RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516721.1

RNU6-965P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 965, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-965P, Length 96 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-965P-201ENST00000516721 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
RNU6-965P-201ENST00000516721 SLC12A9Q9BXP2 914 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-965P-201ENST00000516721 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
RNU6-965P-201ENST00000516721 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
RNU6-965P-201ENST00000516721 IFT22Q9H7X7 185 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-965P-201ENST00000516721 SLC52A2Q9HAB3 445 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-965P-201ENST00000516721 LGR6Q9HBX8 967 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-965P-201ENST00000516721 PIM2Q9P1W9 311 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-965P-201ENST00000516721 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-965P-201ENST00000516721 DUSP13Q9UII6 198 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-965P-201ENST00000516721 VAV3Q9UKW4 847 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-965P-201ENST00000516721 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-965P-201ENST00000516721 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-965P-201ENST00000516721 A0A1W2PQY0 241 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-965P-201ENST00000516721 HMX2A2RU54 273 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-965P-201ENST00000516721 STXBP3O00186 592 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-965P-201ENST00000516721 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-965P-201ENST00000516721 CYP26A1O43174 497 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-965P-201ENST00000516721 VAMP4O75379 141 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-965P-201ENST00000516721 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-965P-201ENST00000516721 THBDP07204 575 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-965P-201ENST00000516721 SYPP08247 313 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-965P-201ENST00000516721 FOSL1P15407 271 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-965P-201ENST00000516721 FSTP19883 344 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-965P-201ENST00000516721 LORP23490 312 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-965P-201ENST00000516721 GRIA2P42262 883 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-965P-201ENST00000516721 RPL11P62913 178 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-965P-201ENST00000516721 ST5P78524 1137 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-965P-201ENST00000516721 PRKCQQ04759 706 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-965P-201ENST00000516721 CHRNEQ04844 493 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-965P-201ENST00000516721 KCNMA1Q12791 1236 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-965P-201ENST00000516721 LSAMPQ13449 338 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-965P-201ENST00000516721 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-965P-201ENST00000516721 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-965P-201ENST00000516721 DPY19L1Q2PZI1 675 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-965P-201ENST00000516721 PLEKHG6Q3KR16 790 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-965P-201ENST00000516721 CRTC3Q6UUV7 619 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-965P-201ENST00000516721 C16orf59Q7L2K0 433 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-965P-201ENST00000516721 SPPL2CQ8IUH8 684 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-965P-201ENST00000516721 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-965P-201ENST00000516721 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-965P-201ENST00000516721 FBXL6Q8N531 539 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-965P-201ENST00000516721 KREMEN2Q8NCW0 462 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-965P-201ENST00000516721 NLGN2Q8NFZ4 835 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-965P-201ENST00000516721 SLC7A14Q8TBB6 771 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-965P-201ENST00000516721 WDR66Q8TBY9 1149 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-965P-201ENST00000516721 FBXW5Q969U6 566 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-965P-201ENST00000516721 MFSD14AQ96MC6 490 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-965P-201ENST00000516721 PTCHD1Q96NR3 888 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-965P-201ENST00000516721 CLUHP3Q96NS8 147 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-965P-201ENST00000516721 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-965P-201ENST00000516721 CAMKK2Q96RR4 588 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-965P-201ENST00000516721 MENTQ9BUN1 341 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-965P-201ENST00000516721 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-965P-201ENST00000516721 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-965P-201ENST00000516721 FAM170BA6NMN3 283 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-965P-201ENST00000516721 WDR64B1ANS9 1081 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-965P-201ENST00000516721 TBX1O43435 398 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-965P-201ENST00000516721 MARCH6O60337 910 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-965P-201ENST00000516721 LRRN2O75325 713 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-965P-201ENST00000516721 CRTAMO95727 393 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-965P-201ENST00000516721 IGHA1P01876 353 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-965P-201ENST00000516721 F13BP05160 661 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-965P-201ENST00000516721 GSTM1P09488 218 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-965P-201ENST00000516721 JMJD7P0C870 316 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-965P-201ENST00000516721 PLS3P13797 630 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-965P-201ENST00000516721 CTSKP43235 329 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-965P-201ENST00000516721 CHRNA4P43681 627 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-965P-201ENST00000516721 SPIRE1Q08AE8 756 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-965P-201ENST00000516721 NTRK3Q16288 839 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-965P-201ENST00000516721 CRY1Q16526 586 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-965P-201ENST00000516721 NKPD1Q17RQ9 610 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-965P-201ENST00000516721 ODR4Q5SWX8 454 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-965P-201ENST00000516721 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
RNU6-965P-201ENST00000516721 CYP4F22Q6NT55 531 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-965P-201ENST00000516721 EP400NLQ6ZTU2 488 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-965P-201ENST00000516721 CABP7Q86V35 215 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-965P-201ENST00000516721 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP3.04□□□□□ -1.92
RNU6-965P-201ENST00000516721 JAMLQ86YT9 394 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-965P-201ENST00000516721 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
RNU6-965P-201ENST00000516721 SPACA3Q8IXA5 215 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-965P-201ENST00000516721 ZZZ3Q8IYH5 903 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-965P-201ENST00000516721 NLGN4XQ8N0W4 816 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-965P-201ENST00000516721 Q8N1Y9 231 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-965P-201ENST00000516721 USHBP1Q8N6Y0 703 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-965P-201ENST00000516721 FRS2Q8WU20 508 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-965P-201ENST00000516721 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
RNU6-965P-201ENST00000516721 UBE2FQ969M7 185 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-965P-201ENST00000516721 CDADC1Q9BWV3 514 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-965P-201ENST00000516721 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
RNU6-965P-201ENST00000516721 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP3.04□□□□□ -1.92
RNU6-965P-201ENST00000516721 SAMD15Q9P1V8 674 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-965P-201ENST00000516721 ZSWIM5Q9P217 1185 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-965P-201ENST00000516721 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
RNU6-965P-201ENST00000516721 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
RNU6-965P-201ENST00000516721 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
RNU6-965P-201ENST00000516721 H3BS24 57 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-965P-201ENST00000516721 CBX4O00257 560 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-965P-201ENST00000516721 MEIS1O00470 390 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-965P-201ENST00000516721 KRIT1O00522 736 aa3.03□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.6 ms