SPNS2-202ENST00000570641 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
SPNS2-202ENST00000570641 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
SPNS2-202ENST00000570641 DEFB115Q30KQ5 88 aa20.63■□□□□ 0.89
SPNS2-202ENST00000570641 NEK8Q86SG6 692 aa20.63■□□□□ 0.89
SPNS2-202ENST00000570641 JMYQ8N9B5 988 aa20.63■□□□□ 0.89
SPNS2-202ENST00000570641 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
SPNS2-202ENST00000570641 TBC1D5Q92609 795 aa20.63■□□□□ 0.89
SPNS2-202ENST00000570641 PGBD1Q96JS3 809 aa20.63■□□□□ 0.89
SPNS2-202ENST00000570641 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
SPNS2-202ENST00000570641 GDPD2Q9HCC8 539 aa20.63■□□□□ 0.89
SPNS2-202ENST00000570641 ELP1O95163 1332 aa20.62■□□□□ 0.89
SPNS2-202ENST00000570641 RASSF10A6NK89 507 aa20.62■□□□□ 0.89
SPNS2-202ENST00000570641 CYP4F22Q6NT55 531 aa20.62■□□□□ 0.89
SPNS2-202ENST00000570641 RNF207Q6ZRF8 634 aa20.62■□□□□ 0.89
SPNS2-202ENST00000570641 FCHSD1Q86WN1 690 aa20.62■□□□□ 0.89
SPNS2-202ENST00000570641 LINC00301Q8NCQ3 95 aa20.62■□□□□ 0.89
SPNS2-202ENST00000570641 KCNG4Q8TDN1 519 aa20.62■□□□□ 0.89
SPNS2-202ENST00000570641 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP20.62■□□□□ 0.89
SPNS2-202ENST00000570641 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
SPNS2-202ENST00000570641 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa20.62■□□□□ 0.89
SPNS2-202ENST00000570641 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP20.61■□□□□ 0.89
SPNS2-202ENST00000570641 ERVK-9P63128 1117 aa20.61■□□□□ 0.89
SPNS2-202ENST00000570641 ERVK-24P63145 666 aa20.61■□□□□ 0.89
SPNS2-202ENST00000570641 CCNA1P78396 465 aa20.61■□□□□ 0.89
SPNS2-202ENST00000570641 NOGQ13253 232 aa20.61■□□□□ 0.89
SPNS2-202ENST00000570641 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
SPNS2-202ENST00000570641 SLC39A14Q15043 492 aa20.61■□□□□ 0.89
SPNS2-202ENST00000570641 NSMFQ6X4W1 530 aa20.61■□□□□ 0.89
SPNS2-202ENST00000570641 IFNL1Q8IU54 200 aa20.61■□□□□ 0.89
SPNS2-202ENST00000570641 TNS4Q8IZW8 715 aa20.61■□□□□ 0.89
SPNS2-202ENST00000570641 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
SPNS2-202ENST00000570641 TXNRD2Q9NNW7 524 aa20.61■□□□□ 0.89
SPNS2-202ENST00000570641 MORF4L1Q9UBU8 362 aa20.61■□□□□ 0.89
SPNS2-202ENST00000570641 SPTLC2O15270 562 aa20.6■□□□□ 0.89
SPNS2-202ENST00000570641 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
SPNS2-202ENST00000570641 TM4SF4P48230 202 aa20.6■□□□□ 0.89
SPNS2-202ENST00000570641 USP11P51784 963 aa20.6■□□□□ 0.89
SPNS2-202ENST00000570641 NBR1Q14596 966 aa20.6■□□□□ 0.89
SPNS2-202ENST00000570641 ZNF174Q15697 407 aa20.6■□□□□ 0.89
SPNS2-202ENST00000570641 LETM2Q2VYF4 491 aa20.6■□□□□ 0.89
SPNS2-202ENST00000570641 NCAPG2Q86XI2 1143 aa20.6■□□□□ 0.89
SPNS2-202ENST00000570641 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
SPNS2-202ENST00000570641 SHCBP1Q8NEM2 672 aa20.6■□□□□ 0.89
SPNS2-202ENST00000570641 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa20.6■□□□□ 0.89
SPNS2-202ENST00000570641 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
SPNS2-202ENST00000570641 SREBF1P36956 1147 aa20.59■□□□□ 0.89
SPNS2-202ENST00000570641 RPS6P62753 249 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
SPNS2-202ENST00000570641 GRM1Q13255 1194 aa20.59■□□□□ 0.89
SPNS2-202ENST00000570641 PTPAQ15257 358 aa20.59■□□□□ 0.89
SPNS2-202ENST00000570641 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
SPNS2-202ENST00000570641 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP20.59■□□□□ 0.89
SPNS2-202ENST00000570641 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
SPNS2-202ENST00000570641 CAPNS2Q96L46 248 aa20.59■□□□□ 0.89
SPNS2-202ENST00000570641 MROH8Q9H579 483 aa20.59■□□□□ 0.89
SPNS2-202ENST00000570641 LMBRD1Q9NUN5 540 aa20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23 ms