RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518877.1

PCM1-208, Transcript of pericentriolar material 1, human

TSL 3

Gene PCM1, Length 316 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PCM1-208	ENST00000518877	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PCM1-208	ENST00000518877	TSPAN17	Q96FV3	270 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PCM1-208	ENST00000518877	NOX5	Q96PH1	765 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PCM1-208	ENST00000518877	NOL6	Q9H6R4	1146 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
PCM1-208	ENST00000518877	GP6	Q9HCN6	339 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PCM1-208	ENST00000518877	TP53	P04637	393 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
PCM1-208	ENST00000518877	ACR	P10323	421 aa		5	□□□□□ -1.61
PCM1-208	ENST00000518877	ITGA4	P13612	1032 aa		5	□□□□□ -1.61
PCM1-208	ENST00000518877	ZNF20	P17024	532 aa		5	□□□□□ -1.61
PCM1-208	ENST00000518877	SMAD4	Q13485	552 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
PCM1-208	ENST00000518877	ADAMTS17	Q8TE56	1095 aa		5	□□□□□ -1.61
PCM1-208	ENST00000518877	PEX11G	Q96HA9	241 aa		5	□□□□□ -1.61
PCM1-208	ENST00000518877	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		5	□□□□□ -1.61
PCM1-208	ENST00000518877	SAMD11	Q96NU1	681 aa		5	□□□□□ -1.61
PCM1-208	ENST00000518877	RBM15	Q96T37	977 aa	Known RBP eCLIP	5	□□□□□ -1.61
PCM1-208	ENST00000518877	SPATA6	Q9NWH7	488 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
PCM1-208	ENST00000518877	RWDD3	Q9Y3V2	267 aa		5	□□□□□ -1.61
PCM1-208	ENST00000518877	FHOD1	Q9Y613	1164 aa		5	□□□□□ -1.61
PCM1-208	ENST00000518877	PLAT	P00750	562 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PCM1-208	ENST00000518877	CD247	P20963	164 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PCM1-208	ENST00000518877	CACNB2	Q08289	660 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PCM1-208	ENST00000518877	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PCM1-208	ENST00000518877	ANKRD39	Q53RE8	183 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PCM1-208	ENST00000518877	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PCM1-208	ENST00000518877	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PCM1-208	ENST00000518877	PPFIBP1	Q86W92	1011 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PCM1-208	ENST00000518877	SLITRK4	Q8IW52	837 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PCM1-208	ENST00000518877	TTC9B	Q8N6N2	239 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PCM1-208	ENST00000518877	DDX11	Q96FC9	970 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PCM1-208	ENST00000518877	ZNF536	O15090	1300 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PCM1-208	ENST00000518877	C1QTNF3-AMACR	E9PGA6	284 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PCM1-208	ENST00000518877	C6	P13671	934 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PCM1-208	ENST00000518877	HMGA2	P52926	109 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PCM1-208	ENST00000518877	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PCM1-208	ENST00000518877	MRPL58	Q14197	206 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PCM1-208	ENST00000518877	PPP2R5D	Q14738	602 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PCM1-208	ENST00000518877	SLC9A5	Q14940	896 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PCM1-208	ENST00000518877	RGL3	Q3MIN7	710 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PCM1-208	ENST00000518877	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PCM1-208	ENST00000518877	LZTR1	Q8N653	840 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PCM1-208	ENST00000518877	NETO2	Q8NC67	525 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PCM1-208	ENST00000518877	USP33	Q8TEY7	942 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PCM1-208	ENST00000518877	SORCS2	Q96PQ0	1159 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PCM1-208	ENST00000518877	NT5C1A	Q9BXI3	368 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PCM1-208	ENST00000518877	C1QTNF3	Q9BXJ4	246 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PCM1-208	ENST00000518877	ZNF451	Q9Y4E5	1061 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PCM1-208	ENST00000518877	ZBTB7A	O95365	584 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCM1-208	ENST00000518877	CYP2C8	P10632	490 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCM1-208	ENST00000518877	GDF5	P43026	501 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCM1-208	ENST00000518877	CCDC27	Q2M243	656 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCM1-208	ENST00000518877	FBXW10	Q5XX13	1052 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCM1-208	ENST00000518877	BORA	Q6PGQ7	559 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCM1-208	ENST00000518877	GLB1L	Q6UWU2	654 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCM1-208	ENST00000518877	FAM124A	Q86V42	546 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCM1-208	ENST00000518877	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCM1-208	ENST00000518877	LGI4	Q8N135	537 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCM1-208	ENST00000518877	CPA5	Q8WXQ8	436 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCM1-208	ENST00000518877	RNF34	Q969K3	372 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCM1-208	ENST00000518877	FERD3L	Q96RJ6	166 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCM1-208	ENST00000518877	KRTAP3-1	Q9BYR8	98 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCM1-208	ENST00000518877	ST6GALNAC2	Q9UJ37	374 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCM1-208	ENST00000518877	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCM1-208	ENST00000518877	INVS	Q9Y283	1065 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCM1-208	ENST00000518877	OVOL3	O00110	214 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCM1-208	ENST00000518877	IMPDH2	P12268	514 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCM1-208	ENST00000518877	TCEAL1	Q15170	157 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCM1-208	ENST00000518877	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCM1-208	ENST00000518877	EEF1DP3	Q658K8	133 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCM1-208	ENST00000518877	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCM1-208	ENST00000518877	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PCM1-208	ENST00000518877	DVL3	Q92997	716 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PCM1-208	ENST00000518877	TM9SF2	Q99805	663 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCM1-208	ENST00000518877	SPON2	Q9BUD6	331 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCM1-208	ENST00000518877	SCAND2P	Q9GZW5	306 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PCM1-208	ENST00000518877	GZF1	Q9H116	711 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PCM1-208	ENST00000518877	GULP1	Q9UBP9	304 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCM1-208	ENST00000518877	DIS3	Q9Y2L1	958 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PCM1-208	ENST00000518877	MROH6	A6NGR9	719 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PCM1-208	ENST00000518877	STXBP3	O00186	592 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PCM1-208	ENST00000518877	TACR2	P21452	398 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PCM1-208	ENST00000518877	SEPHS1	P49903	392 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PCM1-208	ENST00000518877	DPY19L1	Q2PZI1	675 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PCM1-208	ENST00000518877	MCTP2	Q6DN12	878 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PCM1-208	ENST00000518877	CPNE8	Q86YQ8	564 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PCM1-208	ENST00000518877	ADCY4	Q8NFM4	1077 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PCM1-208	ENST00000518877	KISS1R	Q969F8	398 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PCM1-208	ENST00000518877	MRI	Q9BWK5	157 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PCM1-208	ENST00000518877	FBLN5	Q9UBX5	448 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PCM1-208	ENST00000518877	RPL13	P26373	211 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PCM1-208	ENST00000518877	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PCM1-208	ENST00000518877	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PCM1-208	ENST00000518877	UNC5A	Q6ZN44	842 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PCM1-208	ENST00000518877	LIMS2	Q7Z4I7	341 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PCM1-208	ENST00000518877	SPRED1	Q7Z699	444 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PCM1-208	ENST00000518877	TAB3	Q8N5C8	712 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PCM1-208	ENST00000518877	LINC00482	Q8N8I6	264 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PCM1-208	ENST00000518877	GORASP1	Q9BQQ3	440 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PCM1-208	ENST00000518877	C11orf84	Q9BUA3	381 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PCM1-208	ENST00000518877	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PCM1-208	ENST00000518877	KRTAP9-8	Q9BYQ0	159 aa		4.94	□□□□□ -1.62

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