RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539589.5

PACSIN3-211, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene PACSIN3, Length 2,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-211ENST00000539589 CCDC150Q8NCX0 1101 aa22.89■■□□□ 1.26
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF112Q9UJU3 913 aa22.89■■□□□ 1.26
PACSIN3-211ENST00000539589 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
PACSIN3-211ENST00000539589 GPR162Q16538 588 aa22.89■■□□□ 1.25
PACSIN3-211ENST00000539589 GOPCQ9HD26 462 aa22.89■■□□□ 1.25
PACSIN3-211ENST00000539589 PRPHP41219 470 aa22.88■■□□□ 1.25
PACSIN3-211ENST00000539589 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP22.88■■□□□ 1.25
PACSIN3-211ENST00000539589 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM83BQ5T0W9 1011 aa22.88■■□□□ 1.25
PACSIN3-211ENST00000539589 SYDE2Q5VT97 1194 aa22.88■■□□□ 1.25
PACSIN3-211ENST00000539589 PDXDC2PQ6P474 469 aa22.88■■□□□ 1.25
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF341Q9BYN7 854 aa22.88■■□□□ 1.25
PACSIN3-211ENST00000539589 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa22.88■■□□□ 1.25
PACSIN3-211ENST00000539589 PRIMPOLQ96LW4 560 aa22.87■■□□□ 1.25
PACSIN3-211ENST00000539589 TMEM60Q9H2L4 133 aa22.87■■□□□ 1.25
PACSIN3-211ENST00000539589 PHIPQ8WWQ0 1821 aa22.87■■□□□ 1.25
PACSIN3-211ENST00000539589 DCAF15Q66K64 600 aa22.87■■□□□ 1.25
PACSIN3-211ENST00000539589 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
PACSIN3-211ENST00000539589 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa22.87■■□□□ 1.25
PACSIN3-211ENST00000539589 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
PACSIN3-211ENST00000539589 CCZ1BP86790 482 aa22.86■■□□□ 1.25
PACSIN3-211ENST00000539589 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
PACSIN3-211ENST00000539589 NEK8Q86SG6 692 aa22.86■■□□□ 1.25
PACSIN3-211ENST00000539589 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
PACSIN3-211ENST00000539589 TMEM260Q9NX78 707 aa22.86■■□□□ 1.25
PACSIN3-211ENST00000539589 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
PACSIN3-211ENST00000539589 PRR12Q9ULL5 1215 aa22.86■■□□□ 1.25
PACSIN3-211ENST00000539589 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa22.86■■□□□ 1.25
PACSIN3-211ENST00000539589 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
PACSIN3-211ENST00000539589 CASP1P29466 404 aa22.86■■□□□ 1.25
PACSIN3-211ENST00000539589 PPP1R18Q6NYC8 613 aa22.86■■□□□ 1.25
PACSIN3-211ENST00000539589 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF18P17022 549 aa22.85■■□□□ 1.25
PACSIN3-211ENST00000539589 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP22.85■■□□□ 1.25
PACSIN3-211ENST00000539589 STAT6P42226 847 aa22.85■■□□□ 1.25
PACSIN3-211ENST00000539589 IKQ13123 557 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
PACSIN3-211ENST00000539589 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
PACSIN3-211ENST00000539589 DGKZQ13574 1117 aa22.85■■□□□ 1.25
PACSIN3-211ENST00000539589 LETM2Q2VYF4 491 aa22.85■■□□□ 1.25
PACSIN3-211ENST00000539589 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa22.85■■□□□ 1.25
PACSIN3-211ENST00000539589 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
PACSIN3-211ENST00000539589 SH2D4AQ9H788 454 aa22.85■■□□□ 1.25
PACSIN3-211ENST00000539589 DISC1Q9NRI5 854 aa22.85■■□□□ 1.25
PACSIN3-211ENST00000539589 GINM1Q9NU53 330 aa22.85■■□□□ 1.25
PACSIN3-211ENST00000539589 NRDCO43847 1150 aa22.84■■□□□ 1.25
PACSIN3-211ENST00000539589 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
PACSIN3-211ENST00000539589 UBA7P41226 1012 aa22.84■■□□□ 1.25
PACSIN3-211ENST00000539589 ADCY7P51828 1080 aa22.84■■□□□ 1.25
PACSIN3-211ENST00000539589 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
PACSIN3-211ENST00000539589 STAMQ92783 540 aa22.84■■□□□ 1.25
PACSIN3-211ENST00000539589 WRNIP1Q96S55 665 aa22.84■■□□□ 1.25
PACSIN3-211ENST00000539589 RIC8AQ9NPQ8 531 aa22.84■■□□□ 1.25
PACSIN3-211ENST00000539589 MYH7BA7E2Y1 1941 aa22.84■■□□□ 1.25
PACSIN3-211ENST00000539589 UQCRHLA0A096LP55 91 aa22.84■■□□□ 1.25
PACSIN3-211ENST00000539589 UQCRHP07919 91 aa22.84■■□□□ 1.25
PACSIN3-211ENST00000539589 OR52Z1P0C646 297 aa22.84■■□□□ 1.25
PACSIN3-211ENST00000539589 CDC25AP30304 524 aa22.84■■□□□ 1.25
PACSIN3-211ENST00000539589 STAT2P52630 851 aa22.84■■□□□ 1.25
PACSIN3-211ENST00000539589 KARSQ15046 597 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
PACSIN3-211ENST00000539589 DPY19L2Q6NUT2 758 aa22.84■■□□□ 1.25
PACSIN3-211ENST00000539589 RASSF8Q8NHQ8 419 aa22.84■■□□□ 1.25
PACSIN3-211ENST00000539589 AK8Q96MA6 479 aa22.84■■□□□ 1.25
PACSIN3-211ENST00000539589 CCSER1Q9C0I3 900 aa22.84■■□□□ 1.25
PACSIN3-211ENST00000539589 RRAGBQ5VZM2 374 aa22.83■■□□□ 1.25
PACSIN3-211ENST00000539589 ARMCX5Q6P1M9 558 aa22.83■■□□□ 1.25
PACSIN3-211ENST00000539589 VSTM4Q8IW00 320 aa22.83■■□□□ 1.25
PACSIN3-211ENST00000539589 SCYL3Q8IZE3 742 aa22.83■■□□□ 1.25
PACSIN3-211ENST00000539589 TBCKQ8TEA7 893 aa22.83■■□□□ 1.25
PACSIN3-211ENST00000539589 KLRG1Q96E93 195 aa22.83■■□□□ 1.25
PACSIN3-211ENST00000539589 MED15Q96RN5 788 aa22.83■■□□□ 1.25
PACSIN3-211ENST00000539589 RMND1Q9NWS8 449 aa22.83■■□□□ 1.25
PACSIN3-211ENST00000539589 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa22.83■■□□□ 1.25
PACSIN3-211ENST00000539589 ADM5C9JUS6 153 aa22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3-211ENST00000539589 EDIL3O43854 480 aa22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3-211ENST00000539589 CLK2P49760 499 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3-211ENST00000539589 UBE2SQ16763 222 aa22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3-211ENST00000539589 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3-211ENST00000539589 SPATA1Q5VX52 437 aa22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3-211ENST00000539589 HOOK2Q96ED9 719 aa22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3-211ENST00000539589 MTRQ99707 1265 aa22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3-211ENST00000539589 BLZF1Q9H2G9 400 aa22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3-211ENST00000539589 FBXO28Q9NVF7 368 aa22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3-211ENST00000539589 CD44P16070 742 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3-211ENST00000539589 CUL4BQ13620 913 aa22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3-211ENST00000539589 FEZ1Q99689 392 aa22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3-211ENST00000539589 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3-211ENST00000539589 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa22.81■■□□□ 1.24
PACSIN3-211ENST00000539589 KLHL10Q6JEL2 608 aa22.81■■□□□ 1.24
PACSIN3-211ENST00000539589 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa22.81■■□□□ 1.24
PACSIN3-211ENST00000539589 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa22.81■■□□□ 1.24
PACSIN3-211ENST00000539589 PLA2G6O60733 806 aa22.81■■□□□ 1.24
PACSIN3-211ENST00000539589 USP2O75604 605 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
PACSIN3-211ENST00000539589 PRKG1Q13976 671 aa22.81■■□□□ 1.24
PACSIN3-211ENST00000539589 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa22.81■■□□□ 1.24
PACSIN3-211ENST00000539589 FBXO11Q86XK2 927 aa22.81■■□□□ 1.24
PACSIN3-211ENST00000539589 AMNQ9BXJ7 453 aa22.81■■□□□ 1.24
PACSIN3-211ENST00000539589 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
PACSIN3-211ENST00000539589 OTOFQ9HC10 1997 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-211ENST00000539589 GLTPD2A6NH11 291 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-211ENST00000539589 PP2D1A8MPX8 630 aa22.8■■□□□ 1.24
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