RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557657.5

TMEM260-216, Transcript of transmembrane protein 260, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TMEM260, Length 2,572 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM260-216ENST00000557657 STIM1Q13586 685 aa23.75■■□□□ 1.39
TMEM260-216ENST00000557657 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa23.75■■□□□ 1.39
TMEM260-216ENST00000557657 WDR59Q6PJI9 974 aa23.75■■□□□ 1.39
TMEM260-216ENST00000557657 SLF2Q8IX21 1173 aa23.75■■□□□ 1.39
TMEM260-216ENST00000557657 ADGRF4Q8IZF3 695 aa23.75■■□□□ 1.39
TMEM260-216ENST00000557657 CCDC51Q96ER9 411 aa23.75■■□□□ 1.39
TMEM260-216ENST00000557657 CRAMP1Q96RY5 1269 aa23.75■■□□□ 1.39
TMEM260-216ENST00000557657 PARD6BQ9BYG5 372 aa23.75■■□□□ 1.39
TMEM260-216ENST00000557657 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa23.75■■□□□ 1.39
TMEM260-216ENST00000557657 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa23.75■■□□□ 1.39
TMEM260-216ENST00000557657 MYMKA6NI61 221 aa23.75■■□□□ 1.39
TMEM260-216ENST00000557657 P2RX5Q93086 422 aa23.75■■□□□ 1.39
TMEM260-216ENST00000557657 MTMR9Q96QG7 549 aa23.75■■□□□ 1.39
TMEM260-216ENST00000557657 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP23.74■■□□□ 1.39
TMEM260-216ENST00000557657 SHMT1P34896 483 aa23.74■■□□□ 1.39
TMEM260-216ENST00000557657 NT5C2P49902 561 aa23.74■■□□□ 1.39
TMEM260-216ENST00000557657 ADCY7P51828 1080 aa23.74■■□□□ 1.39
TMEM260-216ENST00000557657 TMCO3Q6UWJ1 677 aa23.74■■□□□ 1.39
TMEM260-216ENST00000557657 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
TMEM260-216ENST00000557657 AK8Q96MA6 479 aa23.74■■□□□ 1.39
TMEM260-216ENST00000557657 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
TMEM260-216ENST00000557657 SEMA6BQ9H3T3 888 aa23.74■■□□□ 1.39
TMEM260-216ENST00000557657 LRWD1Q9UFC0 647 aa23.74■■□□□ 1.39
TMEM260-216ENST00000557657 SASH3O75995 380 aa23.74■■□□□ 1.39
TMEM260-216ENST00000557657 ECM1Q16610 540 aa23.74■■□□□ 1.39
TMEM260-216ENST00000557657 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa23.74■■□□□ 1.39
TMEM260-216ENST00000557657 CERS3Q8IU89 383 aa23.74■■□□□ 1.39
TMEM260-216ENST00000557657 THAP9Q9H5L6 903 aa23.74■■□□□ 1.39
TMEM260-216ENST00000557657 SERPINB13Q9UIV8 391 aa23.74■■□□□ 1.39
TMEM260-216ENST00000557657 GUCA1BQ9UMX6 200 aa23.74■■□□□ 1.39
TMEM260-216ENST00000557657 USP17L10C9JJH3 530 aa23.73■■□□□ 1.39
TMEM260-216ENST00000557657 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
TMEM260-216ENST00000557657 PLA2G4AP47712 749 aa23.73■■□□□ 1.39
TMEM260-216ENST00000557657 TCP10Q12799 353 aa23.73■■□□□ 1.39
TMEM260-216ENST00000557657 C7orf25Q9BPX7 421 aa23.73■■□□□ 1.39
TMEM260-216ENST00000557657 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
TMEM260-216ENST00000557657 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
TMEM260-216ENST00000557657 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
TMEM260-216ENST00000557657 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa23.73■■□□□ 1.39
TMEM260-216ENST00000557657 NDUFA10O95299 355 aa23.73■■□□□ 1.39
TMEM260-216ENST00000557657 SP8Q8IXZ3 490 aa23.73■■□□□ 1.39
TMEM260-216ENST00000557657 DBNDD1Q9H9R9 158 aa23.73■■□□□ 1.39
TMEM260-216ENST00000557657 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa23.73■■□□□ 1.39
TMEM260-216ENST00000557657 CCNE1P24864 410 aa23.72■■□□□ 1.39
TMEM260-216ENST00000557657 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
TMEM260-216ENST00000557657 CCDC96Q2M329 555 aa23.72■■□□□ 1.39
TMEM260-216ENST00000557657 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
TMEM260-216ENST00000557657 LRRC41Q15345 812 aa23.72■■□□□ 1.39
TMEM260-216ENST00000557657 OR8K1Q8NGG5 319 aa23.72■■□□□ 1.39
TMEM260-216ENST00000557657 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
TMEM260-216ENST00000557657 ENC1O14682 589 aa23.71■■□□□ 1.39
TMEM260-216ENST00000557657 TTLL1O95922 423 aa23.71■■□□□ 1.39
TMEM260-216ENST00000557657 SNHG28P0DPA3 235 aa23.71■■□□□ 1.39
TMEM260-216ENST00000557657 ZNF543Q08ER8 600 aa23.71■■□□□ 1.39
TMEM260-216ENST00000557657 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa23.71■■□□□ 1.39
TMEM260-216ENST00000557657 CALML4Q96GE6 196 aa23.71■■□□□ 1.39
TMEM260-216ENST00000557657 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
TMEM260-216ENST00000557657 COA1Q9GZY4 146 aa23.71■■□□□ 1.39
TMEM260-216ENST00000557657 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
TMEM260-216ENST00000557657 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
TMEM260-216ENST00000557657 CHMP4BP1P59074 171 aa23.71■■□□□ 1.39
TMEM260-216ENST00000557657 MIIPQ5JXC2 388 aa23.71■■□□□ 1.39
TMEM260-216ENST00000557657 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
TMEM260-216ENST00000557657 MYL1P05976 194 aa23.7■■□□□ 1.38
TMEM260-216ENST00000557657 IDEP14735 1019 aa23.7■■□□□ 1.38
TMEM260-216ENST00000557657 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
TMEM260-216ENST00000557657 HSPA1LP34931 641 aa23.7■■□□□ 1.38
TMEM260-216ENST00000557657 SNAP25P60880 206 aa23.7■■□□□ 1.38
TMEM260-216ENST00000557657 HERVK_113P62684 666 aa23.7■■□□□ 1.38
TMEM260-216ENST00000557657 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
TMEM260-216ENST00000557657 GOLGA1Q92805 767 aa23.7■■□□□ 1.38
TMEM260-216ENST00000557657 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
TMEM260-216ENST00000557657 HDAC6Q9UBN7 1215 aa23.7■■□□□ 1.38
TMEM260-216ENST00000557657 CDC23Q9UJX2 597 aa23.7■■□□□ 1.38
TMEM260-216ENST00000557657 CTAGE9A4FU28 777 aa23.7■■□□□ 1.38
TMEM260-216ENST00000557657 SRGNP10124 158 aa23.7■■□□□ 1.38
TMEM260-216ENST00000557657 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
TMEM260-216ENST00000557657 TRIM14Q14142 442 aa23.7■■□□□ 1.38
TMEM260-216ENST00000557657 ASPRV1Q53RT3 343 aa23.7■■□□□ 1.38
TMEM260-216ENST00000557657 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
TMEM260-216ENST00000557657 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
TMEM260-216ENST00000557657 SNX29Q8TEQ0 813 aa23.7■■□□□ 1.38
TMEM260-216ENST00000557657 DNAJC18Q9H819 358 aa23.7■■□□□ 1.38
TMEM260-216ENST00000557657 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
TMEM260-216ENST00000557657 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
TMEM260-216ENST00000557657 CAPN11Q9UMQ6 739 aa23.7■■□□□ 1.38
TMEM260-216ENST00000557657 ESYT2A0FGR8 921 aa23.69■■□□□ 1.38
TMEM260-216ENST00000557657 USP17L15C9J2P7 530 aa23.69■■□□□ 1.38
TMEM260-216ENST00000557657 USP17L13C9JLJ4 530 aa23.69■■□□□ 1.38
TMEM260-216ENST00000557657 USP17L11C9JVI0 530 aa23.69■■□□□ 1.38
TMEM260-216ENST00000557657 USP17L18D6R9N7 530 aa23.69■■□□□ 1.38
TMEM260-216ENST00000557657 USP17L22D6RA61 530 aa23.69■■□□□ 1.38
TMEM260-216ENST00000557657 USP17L17D6RBQ6 530 aa23.69■■□□□ 1.38
TMEM260-216ENST00000557657 USP17L19D6RCP7 530 aa23.69■■□□□ 1.38
TMEM260-216ENST00000557657 USP17L20D6RJB6 530 aa23.69■■□□□ 1.38
TMEM260-216ENST00000557657 USP17L24Q0WX57 530 aa23.69■■□□□ 1.38
TMEM260-216ENST00000557657 MSL1Q68DK7 614 aa23.69■■□□□ 1.38
TMEM260-216ENST00000557657 USP17L6PQ6QN14 398 aa23.69■■□□□ 1.38
TMEM260-216ENST00000557657 SV2BQ7L1I2 683 aa23.69■■□□□ 1.38
TMEM260-216ENST00000557657 DNAJC7Q99615 494 aa23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 84 ms