RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555015.5

SRP54-AS1-202, Transcript of SRP54 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3

Gene SRP54-AS1, Length 561 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TINF2Q9BSI4 451 aa14.9□□□□□ -0.02
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa14.9□□□□□ -0.02
SRP54-AS1-202ENST00000555015 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa14.89□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 hCG_1984214I3L0E3 225 aa14.89□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 OPLAHO14841 1288 aa14.89□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CCL5P13501 91 aa14.89□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RPS6P62753 249 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CNTN2Q02246 1040 aa14.89□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TRIM32Q13049 653 aa14.89□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RABEP1Q15276 862 aa14.89□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 NTRK3Q16288 839 aa14.89□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SAMD3Q8N6K7 520 aa14.89□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 NRBP1Q9UHY1 535 aa14.89□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TPCN1Q9ULQ1 816 aa14.89□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RPTORQ8N122 1335 aa14.89□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa14.88□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PFKFB2O60825 505 aa14.88□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 IFNAR1P17181 557 aa14.88□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CALML3P27482 149 aa14.88□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CYP2C19P33261 490 aa14.88□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 HSD17B4P51659 736 aa14.88□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CCT2P78371 535 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MTFR1Q15390 333 aa14.88□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 UNC93B1Q9H1C4 597 aa14.88□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa14.87□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SOWAHBA6NEL2 793 aa14.87□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ASB14A6NK59 587 aa14.87□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CPLX1O14810 134 aa14.87□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MYCP01106 439 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CYBAP13498 195 aa14.87□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 STK3Q13188 491 aa14.87□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PPP1R18Q6NYC8 613 aa14.87□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 DNERQ8NFT8 737 aa14.87□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TMEM106CQ9BVX2 250 aa14.87□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP14.87□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RNF208Q9H0X6 261 aa14.87□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 V9GY48 417 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ASTN1O14525 1302 aa14.87□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CDKL5O76039 1030 aa14.86□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CFBP00751 764 aa14.86□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SCRN1Q12765 414 aa14.86□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 WWC2Q6AWC2 1192 aa14.86□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ARMCX2Q7L311 632 aa14.86□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa14.86□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TEX2Q8IWB9 1127 aa14.86□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MORC4Q8TE76 937 aa14.86□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TBC1D5Q92609 795 aa14.86□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP14.86□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PHKBQ93100 1093 aa14.86□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CNPY2Q9Y2B0 182 aa14.86□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 B4DLN1 442 aa14.85□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PIK3CDO00329 1044 aa14.85□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ST18O60284 1047 aa14.85□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 GJB1P08034 283 aa14.85□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 POLR2MP0CAP2 368 aa14.85□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SCG2P13521 617 aa14.85□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CAPN2P17655 700 aa14.85□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ME3Q16798 604 aa14.85□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TRIM22Q8IYM9 498 aa14.85□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TRPV1Q8NER1 839 aa14.85□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 GTF3C6Q969F1 213 aa14.85□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SLC26A6Q9BXS9 759 aa14.85□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa14.85□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 BARHL2Q9NY43 387 aa14.85□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 COL20A1Q9P218 1284 aa14.85□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa14.85□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 STXBP3O00186 592 aa14.84□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MSCO60682 206 aa14.84□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 NAPAP54920 295 aa14.84□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PKN1Q16512 942 aa14.84□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CUL5Q93034 780 aa14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.1 ms