RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494468.1

XPO1-223, Transcript of exportin 1, human

TSL 3

Gene XPO1, Length 562 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
XPO1-223	ENST00000494468	USP53	Q70EK8	1073 aa		4.79	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	SLCO6A1	Q86UG4	719 aa		4.79	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	HOMER1	Q86YM7	354 aa		4.79	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	LILRA2	Q8N149	483 aa		4.79	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	KREMEN2	Q8NCW0	462 aa		4.79	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	TMEM52	Q8NDY8	209 aa		4.79	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	MYLIP	Q8WY64	445 aa		4.79	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	DIO2	Q92813	273 aa		4.79	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	EXOC2	Q96KP1	924 aa		4.79	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	DHRS4	Q9BTZ2	278 aa		4.79	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	ADGRE2	Q9UHX3	823 aa		4.79	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	MRPS23	Q9Y3D9	190 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	ARID1B	Q8NFD5	2236 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468		A0A1W2PQ27	194 aa		4.78	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468		A0A1W2PQ64	194 aa		4.78	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468		A0A1W2PQC6	194 aa		4.78	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468		A0A1W2PQD8	194 aa		4.78	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	TLDC2	A0PJX2	215 aa		4.78	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	NRDC	O43847	1150 aa		4.78	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	L1CAM	P32004	1257 aa		4.78	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	SQSTM1	Q13501	440 aa		4.78	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	PKN1	Q16512	942 aa		4.78	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	HSF5	Q4G112	596 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	GALNT18	Q6P9A2	607 aa		4.78	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	CBLL1	Q75N03	491 aa		4.78	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	ATG4D	Q86TL0	474 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	CPNE8	Q86YQ8	564 aa		4.78	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	C1orf159	Q96HA4	380 aa		4.78	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	JMJD8	Q96S16	334 aa		4.78	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	MMP19	Q99542	508 aa		4.78	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	KRTAP17-1	Q9BYP8	105 aa		4.78	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		4.78	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	GPR160	Q9UJ42	338 aa		4.78	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	TBX22	Q9Y458	520 aa		4.78	□□□□□ -1.64
XPO1-223	ENST00000494468	ESYT3	A0FGR9	886 aa		4.77	□□□□□ -1.65
XPO1-223	ENST00000494468	MYO1B	O43795	1136 aa		4.77	□□□□□ -1.65
XPO1-223	ENST00000494468	NPHS1	O60500	1241 aa		4.77	□□□□□ -1.65
XPO1-223	ENST00000494468	CDC45	O75419	566 aa		4.77	□□□□□ -1.65
XPO1-223	ENST00000494468	TRHR	P34981	398 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
XPO1-223	ENST00000494468	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
XPO1-223	ENST00000494468	CORO7	P57737	925 aa		4.77	□□□□□ -1.65
XPO1-223	ENST00000494468	TESK1	Q15569	626 aa		4.77	□□□□□ -1.65
XPO1-223	ENST00000494468	DENND5A	Q6IQ26	1287 aa		4.77	□□□□□ -1.65
XPO1-223	ENST00000494468	ABHD4	Q8TB40	342 aa		4.77	□□□□□ -1.65
XPO1-223	ENST00000494468	DCAF4	Q8WV16	495 aa		4.77	□□□□□ -1.65
XPO1-223	ENST00000494468	KISS1R	Q969F8	398 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
XPO1-223	ENST00000494468	KIRREL1	Q96J84	757 aa		4.77	□□□□□ -1.65
XPO1-223	ENST00000494468	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		4.77	□□□□□ -1.65
XPO1-223	ENST00000494468	FANCL	Q9NW38	375 aa		4.77	□□□□□ -1.65
XPO1-223	ENST00000494468	TMEM260	Q9NX78	707 aa		4.77	□□□□□ -1.65
XPO1-223	ENST00000494468	IMPACT	Q9P2X3	320 aa		4.77	□□□□□ -1.65
XPO1-223	ENST00000494468		A0A1W2PQJ5	194 aa		4.76	□□□□□ -1.65
XPO1-223	ENST00000494468	BLACE	A4D250	179 aa		4.76	□□□□□ -1.65
XPO1-223	ENST00000494468	C7orf72	A4D263	438 aa		4.76	□□□□□ -1.65
XPO1-223	ENST00000494468	PSPN	O60542	156 aa		4.76	□□□□□ -1.65
XPO1-223	ENST00000494468	PRKCA	P17252	672 aa		4.76	□□□□□ -1.65
XPO1-223	ENST00000494468	RPL11	P62913	178 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
XPO1-223	ENST00000494468	SNX17	Q15036	470 aa		4.76	□□□□□ -1.65
XPO1-223	ENST00000494468	NTRK3	Q16288	839 aa		4.76	□□□□□ -1.65
XPO1-223	ENST00000494468	TIGD5	Q53EQ6	642 aa		4.76	□□□□□ -1.65
XPO1-223	ENST00000494468	SDE2	Q6IQ49	451 aa		4.76	□□□□□ -1.65
XPO1-223	ENST00000494468	RSPO2	Q6UXX9	243 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
XPO1-223	ENST00000494468	MAMDC2	Q7Z304	686 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
XPO1-223	ENST00000494468	CCDC103	Q8IW40	242 aa		4.76	□□□□□ -1.65
XPO1-223	ENST00000494468	SYNPO	Q8N3V7	929 aa		4.76	□□□□□ -1.65
XPO1-223	ENST00000494468	POU5F2	Q8N7G0	328 aa		4.76	□□□□□ -1.65
XPO1-223	ENST00000494468	NUP43	Q8NFH3	380 aa		4.76	□□□□□ -1.65
XPO1-223	ENST00000494468	APPBP2	Q92624	585 aa		4.76	□□□□□ -1.65
XPO1-223	ENST00000494468	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		4.76	□□□□□ -1.65
XPO1-223	ENST00000494468	GPR27	Q9NS67	375 aa		4.76	□□□□□ -1.65
XPO1-223	ENST00000494468	TMEFF2	Q9UIK5	374 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
XPO1-223	ENST00000494468	NOTO	A8MTQ0	251 aa		4.75	□□□□□ -1.65
XPO1-223	ENST00000494468	ENPP3	O14638	875 aa		4.75	□□□□□ -1.65
XPO1-223	ENST00000494468	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
XPO1-223	ENST00000494468	APP	P05067	770 aa		4.75	□□□□□ -1.65
XPO1-223	ENST00000494468	ARL4A	P40617	200 aa		4.75	□□□□□ -1.65
XPO1-223	ENST00000494468	GABRE	P78334	506 aa		4.75	□□□□□ -1.65
XPO1-223	ENST00000494468	TCEA2	Q15560	299 aa		4.75	□□□□□ -1.65
XPO1-223	ENST00000494468	INF2	Q27J81	1249 aa		4.75	□□□□□ -1.65
XPO1-223	ENST00000494468	MBLAC2	Q68D91	279 aa		4.75	□□□□□ -1.65
XPO1-223	ENST00000494468	STYK1	Q6J9G0	422 aa		4.75	□□□□□ -1.65
XPO1-223	ENST00000494468	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		4.75	□□□□□ -1.65
XPO1-223	ENST00000494468	NLRX1	Q86UT6	975 aa		4.75	□□□□□ -1.65
XPO1-223	ENST00000494468	ZSWIM9	Q86XI8	627 aa		4.75	□□□□□ -1.65
XPO1-223	ENST00000494468	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		4.75	□□□□□ -1.65
XPO1-223	ENST00000494468	LZTR1	Q8N653	840 aa		4.75	□□□□□ -1.65
XPO1-223	ENST00000494468	RCBTB1	Q8NDN9	531 aa		4.75	□□□□□ -1.65
XPO1-223	ENST00000494468	PTPRN2	Q92932	1015 aa		4.75	□□□□□ -1.65
XPO1-223	ENST00000494468	ZFYVE21	Q9BQ24	234 aa		4.75	□□□□□ -1.65
XPO1-223	ENST00000494468	PLCD4	Q9BRC7	762 aa		4.75	□□□□□ -1.65
XPO1-223	ENST00000494468	MRPL4	Q9BYD3	311 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
XPO1-223	ENST00000494468	RNF32	Q9H0A6	362 aa		4.75	□□□□□ -1.65
XPO1-223	ENST00000494468	SP110	Q9HB58	689 aa		4.75	□□□□□ -1.65
XPO1-223	ENST00000494468	PDLIM7	Q9NR12	457 aa		4.75	□□□□□ -1.65
XPO1-223	ENST00000494468	BTG4	Q9NY30	223 aa		4.75	□□□□□ -1.65
XPO1-223	ENST00000494468	SFMBT1	Q9UHJ3	866 aa		4.75	□□□□□ -1.65
XPO1-223	ENST00000494468	ACSL6	Q9UKU0	697 aa		4.75	□□□□□ -1.65
XPO1-223	ENST00000494468	PCDHA2	Q9Y5H9	948 aa		4.75	□□□□□ -1.65
XPO1-223	ENST00000494468	TIMM13	Q9Y5L4	95 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
XPO1-223	ENST00000494468	NPFFR2	Q9Y5X5	522 aa		4.75	□□□□□ -1.65

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