RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514267.1

CALCOCO2-223, Transcript of calcium binding and coiled-coil domain 2, human

TSL 2

Gene CALCOCO2, Length 336 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CALCOCO2-223	ENST00000514267	PAQR3	Q6TCH7	311 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-223	ENST00000514267	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-223	ENST00000514267	CILP2	Q8IUL8	1156 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-223	ENST00000514267	ARHGEF39	Q8N4T4	335 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-223	ENST00000514267	DEPDC7	Q96QD5	511 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-223	ENST00000514267	APBA2	Q99767	749 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-223	ENST00000514267	TNFRSF12A	Q9NP84	129 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-223	ENST00000514267	NUDT5	Q9UKK9	219 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-223	ENST00000514267	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-223	ENST00000514267	MSRB2	Q9Y3D2	182 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-223	ENST00000514267	BACE2	Q9Y5Z0	518 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-223	ENST00000514267	MYOCOS	A0A1B0GUC4	107 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-223	ENST00000514267	N4BP3	O15049	544 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-223	ENST00000514267	SMAD7	O15105	426 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-223	ENST00000514267	KRT1	P04264	644 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-223	ENST00000514267	RASA3	Q14644	834 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-223	ENST00000514267	ZC3H14	Q6PJT7	736 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-223	ENST00000514267	SPOCD1	Q6ZMY3	1216 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-223	ENST00000514267	ZNF662	Q6ZS27	426 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-223	ENST00000514267	HNRNPLL	Q8WVV9	542 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-223	ENST00000514267	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-223	ENST00000514267	RNF38	Q9H0F5	515 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-223	ENST00000514267	SNTG2	Q9NY99	539 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-223	ENST00000514267	IMPACT	Q9P2X3	320 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-223	ENST00000514267	CGGBP1	Q9UFW8	167 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-223	ENST00000514267	MRPL42	Q9Y6G3	142 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-223	ENST00000514267	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-223	ENST00000514267	AURKA	O14965	403 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-223	ENST00000514267	EPHX1	P07099	455 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-223	ENST00000514267	VIPR1	P32241	457 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-223	ENST00000514267	CAP1	Q01518	475 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-223	ENST00000514267	IQCE	Q6IPM2	695 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-223	ENST00000514267	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-223	ENST00000514267	BRF1	Q92994	677 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-223	ENST00000514267	RNPC3	Q96LT9	517 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-223	ENST00000514267	FCRL3	Q96P31	734 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-223	ENST00000514267	JMJD8	Q96S16	334 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-223	ENST00000514267	PLCD4	Q9BRC7	762 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-223	ENST00000514267	BRINP2	Q9C0B6	783 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-223	ENST00000514267	EPN3	Q9H201	632 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-223	ENST00000514267	ACTR10	Q9NZ32	417 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-223	ENST00000514267	MBD1	Q9UIS9	605 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-223	ENST00000514267	WDR3	Q9UNX4	943 aa	Known RBP eCLIP	4.94	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-223	ENST00000514267	KCTD3	Q9Y597	815 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-223	ENST00000514267	PAM	P19021	973 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-223	ENST00000514267	RASGRF1	Q13972	1273 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-223	ENST00000514267	PPP2R5D	Q14738	602 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-223	ENST00000514267	SLC9A5	Q14940	896 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-223	ENST00000514267	FXN	Q16595	210 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-223	ENST00000514267	DDR2	Q16832	855 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-223	ENST00000514267	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-223	ENST00000514267	RNF187	Q5TA31	235 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-223	ENST00000514267	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-223	ENST00000514267	BICRAL	Q6AI39	1079 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-223	ENST00000514267	KIAA1211L	Q6NV74	962 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-223	ENST00000514267	ZPBP2	Q6X784	338 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-223	ENST00000514267	TMC6	Q7Z403	805 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-223	ENST00000514267	C1QL4	Q86Z23	238 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-223	ENST00000514267	FAM169B	Q8N8A8	192 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-223	ENST00000514267	NETO2	Q8NC67	525 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-223	ENST00000514267	BVES	Q8NE79	360 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-223	ENST00000514267	MZB1	Q8WU39	189 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-223	ENST00000514267	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-223	ENST00000514267	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-223	ENST00000514267	PCDH18	Q9HCL0	1135 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-223	ENST00000514267	KLHL14	Q9P2G3	628 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-223	ENST00000514267	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-223	ENST00000514267	AKT3	Q9Y243	479 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-223	ENST00000514267	C2orf71	A6NGG8	1288 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-223	ENST00000514267	AGRP	O00253	132 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-223	ENST00000514267	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-223	ENST00000514267	NPHS1	O60500	1241 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-223	ENST00000514267	ZBTB7A	O95365	584 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-223	ENST00000514267	IFRD2	Q12894	506 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-223	ENST00000514267	SP8	Q8IXZ3	490 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-223	ENST00000514267	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-223	ENST00000514267	KLHL6	Q8WZ60	621 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-223	ENST00000514267	ZNF669	Q96BR6	464 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-223	ENST00000514267	PEX11G	Q96HA9	241 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-223	ENST00000514267	CCDC140	Q96MF4	163 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-223	ENST00000514267	FAM86C1	Q9NVL1	165 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-223	ENST00000514267	DBR1	Q9UK59	544 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-223	ENST00000514267	NPHP3-ACAD11	A0A0J9YXS1	232 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-223	ENST00000514267	FAM221B	A6H8Z2	402 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-223	ENST00000514267	NUDT19	A8MXV4	375 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-223	ENST00000514267	PDPK1	O15530	556 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-223	ENST00000514267	IFNGR1	P15260	489 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-223	ENST00000514267	GTF2A2	P52657	109 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-223	ENST00000514267	MVK	Q03426	396 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-223	ENST00000514267	PLEKHN1	Q494U1	663 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-223	ENST00000514267	E4F1	Q66K89	784 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-223	ENST00000514267	RPTN	Q6XPR3	784 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-223	ENST00000514267	LZTR1	Q8N653	840 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-223	ENST00000514267	CELF2-AS1	Q8N7Q2	184 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-223	ENST00000514267	TMEM52	Q8NDY8	209 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-223	ENST00000514267	ADCY4	Q8NFM4	1077 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-223	ENST00000514267	TSPAN17	Q96FV3	270 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-223	ENST00000514267	GCM1	Q9NP62	436 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-223	ENST00000514267	IGF2BP1	Q9NZI8	577 aa	Known RBP eCLIP	4.91	□□□□□ -1.62
CALCOCO2-223	ENST00000514267	EMC9	Q9Y3B6	208 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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