RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510193.1

SH3BP2-216, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 407 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-216ENST00000510193 CNNM2Q9H8M5 875 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP2-216ENST00000510193 SENP2Q9HC62 589 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP2-216ENST00000510193 COL20A1Q9P218 1284 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP2-216ENST00000510193 GRIN2DO15399 1336 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP2-216ENST00000510193 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa14.86□□□□□ -0.03
SH3BP2-216ENST00000510193 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
SH3BP2-216ENST00000510193 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
SH3BP2-216ENST00000510193 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
SH3BP2-216ENST00000510193 QRICH1Q2TAL8 776 aa14.86□□□□□ -0.03
SH3BP2-216ENST00000510193 IQSEC1Q6DN90 963 aa14.86□□□□□ -0.03
SH3BP2-216ENST00000510193 CXCL17Q6UXB2 119 aa14.86□□□□□ -0.03
SH3BP2-216ENST00000510193 FAM126BQ8IXS8 530 aa14.86□□□□□ -0.03
SH3BP2-216ENST00000510193 SLC43A3Q8NBI5 491 aa14.86□□□□□ -0.03
SH3BP2-216ENST00000510193 JMJD4Q9H9V9 463 aa14.86□□□□□ -0.03
SH3BP2-216ENST00000510193 SPC25Q9HBM1 224 aa14.86□□□□□ -0.03
SH3BP2-216ENST00000510193 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
SH3BP2-216ENST00000510193 PNMA2Q9UL42 364 aa14.86□□□□□ -0.03
SH3BP2-216ENST00000510193 ARVCFO00192 962 aa14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2-216ENST00000510193 OPLAHO14841 1288 aa14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2-216ENST00000510193 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2-216ENST00000510193 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2-216ENST00000510193 ANTXR2P58335 489 aa14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2-216ENST00000510193 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2-216ENST00000510193 DUSP28Q4G0W2 176 aa14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2-216ENST00000510193 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2-216ENST00000510193 SKAP1Q86WV1 359 aa14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2-216ENST00000510193 MTMR8Q96EF0 704 aa14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2-216ENST00000510193 UBAC1Q9BSL1 405 aa14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2-216ENST00000510193 TMEM39AQ9NV64 488 aa14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2-216ENST00000510193 MAD2L2Q9UI95 211 aa14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2-216ENST00000510193 Q9Y3F1 56 aa14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2-216ENST00000510193 DCDC2CA8MYV0 355 aa14.84□□□□□ -0.03
SH3BP2-216ENST00000510193 E7EWF7 191 aa14.84□□□□□ -0.03
SH3BP2-216ENST00000510193 CD4P01730 458 aa14.84□□□□□ -0.03
SH3BP2-216ENST00000510193 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
SH3BP2-216ENST00000510193 RAG1P15918 1043 aa14.84□□□□□ -0.03
SH3BP2-216ENST00000510193 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
SH3BP2-216ENST00000510193 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa14.84□□□□□ -0.03
SH3BP2-216ENST00000510193 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
SH3BP2-216ENST00000510193 DEFB123Q8N688 67 aa14.84□□□□□ -0.03
SH3BP2-216ENST00000510193 RGS22Q8NE09 1264 aa14.84□□□□□ -0.03
SH3BP2-216ENST00000510193 DNERQ8NFT8 737 aa14.84□□□□□ -0.03
SH3BP2-216ENST00000510193 RUFY2Q8WXA3 655 aa14.84□□□□□ -0.03
SH3BP2-216ENST00000510193 MAP4K1Q92918 833 aa14.84□□□□□ -0.03
SH3BP2-216ENST00000510193 MTMR10Q9NXD2 777 aa14.84□□□□□ -0.03
SH3BP2-216ENST00000510193 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
SH3BP2-216ENST00000510193 ABCB11O95342 1321 aa14.84□□□□□ -0.03
SH3BP2-216ENST00000510193 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
SH3BP2-216ENST00000510193 ARIH2O95376 493 aa14.83□□□□□ -0.04
SH3BP2-216ENST00000510193 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
SH3BP2-216ENST00000510193 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
SH3BP2-216ENST00000510193 WDR11Q9BZH6 1224 aa14.83□□□□□ -0.04
SH3BP2-216ENST00000510193 MROH7Q68CQ1 1323 aa14.83□□□□□ -0.04
SH3BP2-216ENST00000510193 MYH6P13533 1939 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP2-216ENST00000510193 TIMP1P01033 207 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP2-216ENST00000510193 PSMC6P62333 389 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP2-216ENST00000510193 GHRHRQ02643 423 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP2-216ENST00000510193 FPGSQ05932 587 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP2-216ENST00000510193 GRM4Q14833 912 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP2-216ENST00000510193 CHST3Q7LGC8 479 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP2-216ENST00000510193 COPS5Q92905 334 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP2-216ENST00000510193 TAAR1Q96RJ0 339 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP2-216ENST00000510193 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
SH3BP2-216ENST00000510193 AP5M1Q9H0R1 490 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP2-216ENST00000510193 VAT1LQ9HCJ6 419 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP2-216ENST00000510193 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
SH3BP2-216ENST00000510193 KLRF2D3W0D1 207 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP2-216ENST00000510193 CYTH3O43739 400 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP2-216ENST00000510193 CABYRO75952 493 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP2-216ENST00000510193 PURAQ00577 322 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
SH3BP2-216ENST00000510193 PDE4DQ08499 809 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP2-216ENST00000510193 TROAPQ12815 778 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP2-216ENST00000510193 ITGA7Q13683 1181 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP2-216ENST00000510193 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
SH3BP2-216ENST00000510193 MFSD5Q6N075 450 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP2-216ENST00000510193 C16orf59Q7L2K0 433 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP2-216ENST00000510193 FBXO11Q86XK2 927 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP2-216ENST00000510193 VTI1AQ96AJ9 217 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP2-216ENST00000510193 GUCD1Q96NT3 240 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP2-216ENST00000510193 MAF1Q9H063 256 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP2-216ENST00000510193 UMODL1Q5DID0 1318 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP2-216ENST00000510193 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP2-216ENST00000510193 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
SH3BP2-216ENST00000510193 B4GALT4O60513 344 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP2-216ENST00000510193 HSD17B4P51659 736 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP2-216ENST00000510193 TRDNQ13061 729 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP2-216ENST00000510193 PPP2R5BQ15173 497 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP2-216ENST00000510193 CCDC62Q6P9F0 684 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP2-216ENST00000510193 OR6J1Q8NGC5 347 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP2-216ENST00000510193 NCOA7Q8NI08 942 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP2-216ENST00000510193 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP2-216ENST00000510193 SCFD2Q8WU76 684 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP2-216ENST00000510193 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP14.8□□□□□ -0.04
SH3BP2-216ENST00000510193 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP2-216ENST00000510193 RIOX1Q9H6W3 641 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP2-216ENST00000510193 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
SH3BP2-216ENST00000510193 ZBTB5O15062 677 aa14.79□□□□□ -0.04
SH3BP2-216ENST00000510193 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
SH3BP2-216ENST00000510193 CSF2RAP15509 400 aa14.79□□□□□ -0.04
SH3BP2-216ENST00000510193 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15 ms