RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554292.1

PCNX1-206, Transcript of pecanex 1, human

TSL 4

Gene PCNX1, Length 402 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PCNX1-206	ENST00000554292	DDX20	Q9UHI6	824 aa	Known RBP	32.9	■■■□□ 2.86
PCNX1-206	ENST00000554292	SOWAHB	A6NEL2	793 aa		32.89	■■■□□ 2.86
PCNX1-206	ENST00000554292	SEPT4	O43236	478 aa		32.89	■■■□□ 2.86
PCNX1-206	ENST00000554292	PPP1R11	O60927	126 aa	Predicted RBP	32.89	■■■□□ 2.86
PCNX1-206	ENST00000554292	METAP2	P50579	478 aa	Known RBP eCLIP	32.89	■■■□□ 2.86
PCNX1-206	ENST00000554292	PIBF1	Q8WXW3	757 aa		32.89	■■■□□ 2.86
PCNX1-206	ENST00000554292	CDKN2AIP	Q9NXV6	580 aa	Predicted RBP	32.89	■■■□□ 2.86
PCNX1-206	ENST00000554292	SEC24B	O95487	1268 aa		32.88	■■■□□ 2.85
PCNX1-206	ENST00000554292	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	32.88	■■■□□ 2.85
PCNX1-206	ENST00000554292	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		32.88	■■■□□ 2.85
PCNX1-206	ENST00000554292	ANKLE1	Q8NAG6	615 aa		32.88	■■■□□ 2.85
PCNX1-206	ENST00000554292	ABHD16B	Q9H3Z7	469 aa		32.88	■■■□□ 2.85
PCNX1-206	ENST00000554292	NID2	Q14112	1375 aa		32.87	■■■□□ 2.85
PCNX1-206	ENST00000554292		B4DLN1	442 aa		32.87	■■■□□ 2.85
PCNX1-206	ENST00000554292	MRPL12	P52815	198 aa	Known RBP	32.87	■■■□□ 2.85
PCNX1-206	ENST00000554292	PRAMEF19	Q5SWL8	479 aa		32.87	■■■□□ 2.85
PCNX1-206	ENST00000554292	DNER	Q8NFT8	737 aa		32.87	■■■□□ 2.85
PCNX1-206	ENST00000554292	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		32.87	■■■□□ 2.85
PCNX1-206	ENST00000554292	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	32.87	■■■□□ 2.85
PCNX1-206	ENST00000554292	SNAI1	O95863	264 aa	Predicted RBP	32.86	■■■□□ 2.85
PCNX1-206	ENST00000554292	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	32.86	■■■□□ 2.85
PCNX1-206	ENST00000554292	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	32.86	■■■□□ 2.85
PCNX1-206	ENST00000554292	IL17RA	Q96F46	866 aa		32.86	■■■□□ 2.85
PCNX1-206	ENST00000554292	ZHX1	Q9UKY1	873 aa	Predicted RBP	32.86	■■■□□ 2.85
PCNX1-206	ENST00000554292	OGDHL	Q9ULD0	1010 aa		32.86	■■■□□ 2.85
PCNX1-206	ENST00000554292	LRRC37A2	A6NM11	1700 aa		32.85	■■■□□ 2.85
PCNX1-206	ENST00000554292	EVC	P57679	992 aa		32.85	■■■□□ 2.85
PCNX1-206	ENST00000554292	LHX8	Q68G74	356 aa		32.85	■■■□□ 2.85
PCNX1-206	ENST00000554292	CCDC82	Q8N4S0	544 aa		32.85	■■■□□ 2.85
PCNX1-206	ENST00000554292	CNTNAP5	Q8WYK1	1306 aa		32.84	■■■□□ 2.85
PCNX1-206	ENST00000554292	FARP2	O94887	1054 aa	Predicted RBP	32.84	■■■□□ 2.85
PCNX1-206	ENST00000554292	CFB	P00751	764 aa		32.84	■■■□□ 2.85
PCNX1-206	ENST00000554292	ZNF865	P0CJ78	1059 aa	Predicted RBP	32.84	■■■□□ 2.85
PCNX1-206	ENST00000554292	AKR1A1	P14550	325 aa		32.84	■■■□□ 2.85
PCNX1-206	ENST00000554292	GHRHR	Q02643	423 aa		32.84	■■■□□ 2.85
PCNX1-206	ENST00000554292	ACVR2B	Q13705	512 aa		32.84	■■■□□ 2.85
PCNX1-206	ENST00000554292	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	32.84	■■■□□ 2.85
PCNX1-206	ENST00000554292	ASTN1	O14525	1302 aa		32.83	■■■□□ 2.85
PCNX1-206	ENST00000554292	MORC4	Q8TE76	937 aa		32.83	■■■□□ 2.85
PCNX1-206	ENST00000554292	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		32.83	■■■□□ 2.85
PCNX1-206	ENST00000554292	BRCA2	P51587	3418 aa		32.82	■■■□□ 2.84
PCNX1-206	ENST00000554292	HSD17B4	P51659	736 aa		32.82	■■■□□ 2.84
PCNX1-206	ENST00000554292	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	32.82	■■■□□ 2.84
PCNX1-206	ENST00000554292	PURB	Q96QR8	312 aa	Known RBP	32.82	■■■□□ 2.84
PCNX1-206	ENST00000554292	OPLAH	O14841	1288 aa		32.81	■■■□□ 2.84
PCNX1-206	ENST00000554292	RARB	P10826	455 aa		32.81	■■■□□ 2.84
PCNX1-206	ENST00000554292	CDC27	P30260	824 aa		32.81	■■■□□ 2.84
PCNX1-206	ENST00000554292	TBC1D5	Q92609	795 aa		32.81	■■■□□ 2.84
PCNX1-206	ENST00000554292	VTA1	Q9NP79	307 aa		32.81	■■■□□ 2.84
PCNX1-206	ENST00000554292	FAM217B	Q9NTX9	383 aa	Predicted RBP	32.81	■■■□□ 2.84
PCNX1-206	ENST00000554292	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	32.8	■■■□□ 2.84
PCNX1-206	ENST00000554292	POLR2M	P0CAP2	368 aa		32.8	■■■□□ 2.84
PCNX1-206	ENST00000554292	ANKRD1	Q15327	319 aa		32.8	■■■□□ 2.84
PCNX1-206	ENST00000554292	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	32.8	■■■□□ 2.84
PCNX1-206	ENST00000554292	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	32.8	■■■□□ 2.84
PCNX1-206	ENST00000554292	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	32.8	■■■□□ 2.84
PCNX1-206	ENST00000554292	RBM27	Q9P2N5	1060 aa	Known RBP	32.8	■■■□□ 2.84
PCNX1-206	ENST00000554292	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	32.79	■■■□□ 2.84
PCNX1-206	ENST00000554292	PDE4D	Q08499	809 aa		32.79	■■■□□ 2.84
PCNX1-206	ENST00000554292	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	32.79	■■■□□ 2.84
PCNX1-206	ENST00000554292	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		32.78	■■■□□ 2.84
PCNX1-206	ENST00000554292	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	32.78	■■■□□ 2.84
PCNX1-206	ENST00000554292	FUT2	Q10981	343 aa		32.78	■■■□□ 2.84
PCNX1-206	ENST00000554292	ZNF713	Q8N859	430 aa	Predicted RBP	32.78	■■■□□ 2.84
PCNX1-206	ENST00000554292	ARRDC4	Q8NCT1	418 aa		32.78	■■■□□ 2.84
PCNX1-206	ENST00000554292	RMDN3	Q96TC7	470 aa		32.78	■■■□□ 2.84
PCNX1-206	ENST00000554292	KATNBL1	Q9H079	304 aa		32.78	■■■□□ 2.84
PCNX1-206	ENST00000554292	PDE4DIP	Q5VU43	2346 aa		32.77	■■■□□ 2.84
PCNX1-206	ENST00000554292	EDNRB	P24530	442 aa		32.77	■■■□□ 2.84
PCNX1-206	ENST00000554292	CCDC144B	Q3MJ40	725 aa		32.77	■■■□□ 2.84
PCNX1-206	ENST00000554292	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		32.77	■■■□□ 2.84
PCNX1-206	ENST00000554292	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		32.77	■■■□□ 2.84
PCNX1-206	ENST00000554292	CUL5	Q93034	780 aa		32.77	■■■□□ 2.84
PCNX1-206	ENST00000554292	IWS1	Q96ST2	819 aa		32.77	■■■□□ 2.84
PCNX1-206	ENST00000554292	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		32.76	■■■□□ 2.83
PCNX1-206	ENST00000554292	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		32.76	■■■□□ 2.83
PCNX1-206	ENST00000554292	ANO1	Q5XXA6	986 aa		32.76	■■■□□ 2.83
PCNX1-206	ENST00000554292	NECAB2	Q7Z6G3	386 aa		32.76	■■■□□ 2.83
PCNX1-206	ENST00000554292	TAAR1	Q96RJ0	339 aa		32.76	■■■□□ 2.83
PCNX1-206	ENST00000554292	XPNPEP3	Q9NQH7	507 aa		32.76	■■■□□ 2.83
PCNX1-206	ENST00000554292	COL20A1	Q9P218	1284 aa		32.76	■■■□□ 2.83
PCNX1-206	ENST00000554292		V9GY48	417 aa	Predicted RBP	32.76	■■■□□ 2.83
PCNX1-206	ENST00000554292	FBXO16	Q8IX29	292 aa	Predicted RBP	32.75	■■■□□ 2.83
PCNX1-206	ENST00000554292	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	32.74	■■■□□ 2.83
PCNX1-206	ENST00000554292	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	32.74	■■■□□ 2.83
PCNX1-206	ENST00000554292	AKAP17A	Q02040	695 aa	Known RBP	32.74	■■■□□ 2.83
PCNX1-206	ENST00000554292	PPP1R18	Q6NYC8	613 aa		32.74	■■■□□ 2.83
PCNX1-206	ENST00000554292	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	32.74	■■■□□ 2.83
PCNX1-206	ENST00000554292	EEPD1	Q7L9B9	569 aa		32.74	■■■□□ 2.83
PCNX1-206	ENST00000554292	PXMP2	Q9NR77	195 aa		32.74	■■■□□ 2.83
PCNX1-206	ENST00000554292	KBTBD13	C9JR72	458 aa		32.73	■■■□□ 2.83
PCNX1-206	ENST00000554292	DNM1L	O00429	736 aa		32.73	■■■□□ 2.83
PCNX1-206	ENST00000554292	DUSP11	O75319	330 aa	Known RBP	32.73	■■■□□ 2.83
PCNX1-206	ENST00000554292	GPKOW	Q92917	476 aa	Predicted RBP eCLIP	32.73	■■■□□ 2.83
PCNX1-206	ENST00000554292	PAWR	Q96IZ0	340 aa	Known RBP	32.73	■■■□□ 2.83
PCNX1-206	ENST00000554292	HTATIP2	Q9BUP3	242 aa		32.73	■■■□□ 2.83
PCNX1-206	ENST00000554292	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		32.73	■■■□□ 2.83
PCNX1-206	ENST00000554292	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		32.73	■■■□□ 2.83
PCNX1-206	ENST00000554292	CPLX1	O14810	134 aa		32.72	■■■□□ 2.83
PCNX1-206	ENST00000554292	IFNAR1	P17181	557 aa		32.72	■■■□□ 2.83

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