RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560725.1

TMOD3-208, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 4

Gene TMOD3, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-208ENST00000560725 FLT3P36888 993 aa8.05□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 GATA4P43694 442 aa8.05□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 TESK1Q15569 626 aa8.05□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 PRSS53Q2L4Q9 553 aa8.05□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 RNF43Q68DV7 783 aa8.05□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 CNNM4Q6P4Q7 775 aa8.05□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 KSR1Q8IVT5 923 aa8.05□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 PPIL6Q8IXY8 311 aa8.05□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 DCAF5Q96JK2 942 aa8.05□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 MFSD14AQ96MC6 490 aa8.05□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 HOMER2Q9NSB8 354 aa8.05□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 MINPP1Q9UNW1 487 aa8.05□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 NEO1Q92859 1461 aa8.05□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 FAM170BA6NMN3 283 aa8.04□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 GSC2O15499 205 aa8.04□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 OPA1O60313 960 aa8.04□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 THBDP07204 575 aa8.04□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 PMLP29590 882 aa8.04□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 CLCN7P51798 805 aa8.04□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 NFKB2Q00653 900 aa8.04□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 CYP4F3Q08477 520 aa8.04□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 KCNAB2Q13303 367 aa8.04□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 PLEKHG6Q3KR16 790 aa8.04□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 EEF1DP3Q658K8 133 aa8.04□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 RCSD1Q6JBY9 416 aa8.04□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 KREMEN2Q8NCW0 462 aa8.04□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 NPLOC4Q8TAT6 608 aa8.04□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 TCTN2Q96GX1 697 aa8.04□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 DBNDD2Q9BQY9 259 aa8.04□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa8.04□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 SAMD9Q5K651 1589 aa8.04□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 ABCA9Q8IUA7 1624 aa8.03□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 C2orf71A6NGG8 1288 aa8.03□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 ALG1L2C9J202 215 aa8.03□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 ZNF205O95201 554 aa8.03□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 PDGFRBP09619 1106 aa8.03□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 SEPHS1P49903 392 aa8.03□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 FGD2Q7Z6J4 655 aa8.03□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 THAP5Q7Z6K1 395 aa8.03□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa8.03□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 FBXL6Q8N531 539 aa8.03□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 STAG1Q8WVM7 1258 aa8.03□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 MCMBPQ9BTE3 642 aa8.03□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 KLHL42Q9P2K6 505 aa8.03□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa8.03□□□□□ -1.12
TMOD3-208ENST00000560725 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa8.02□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 S100BP04271 92 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 F13BP05160 661 aa8.02□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 CEACAM5P06731 702 aa8.02□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 IFNGR1P15260 489 aa8.02□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 VAV1P15498 845 aa8.02□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 OXCT1P55809 520 aa8.02□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 RBM10P98175 930 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 NFIAQ12857 509 aa8.02□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 FERMT3Q86UX7 667 aa8.02□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 JAMLQ86YT9 394 aa8.02□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP8.02□□□□□ -1.132e-7■□□□□ 8.2
TMOD3-208ENST00000560725 FRS2Q8WU20 508 aa8.02□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 SCLYQ96I15 445 aa8.02□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 CEP89Q96ST8 783 aa8.02□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 SLC12A9Q9BXP2 914 aa8.02□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 GPR27Q9NS67 375 aa8.02□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa8.02□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa8.01□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 LTBRP36941 435 aa8.01□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 GPR85P60893 370 aa8.01□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 IQCEQ6IPM2 695 aa8.01□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 DENND5AQ6IQ26 1287 aa8.01□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 ANKLE2Q86XL3 938 aa8.01□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP8.01□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 SPACA3Q8IXA5 215 aa8.01□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 IFNL3Q8IZI9 196 aa8.01□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 UBR7Q8N806 425 aa8.01□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 LINC00116Q8NCU8 138 aa8.01□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 PHF20Q9BVI0 1012 aa8.01□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa8.01□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 ATG3Q9NT62 314 aa8.01□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 FHOD3Q2V2M9 1422 aa8.01□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 FAM83GA6ND36 823 aa8□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 RASGRP1O95267 797 aa8□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 CRTAMO95727 393 aa8□□□□□ -1.13
TMOD3-208ENST00000560725 SYPP08247 313 aa8□□□□□ -1.13
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