RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531298.5

PACS1-211, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 4

Gene PACS1, Length 547 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-211ENST00000531298 STX10O60499 249 aa8.49□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 SERPINC1P01008 464 aa8.49□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 CYP3A4P08684 503 aa8.49□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 EEF2P13639 858 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 ATP2B1P20020 1258 aa8.49□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 FECHP22830 423 aa8.49□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 CHRNA5P30532 468 aa8.49□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 TNNI2P48788 182 aa8.49□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 CCZ1BP86790 482 aa8.49□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 TNFAIP1Q13829 316 aa8.49□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 NR1I3Q14994 352 aa8.49□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 TNIP1Q15025 636 aa8.49□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 DLGAP5Q15398 846 aa8.49□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 SYCP1Q15431 976 aa8.49□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 MSL1Q68DK7 614 aa8.49□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa8.49□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 SIAH1Q8IUQ4 282 aa8.49□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 NIM1KQ8IY84 436 aa8.49□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 CHURC1Q8WUH1 139 aa8.49□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 DPF2Q92785 391 aa8.49□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 FBXW7Q969H0 707 aa8.49□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 HOOK2Q96ED9 719 aa8.49□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 FAM20AQ96MK3 541 aa8.49□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 MTFR1LQ9H019 292 aa8.49□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 TMEM60Q9H2L4 133 aa8.49□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 THAP9Q9H5L6 903 aa8.49□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 PSTPIP2Q9H939 334 aa8.49□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 FANCLQ9NW38 375 aa8.49□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 CD2APQ9Y5K6 639 aa8.49□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 A0A1W2PQC6 194 aa8.48□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 F5H6K3 240 aa8.48□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 BIN1O00499 593 aa8.48□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 DYNC1I1O14576 645 aa8.48□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 PSMA7O14818 248 aa8.48□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 ARHGAP6O43182 974 aa8.48□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 C21orf2O43822 256 aa8.48□□□□□ -1.05
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PACS1-211ENST00000531298 RPN1P04843 607 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 ASNSP08243 561 aa8.48□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 GOLGA8HP0CJ92 632 aa8.48□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 BMP3P12645 472 aa8.48□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 SKILP12757 684 aa8.48□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 PBX1P40424 430 aa8.48□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 KLRC3Q07444 240 aa8.48□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 PAK1Q13153 545 aa8.48□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 CALCRLQ16602 461 aa8.48□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 CCDC144BQ3MJ40 725 aa8.48□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 Q4G0T1 1027 aa8.48□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 TMEM119Q4V9L6 283 aa8.48□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 SPECC1Q5M775 1068 aa8.48□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 CABP7Q86V35 215 aa8.48□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 FAM114A1Q8IWE2 563 aa8.48□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 ADSSL1Q8N142 457 aa8.48□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 LARGE2Q8N3Y3 721 aa8.48□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 PDILTQ8N807 584 aa8.48□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 SPC24Q8NBT2 197 aa8.48□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 MYRIPQ8NFW9 859 aa8.48□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 PANX2Q96RD6 677 aa8.48□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 CSRNP1Q96S65 589 aa8.48□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 MTRQ99707 1265 aa8.48□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 GOPCQ9HD26 462 aa8.48□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 KCNMB3Q9NPA1 279 aa8.48□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 KCNQ5Q9NR82 932 aa8.48□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 PGAP2Q9UHJ9 254 aa8.48□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP8.48□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa8.48□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa8.48□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 FOXN1O15353 648 aa8.47□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 KLRC4O43908 158 aa8.47□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 KIF20AO95235 890 aa8.47□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 NDUFB10O96000 172 aa8.47□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 POLD1P28340 1107 aa8.47□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 SREBF1P36956 1147 aa8.47□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP8.47□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 ARID5BQ14865 1188 aa8.47□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 CCDC96Q2M329 555 aa8.47□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 QRICH1Q2TAL8 776 aa8.47□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 LETM2Q2VYF4 491 aa8.47□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 SYDE2Q5VT97 1194 aa8.47□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 KRT79Q5XKE5 535 aa8.47□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 NYAP1Q6ZVC0 841 aa8.47□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 UNC13DQ70J99 1090 aa8.47□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 FBXO11Q86XK2 927 aa8.47□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 HOMER1Q86YM7 354 aa8.47□□□□□ -1.05
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