RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559561.5

MEIS2-215, Transcript of Meis homeobox 2, human

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene MEIS2, Length 1,442 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MEIS2-215	ENST00000559561	ZNF536	O15090	1300 aa		15.44	■□□□□ 0.06
MEIS2-215	ENST00000559561	POLR2D	O15514	142 aa	Known RBP	15.43	■□□□□ 0.06
MEIS2-215	ENST00000559561	ACTN4	O43707	911 aa	Known RBP	15.43	■□□□□ 0.06
MEIS2-215	ENST00000559561	TDP2	O95551	362 aa		15.43	■□□□□ 0.06
MEIS2-215	ENST00000559561	CAVIN2	O95810	425 aa		15.43	■□□□□ 0.06
MEIS2-215	ENST00000559561	FDX1	P10109	184 aa		15.43	■□□□□ 0.06
MEIS2-215	ENST00000559561	TAL1	P17542	331 aa	Predicted RBP	15.43	■□□□□ 0.06
MEIS2-215	ENST00000559561	NF2	P35240	595 aa		15.43	■□□□□ 0.06
MEIS2-215	ENST00000559561	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	15.43	■□□□□ 0.06
MEIS2-215	ENST00000559561	MAP3K9	P80192	1104 aa		15.43	■□□□□ 0.06
MEIS2-215	ENST00000559561	VGLL4	Q14135	290 aa		15.43	■□□□□ 0.06
MEIS2-215	ENST00000559561	LONRF3	Q496Y0	759 aa		15.43	■□□□□ 0.06
MEIS2-215	ENST00000559561	MOXD1	Q6UVY6	613 aa		15.43	■□□□□ 0.06
MEIS2-215	ENST00000559561	RNF214	Q8ND24	703 aa		15.43	■□□□□ 0.06
MEIS2-215	ENST00000559561	CNNM3	Q8NE01	707 aa		15.43	■□□□□ 0.06
MEIS2-215	ENST00000559561	CRYGN	Q8WXF5	182 aa		15.43	■□□□□ 0.06
MEIS2-215	ENST00000559561	SLC38A10	Q9HBR0	1119 aa		15.43	■□□□□ 0.06
MEIS2-215	ENST00000559561	KIAA1468	Q9P260	1216 aa		15.43	■□□□□ 0.06
MEIS2-215	ENST00000559561	USP25	Q9UHP3	1055 aa		15.43	■□□□□ 0.06
MEIS2-215	ENST00000559561	HOOK1	Q9UJC3	728 aa	Known RBP	15.43	■□□□□ 0.06
MEIS2-215	ENST00000559561	PNMA2	Q9UL42	364 aa		15.43	■□□□□ 0.06
MEIS2-215	ENST00000559561	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		15.43	■□□□□ 0.06
MEIS2-215	ENST00000559561		A0A087X0B3	334 aa		15.43	■□□□□ 0.06
MEIS2-215	ENST00000559561	FLOT1	O75955	427 aa		15.43	■□□□□ 0.06
MEIS2-215	ENST00000559561	MYCN	P04198	464 aa	Predicted RBP	15.43	■□□□□ 0.06
MEIS2-215	ENST00000559561	TXLNA	P40222	546 aa		15.43	■□□□□ 0.06
MEIS2-215	ENST00000559561	USP11	P51784	963 aa		15.43	■□□□□ 0.06
MEIS2-215	ENST00000559561	PRKG1	Q13976	671 aa		15.43	■□□□□ 0.06
MEIS2-215	ENST00000559561	ANO6	Q4KMQ2	910 aa		15.43	■□□□□ 0.06
MEIS2-215	ENST00000559561	SH3D19	Q5HYK7	790 aa		15.43	■□□□□ 0.06
MEIS2-215	ENST00000559561	KANK3	Q6NY19	840 aa		15.43	■□□□□ 0.06
MEIS2-215	ENST00000559561	DLK2	Q6UY11	383 aa		15.43	■□□□□ 0.06
MEIS2-215	ENST00000559561	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	15.43	■□□□□ 0.06
MEIS2-215	ENST00000559561	LDHD	Q86WU2	507 aa		15.43	■□□□□ 0.06
MEIS2-215	ENST00000559561	FAM200A	Q8TCP9	573 aa		15.43	■□□□□ 0.06
MEIS2-215	ENST00000559561	AK8	Q96MA6	479 aa		15.43	■□□□□ 0.06
MEIS2-215	ENST00000559561	MBOAT7	Q96N66	472 aa		15.43	■□□□□ 0.06
MEIS2-215	ENST00000559561	MTMR9	Q96QG7	549 aa		15.43	■□□□□ 0.06
MEIS2-215	ENST00000559561	PANK2	Q9BZ23	570 aa		15.43	■□□□□ 0.06
MEIS2-215	ENST00000559561	SERTAD1	Q9UHV2	236 aa		15.43	■□□□□ 0.06
MEIS2-215	ENST00000559561	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		15.43	■□□□□ 0.06
MEIS2-215	ENST00000559561	CSAD	Q9Y600	493 aa		15.43	■□□□□ 0.06
MEIS2-215	ENST00000559561	CYP3A7-CYP3A51P	A0A087WV96	503 aa		15.42	■□□□□ 0.06
MEIS2-215	ENST00000559561	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		15.42	■□□□□ 0.06
MEIS2-215	ENST00000559561	POTEC	B2RU33	542 aa		15.42	■□□□□ 0.06
MEIS2-215	ENST00000559561	SLC37A4	O43826	429 aa		15.42	■□□□□ 0.06
MEIS2-215	ENST00000559561	CAPN15	O75808	1086 aa		15.42	■□□□□ 0.06
MEIS2-215	ENST00000559561	CYP3A7	P24462	503 aa		15.42	■□□□□ 0.06
MEIS2-215	ENST00000559561	SREBF1	P36956	1147 aa		15.42	■□□□□ 0.06
MEIS2-215	ENST00000559561	HMGCS2	P54868	508 aa		15.42	■□□□□ 0.06
MEIS2-215	ENST00000559561	CALCRL	Q16602	461 aa		15.42	■□□□□ 0.06
MEIS2-215	ENST00000559561	UVSSA	Q2YD98	709 aa		15.42	■□□□□ 0.06
MEIS2-215	ENST00000559561	RBM46	Q8TBY0	533 aa	Known RBP	15.42	■□□□□ 0.06
MEIS2-215	ENST00000559561	CCDC34	Q96HJ3	373 aa		15.42	■□□□□ 0.06
MEIS2-215	ENST00000559561	P2RX7	Q99572	595 aa	Known RBP	15.42	■□□□□ 0.06
MEIS2-215	ENST00000559561	ANO10	Q9NW15	660 aa		15.42	■□□□□ 0.06
MEIS2-215	ENST00000559561	CCPG1	Q9ULG6	757 aa		15.42	■□□□□ 0.06
MEIS2-215	ENST00000559561	SLFN14	P0C7P3	912 aa		15.41	■□□□□ 0.06
MEIS2-215	ENST00000559561	FXR2	P51116	673 aa	Known RBP eCLIP	15.41	■□□□□ 0.06
MEIS2-215	ENST00000559561	ARHGAP4	P98171	946 aa		15.41	■□□□□ 0.06
MEIS2-215	ENST00000559561	MDM2	Q00987	491 aa	Predicted RBP	15.41	■□□□□ 0.06
MEIS2-215	ENST00000559561	GHRHR	Q02643	423 aa		15.41	■□□□□ 0.06
MEIS2-215	ENST00000559561	E2F4	Q16254	413 aa		15.41	■□□□□ 0.06
MEIS2-215	ENST00000559561	SAMD1	Q6SPF0	538 aa	Predicted RBP	15.41	■□□□□ 0.06
MEIS2-215	ENST00000559561	PDILT	Q8N807	584 aa		15.41	■□□□□ 0.06
MEIS2-215	ENST00000559561	DHX58	Q96C10	678 aa		15.41	■□□□□ 0.06
MEIS2-215	ENST00000559561	CCSER1	Q9C0I3	900 aa		15.41	■□□□□ 0.06
MEIS2-215	ENST00000559561	TMOD4	Q9NZQ9	345 aa		15.41	■□□□□ 0.06
MEIS2-215	ENST00000559561	DDX25	Q9UHL0	483 aa	Known RBP	15.41	■□□□□ 0.06
MEIS2-215	ENST00000559561	MYPN	Q86TC9	1320 aa		15.4	■□□□□ 0.06
MEIS2-215	ENST00000559561	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	15.4	■□□□□ 0.06
MEIS2-215	ENST00000559561	POLR2M	P0CAP2	368 aa		15.4	■□□□□ 0.06
MEIS2-215	ENST00000559561	PNOC	Q13519	176 aa		15.4	■□□□□ 0.06
MEIS2-215	ENST00000559561	POSTN	Q15063	836 aa		15.4	■□□□□ 0.06
MEIS2-215	ENST00000559561	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	15.4	■□□□□ 0.06
MEIS2-215	ENST00000559561	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		15.4	■□□□□ 0.06
MEIS2-215	ENST00000559561	IQUB	Q8NA54	791 aa		15.4	■□□□□ 0.06
MEIS2-215	ENST00000559561	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	15.4	■□□□□ 0.06
MEIS2-215	ENST00000559561	AGBL1	Q96MI9	1066 aa		15.4	■□□□□ 0.06
MEIS2-215	ENST00000559561	DNAJC25	Q9H1X3	360 aa		15.4	■□□□□ 0.06
MEIS2-215	ENST00000559561	VWA5A	O00534	786 aa		15.39	■□□□□ 0.05
MEIS2-215	ENST00000559561	ZBED4	O75132	1171 aa		15.39	■□□□□ 0.05
MEIS2-215	ENST00000559561	CFB	P00751	764 aa		15.39	■□□□□ 0.05
MEIS2-215	ENST00000559561	CYP3A4	P08684	503 aa		15.39	■□□□□ 0.05
MEIS2-215	ENST00000559561	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	15.39	■□□□□ 0.05
MEIS2-215	ENST00000559561	CIITA	P33076	1130 aa		15.39	■□□□□ 0.05
MEIS2-215	ENST00000559561	HSD17B4	P51659	736 aa		15.39	■□□□□ 0.05
MEIS2-215	ENST00000559561	NLRP12	P59046	1061 aa		15.39	■□□□□ 0.05
MEIS2-215	ENST00000559561	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	15.39	■□□□□ 0.05
MEIS2-215	ENST00000559561	TMEM266	Q2M3C6	531 aa		15.39	■□□□□ 0.05
MEIS2-215	ENST00000559561	SH3RF1	Q7Z6J0	888 aa		15.39	■□□□□ 0.05
MEIS2-215	ENST00000559561	CEP57L1	Q8IYX8	460 aa		15.39	■□□□□ 0.05
MEIS2-215	ENST00000559561	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		15.39	■□□□□ 0.05
MEIS2-215	ENST00000559561	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		15.39	■□□□□ 0.05
MEIS2-215	ENST00000559561	EHMT1	Q9H9B1	1298 aa		15.39	■□□□□ 0.05
MEIS2-215	ENST00000559561	DISC1	Q9NRI5	854 aa		15.39	■□□□□ 0.05
MEIS2-215	ENST00000559561	ADAMTS5	Q9UNA0	930 aa		15.39	■□□□□ 0.05
MEIS2-215	ENST00000559561	ZFP91-CNTF	A0A0A6YYC7	529 aa	Predicted RBP	15.38	■□□□□ 0.05
MEIS2-215	ENST00000559561	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		15.38	■□□□□ 0.05
MEIS2-215	ENST00000559561	FOXN1	O15353	648 aa		15.38	■□□□□ 0.05

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