RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530978.1

RBM25-208, Transcript of RNA binding motif protein 25, human

TSL 2

Gene RBM25, Length 441 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM25-208	ENST00000530978	ADCY3	O60266	1144 aa		10.47	□□□□□ -0.73
RBM25-208	ENST00000530978	CDKL5	O76039	1030 aa		10.47	□□□□□ -0.73
RBM25-208	ENST00000530978	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
RBM25-208	ENST00000530978	GNRH1	P01148	92 aa		10.47	□□□□□ -0.73
RBM25-208	ENST00000530978	FDPS	P14324	419 aa	Known RBP	10.47	□□□□□ -0.73
RBM25-208	ENST00000530978	RPS6	P62753	249 aa	Known RBP	10.47	□□□□□ -0.73
RBM25-208	ENST00000530978	UBE2S	Q16763	222 aa		10.47	□□□□□ -0.73
RBM25-208	ENST00000530978	ZNF792	Q3KQV3	632 aa		10.47	□□□□□ -0.73
RBM25-208	ENST00000530978	TRIM22	Q8IYM9	498 aa		10.47	□□□□□ -0.73
RBM25-208	ENST00000530978	ABRA	Q8N0Z2	381 aa		10.47	□□□□□ -0.73
RBM25-208	ENST00000530978	FGD4	Q96M96	766 aa		10.47	□□□□□ -0.73
RBM25-208	ENST00000530978	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
RBM25-208	ENST00000530978	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		10.47	□□□□□ -0.73
RBM25-208	ENST00000530978	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
RBM25-208	ENST00000530978	ASTN1	O14525	1302 aa		10.47	□□□□□ -0.73
RBM25-208	ENST00000530978	DEXI	O95424	95 aa		10.46	□□□□□ -0.73
RBM25-208	ENST00000530978	CYP2C19	P33261	490 aa		10.46	□□□□□ -0.73
RBM25-208	ENST00000530978	PRMT2	P55345	433 aa		10.46	□□□□□ -0.73
RBM25-208	ENST00000530978	UBXN2A	P68543	259 aa		10.46	□□□□□ -0.73
RBM25-208	ENST00000530978	IRF5	Q13568	498 aa		10.46	□□□□□ -0.73
RBM25-208	ENST00000530978	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	10.46	□□□□□ -0.73
RBM25-208	ENST00000530978	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		10.46	□□□□□ -0.73
RBM25-208	ENST00000530978	DHX30	Q7L2E3	1194 aa	Known RBP eCLIP	10.46	□□□□□ -0.73
RBM25-208	ENST00000530978	FCHSD1	Q86WN1	690 aa		10.46	□□□□□ -0.73
RBM25-208	ENST00000530978	FAM133A	Q8N9E0	248 aa		10.46	□□□□□ -0.73
RBM25-208	ENST00000530978	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	10.46	□□□□□ -0.73
RBM25-208	ENST00000530978	MAML3	Q96JK9	1138 aa		10.46	□□□□□ -0.73
RBM25-208	ENST00000530978	PGBD1	Q96JS3	809 aa		10.46	□□□□□ -0.73
RBM25-208	ENST00000530978	TAAR1	Q96RJ0	339 aa		10.46	□□□□□ -0.73
RBM25-208	ENST00000530978	FOXD4L1	Q9NU39	408 aa		10.46	□□□□□ -0.73
RBM25-208	ENST00000530978	TMEM260	Q9NX78	707 aa		10.46	□□□□□ -0.73
RBM25-208	ENST00000530978	BARHL2	Q9NY43	387 aa		10.46	□□□□□ -0.73
RBM25-208	ENST00000530978	PNMA2	Q9UL42	364 aa		10.46	□□□□□ -0.73
RBM25-208	ENST00000530978	PFAS	O15067	1338 aa		10.46	□□□□□ -0.73
RBM25-208	ENST00000530978	STK36	Q9NRP7	1315 aa		10.46	□□□□□ -0.73
RBM25-208	ENST00000530978	MCM3AP	O60318	1980 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	SMCO2	A6NFE2	343 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	10.45	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	POLR2M	P0CAP2	368 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	GRK4	P32298	578 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	MCM2	P49736	904 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	HSD17B4	P51659	736 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	ADCY7	P51828	1080 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	ZFP91	Q96JP5	570 aa	Predicted RBP	10.45	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	ALG1	Q9BT22	464 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	RBM27	Q9P2N5	1060 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	BIN2	Q9UBW5	565 aa	Predicted RBP	10.45	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978		K7ELQ4	463 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	MEIS2	O14770	477 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	INHA	P05111	366 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	HOXC6	P09630	235 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	XRCC5	P13010	732 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	NLRP5	P59047	1200 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	GUCY1B3	Q02153	619 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	TRAF1	Q13077	416 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	PRAMEF19	Q5SWL8	479 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	PPP1R18	Q6NYC8	613 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	EEPD1	Q7L9B9	569 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	ZNF713	Q8N859	430 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	SLAIN1	Q8ND83	568 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	SLC5A4	Q9NY91	659 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	HMGCR	P04035	888 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	GHRHR	Q02643	423 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	CACNB2	Q08289	660 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	MTFR1	Q15390	333 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	ARMCX2	Q7L311	632 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	HSCB	Q8IWL3	235 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	SPRYD3	Q8NCJ5	442 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	RGS22	Q8NE09	1264 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	TRPV1	Q8NER1	839 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	CCDC148	Q8NFR7	591 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	IL31RA	Q8NI17	732 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	PXYLP1	Q8TE99	480 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	CUL5	Q93034	780 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	SNX21	Q969T3	373 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	LLPH	Q9BRT6	129 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	RIC8A	Q9NPQ8	531 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	PXMP2	Q9NR77	195 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	SNAI1	O95863	264 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	PRKAR2A	P13861	404 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	GJB2	P29033	226 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	CCND3	P30281	292 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	CUL4A	Q13619	759 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	NPY5R	Q15761	445 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	MFSD14C	Q5VZR4	134 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	OLFML2B	Q68BL8	750 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM25-208	ENST00000530978	FBXO16	Q8IX29	292 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74

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