RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497453.1

UBE2Q1-207, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

TSL 5

Gene UBE2Q1, Length 830 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1-207ENST00000497453 TRAF1Q13077 416 aa20.69■□□□□ 0.9
UBE2Q1-207ENST00000497453 ACVR2BQ13705 512 aa20.69■□□□□ 0.9
UBE2Q1-207ENST00000497453 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
UBE2Q1-207ENST00000497453 AGXT2Q9BYV1 514 aa20.69■□□□□ 0.9
UBE2Q1-207ENST00000497453 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa20.69■□□□□ 0.9
UBE2Q1-207ENST00000497453 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
UBE2Q1-207ENST00000497453 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
UBE2Q1-207ENST00000497453 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
UBE2Q1-207ENST00000497453 GOLGA8AA7E2F4 631 aa20.68■□□□□ 0.9
UBE2Q1-207ENST00000497453 GOLGA8BA8MQT2 603 aa20.68■□□□□ 0.9
UBE2Q1-207ENST00000497453 OPLAHO14841 1288 aa20.68■□□□□ 0.9
UBE2Q1-207ENST00000497453 AKR1A1P14550 325 aa20.68■□□□□ 0.9
UBE2Q1-207ENST00000497453 RTN1Q16799 776 aa20.68■□□□□ 0.9
UBE2Q1-207ENST00000497453 CCDC82Q8N4S0 544 aa20.68■□□□□ 0.9
UBE2Q1-207ENST00000497453 MORC4Q8TE76 937 aa20.68■□□□□ 0.9
UBE2Q1-207ENST00000497453 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
UBE2Q1-207ENST00000497453 KATNBL1Q9H079 304 aa20.68■□□□□ 0.9
UBE2Q1-207ENST00000497453 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
UBE2Q1-207ENST00000497453 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa20.68■□□□□ 0.9
UBE2Q1-207ENST00000497453 RCAN1P53805 252 aa20.67■□□□□ 0.9
UBE2Q1-207ENST00000497453 DNERQ8NFT8 737 aa20.67■□□□□ 0.9
UBE2Q1-207ENST00000497453 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
UBE2Q1-207ENST00000497453 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
UBE2Q1-207ENST00000497453 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
UBE2Q1-207ENST00000497453 FAM184BQ9ULE4 1060 aa20.67■□□□□ 0.9
UBE2Q1-207ENST00000497453 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa20.66■□□□□ 0.9
UBE2Q1-207ENST00000497453 CFBP00751 764 aa20.66■□□□□ 0.9
UBE2Q1-207ENST00000497453 RARBP10826 455 aa20.66■□□□□ 0.9
UBE2Q1-207ENST00000497453 GHRHRQ02643 423 aa20.66■□□□□ 0.9
UBE2Q1-207ENST00000497453 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
UBE2Q1-207ENST00000497453 C8orf34Q49A92 452 aa20.66■□□□□ 0.9
UBE2Q1-207ENST00000497453 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
UBE2Q1-207ENST00000497453 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
UBE2Q1-207ENST00000497453 COL20A1Q9P218 1284 aa20.66■□□□□ 0.9
UBE2Q1-207ENST00000497453 LCTP09848 1927 aa20.66■□□□□ 0.9
UBE2Q1-207ENST00000497453 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa20.65■□□□□ 0.9
UBE2Q1-207ENST00000497453 CDC27P30260 824 aa20.65■□□□□ 0.9
UBE2Q1-207ENST00000497453 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP20.65■□□□□ 0.9
UBE2Q1-207ENST00000497453 HSD17B4P51659 736 aa20.65■□□□□ 0.9
UBE2Q1-207ENST00000497453 ANAPC15P60006 121 aa20.65■□□□□ 0.9
UBE2Q1-207ENST00000497453 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
UBE2Q1-207ENST00000497453 CCDC144BQ3MJ40 725 aa20.65■□□□□ 0.9
UBE2Q1-207ENST00000497453 EEPD1Q7L9B9 569 aa20.65■□□□□ 0.9
UBE2Q1-207ENST00000497453 NECAB2Q7Z6G3 386 aa20.65■□□□□ 0.9
UBE2Q1-207ENST00000497453 TAAR1Q96RJ0 339 aa20.65■□□□□ 0.9
UBE2Q1-207ENST00000497453 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
UBE2Q1-207ENST00000497453 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa20.64■□□□□ 0.89
UBE2Q1-207ENST00000497453 EDNRBP24530 442 aa20.64■□□□□ 0.89
UBE2Q1-207ENST00000497453 FUT2Q10981 343 aa20.64■□□□□ 0.89
UBE2Q1-207ENST00000497453 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
UBE2Q1-207ENST00000497453 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
UBE2Q1-207ENST00000497453 SAMD3Q8N6K7 520 aa20.64■□□□□ 0.89
UBE2Q1-207ENST00000497453 ARRDC4Q8NCT1 418 aa20.64■□□□□ 0.89
UBE2Q1-207ENST00000497453 C11orf49Q9H6J7 331 aa20.64■□□□□ 0.89
UBE2Q1-207ENST00000497453 VTA1Q9NP79 307 aa20.64■□□□□ 0.89
UBE2Q1-207ENST00000497453 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa20.64■□□□□ 0.89
UBE2Q1-207ENST00000497453 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
UBE2Q1-207ENST00000497453 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
UBE2Q1-207ENST00000497453 NID2Q14112 1375 aa20.63■□□□□ 0.89
UBE2Q1-207ENST00000497453 ADCY6O43306 1168 aa20.63■□□□□ 0.89
UBE2Q1-207ENST00000497453 ADD1P35611 737 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
UBE2Q1-207ENST00000497453 EVCP57679 992 aa20.63■□□□□ 0.89
UBE2Q1-207ENST00000497453 PDE4DQ08499 809 aa20.63■□□□□ 0.89
UBE2Q1-207ENST00000497453 PPP2R5BQ15173 497 aa20.63■□□□□ 0.89
UBE2Q1-207ENST00000497453 TAPT1Q6NXT6 567 aa20.63■□□□□ 0.89
UBE2Q1-207ENST00000497453 IL17RAQ96F46 866 aa20.63■□□□□ 0.89
UBE2Q1-207ENST00000497453 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
UBE2Q1-207ENST00000497453 HTATIP2Q9BUP3 242 aa20.63■□□□□ 0.89
UBE2Q1-207ENST00000497453 PDGFCQ9NRA1 345 aa20.63■□□□□ 0.89
UBE2Q1-207ENST00000497453 PDRG1Q9NUG6 133 aa20.63■□□□□ 0.89
UBE2Q1-207ENST00000497453 MYH6P13533 1939 aa20.63■□□□□ 0.89
UBE2Q1-207ENST00000497453 FRMPD3Q5JV73 1810 aa20.62■□□□□ 0.89
UBE2Q1-207ENST00000497453 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
UBE2Q1-207ENST00000497453 B4DLN1 442 aa20.62■□□□□ 0.89
UBE2Q1-207ENST00000497453 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
UBE2Q1-207ENST00000497453 DNM1LO00429 736 aa20.62■□□□□ 0.89
UBE2Q1-207ENST00000497453 PGK1P00558 417 aa20.62■□□□□ 0.89
UBE2Q1-207ENST00000497453 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
UBE2Q1-207ENST00000497453 POLR2MP0CAP2 368 aa20.62■□□□□ 0.89
UBE2Q1-207ENST00000497453 COL6A1P12109 1028 aa20.62■□□□□ 0.89
UBE2Q1-207ENST00000497453 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
UBE2Q1-207ENST00000497453 ADCYAP1R1P41586 468 aa20.62■□□□□ 0.89
UBE2Q1-207ENST00000497453 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
UBE2Q1-207ENST00000497453 LRRC41Q15345 812 aa20.62■□□□□ 0.89
UBE2Q1-207ENST00000497453 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
UBE2Q1-207ENST00000497453 RMDN3Q96TC7 470 aa20.62■□□□□ 0.89
UBE2Q1-207ENST00000497453 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa20.61■□□□□ 0.89
UBE2Q1-207ENST00000497453 KBTBD13C9JR72 458 aa20.61■□□□□ 0.89
UBE2Q1-207ENST00000497453 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
UBE2Q1-207ENST00000497453 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
UBE2Q1-207ENST00000497453 MCM3APO60318 1980 aa20.61■□□□□ 0.89
UBE2Q1-207ENST00000497453 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa20.6■□□□□ 0.89
UBE2Q1-207ENST00000497453 ADAMTS4O75173 837 aa20.6■□□□□ 0.89
UBE2Q1-207ENST00000497453 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
UBE2Q1-207ENST00000497453 TNFAIP2Q03169 654 aa20.6■□□□□ 0.89
UBE2Q1-207ENST00000497453 ARHGEF16Q5VV41 709 aa20.6■□□□□ 0.89
UBE2Q1-207ENST00000497453 IQSEC1Q6DN90 963 aa20.6■□□□□ 0.89
UBE2Q1-207ENST00000497453 IWS1Q96ST2 819 aa20.6■□□□□ 0.89
UBE2Q1-207ENST00000497453 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
UBE2Q1-207ENST00000497453 PXMP2Q9NR77 195 aa20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms