RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493060.5

NVL-222, Transcript of nuclear VCP-like, human

TSL 2

Gene NVL, Length 639 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NVL-222	ENST00000493060	ATP5J	P18859	108 aa		10.2	□□□□□ -0.78
NVL-222	ENST00000493060	EPHB4	P54760	987 aa		10.2	□□□□□ -0.78
NVL-222	ENST00000493060	TLE2	Q04725	743 aa		10.2	□□□□□ -0.78
NVL-222	ENST00000493060	HIC1	Q14526	733 aa		10.2	□□□□□ -0.78
NVL-222	ENST00000493060	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
NVL-222	ENST00000493060	ZNF792	Q3KQV3	632 aa		10.2	□□□□□ -0.78
NVL-222	ENST00000493060	RIOX2	Q8IUF8	465 aa		10.2	□□□□□ -0.78
NVL-222	ENST00000493060	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		10.2	□□□□□ -0.78
NVL-222	ENST00000493060	CCDC17	Q96LX7	622 aa		10.2	□□□□□ -0.78
NVL-222	ENST00000493060	MMP19	Q99542	508 aa		10.2	□□□□□ -0.78
NVL-222	ENST00000493060	HAUS7	Q99871	368 aa		10.2	□□□□□ -0.78
NVL-222	ENST00000493060	TINF2	Q9BSI4	451 aa		10.2	□□□□□ -0.78
NVL-222	ENST00000493060	XPNPEP3	Q9NQH7	507 aa		10.2	□□□□□ -0.78
NVL-222	ENST00000493060	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		10.2	□□□□□ -0.78
NVL-222	ENST00000493060	PPP1R9A	Q9ULJ8	1098 aa		10.2	□□□□□ -0.78
NVL-222	ENST00000493060	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		10.19	□□□□□ -0.78
NVL-222	ENST00000493060	LAMA4	Q16363	1823 aa		10.19	□□□□□ -0.78
NVL-222	ENST00000493060		A0A1W2PQ45	241 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
NVL-222	ENST00000493060		A0A1W2PQY0	241 aa		10.19	□□□□□ -0.78
NVL-222	ENST00000493060	ADAMTS4	O75173	837 aa		10.19	□□□□□ -0.78
NVL-222	ENST00000493060	PGK1	P00558	417 aa		10.19	□□□□□ -0.78
NVL-222	ENST00000493060	ZNF865	P0CJ78	1059 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
NVL-222	ENST00000493060	UBE3C	Q15386	1083 aa		10.19	□□□□□ -0.78
NVL-222	ENST00000493060	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		10.19	□□□□□ -0.78
NVL-222	ENST00000493060	CTR9	Q6PD62	1173 aa		10.19	□□□□□ -0.78
NVL-222	ENST00000493060	TICAM2	Q86XR7	235 aa		10.19	□□□□□ -0.78
NVL-222	ENST00000493060	NLRP7	Q8WX94	980 aa		10.19	□□□□□ -0.78
NVL-222	ENST00000493060	RILPL2	Q969X0	211 aa		10.19	□□□□□ -0.78
NVL-222	ENST00000493060	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
NVL-222	ENST00000493060	SEMA6B	Q9H3T3	888 aa		10.19	□□□□□ -0.78
NVL-222	ENST00000493060	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		10.19	□□□□□ -0.78
NVL-222	ENST00000493060	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		10.19	□□□□□ -0.78
NVL-222	ENST00000493060	DACH1	Q9UI36	760 aa		10.19	□□□□□ -0.78
NVL-222	ENST00000493060	TCF20	Q9UGU0	1960 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
NVL-222	ENST00000493060	SYNRG	Q9UMZ2	1314 aa		10.18	□□□□□ -0.78
NVL-222	ENST00000493060	MYH7B	A7E2Y1	1941 aa		10.18	□□□□□ -0.78
NVL-222	ENST00000493060	KIAA0355	O15063	1070 aa		10.18	□□□□□ -0.78
NVL-222	ENST00000493060	CLTB	P09497	229 aa		10.18	□□□□□ -0.78
NVL-222	ENST00000493060	RARB	P10826	455 aa		10.18	□□□□□ -0.78
NVL-222	ENST00000493060	STAT3	P40763	770 aa		10.18	□□□□□ -0.78
NVL-222	ENST00000493060	SMAD3	P84022	425 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
NVL-222	ENST00000493060	KCTD2	Q14681	263 aa		10.18	□□□□□ -0.78
NVL-222	ENST00000493060	HSCB	Q8IWL3	235 aa		10.18	□□□□□ -0.78
NVL-222	ENST00000493060	FAM160A2	Q8N612	972 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
NVL-222	ENST00000493060	MYLIP	Q8WY64	445 aa		10.18	□□□□□ -0.78
NVL-222	ENST00000493060	PHOX2B	Q99453	314 aa		10.18	□□□□□ -0.78
NVL-222	ENST00000493060	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
NVL-222	ENST00000493060	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	10.18	□□□□□ -0.78
NVL-222	ENST00000493060	DIS3	Q9Y2L1	958 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
NVL-222	ENST00000493060	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		10.18	□□□□□ -0.78
NVL-222	ENST00000493060	ADCY6	O43306	1168 aa		10.17	□□□□□ -0.78
NVL-222	ENST00000493060	PQBP1	O60828	265 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
NVL-222	ENST00000493060	AKR1A1	P14550	325 aa		10.17	□□□□□ -0.78
NVL-222	ENST00000493060	RASA1	P20936	1047 aa		10.17	□□□□□ -0.78
NVL-222	ENST00000493060	FUT2	Q10981	343 aa		10.17	□□□□□ -0.78
NVL-222	ENST00000493060	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
NVL-222	ENST00000493060	RNF180	Q86T96	592 aa		10.17	□□□□□ -0.78
NVL-222	ENST00000493060	CRIPAK	Q8N1N5	446 aa		10.17	□□□□□ -0.78
NVL-222	ENST00000493060	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
NVL-222	ENST00000493060	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
NVL-222	ENST00000493060	GOPC	Q9HD26	462 aa		10.17	□□□□□ -0.78
NVL-222	ENST00000493060	PRDM9	Q9NQV7	894 aa		10.17	□□□□□ -0.78
NVL-222	ENST00000493060	TOR4A	Q9NXH8	423 aa		10.17	□□□□□ -0.78
NVL-222	ENST00000493060	ARPP21	Q9UBL0	812 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
NVL-222	ENST00000493060	RIPK3	Q9Y572	518 aa		10.17	□□□□□ -0.78
NVL-222	ENST00000493060	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		10.17	□□□□□ -0.78
NVL-222	ENST00000493060	COL4A4	P53420	1690 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
NVL-222	ENST00000493060	SYNGAP1	Q96PV0	1343 aa		10.16	□□□□□ -0.78
NVL-222	ENST00000493060	DNAJC25-GNG10	A0A024R161	153 aa		10.16	□□□□□ -0.78
NVL-222	ENST00000493060	IGKV6D-41	A0A0C4DH26	115 aa		10.16	□□□□□ -0.78
NVL-222	ENST00000493060	MYADML2	A6NDP7	307 aa		10.16	□□□□□ -0.78
NVL-222	ENST00000493060	GSG1L2	A8MUP6	293 aa		10.16	□□□□□ -0.78
NVL-222	ENST00000493060	SNAI1	O95863	264 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
NVL-222	ENST00000493060	NDUFB10	O96000	172 aa		10.16	□□□□□ -0.78
NVL-222	ENST00000493060	COPB2	P35606	906 aa		10.16	□□□□□ -0.78
NVL-222	ENST00000493060	ACLY	P53396	1101 aa		10.16	□□□□□ -0.78
NVL-222	ENST00000493060	FAAP100	Q0VG06	881 aa		10.16	□□□□□ -0.78
NVL-222	ENST00000493060	FOXC1	Q12948	553 aa		10.16	□□□□□ -0.78
NVL-222	ENST00000493060	SNRNP48	Q6IEG0	339 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
NVL-222	ENST00000493060	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		10.16	□□□□□ -0.78
NVL-222	ENST00000493060	ANKRD33	Q7Z3H0	272 aa		10.16	□□□□□ -0.78
NVL-222	ENST00000493060	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		10.16	□□□□□ -0.78
NVL-222	ENST00000493060	EVI5L	Q96CN4	794 aa		10.16	□□□□□ -0.78
NVL-222	ENST00000493060	RNPC3	Q96LT9	517 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
NVL-222	ENST00000493060	FGD4	Q96M96	766 aa		10.16	□□□□□ -0.78
NVL-222	ENST00000493060	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
NVL-222	ENST00000493060	SLF1	Q9BQI6	1058 aa		10.16	□□□□□ -0.78
NVL-222	ENST00000493060	TEX13B	Q9BXU2	312 aa		10.16	□□□□□ -0.78
NVL-222	ENST00000493060	EPB41L4A	Q9HCS5	686 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
NVL-222	ENST00000493060	FCF1	Q9Y324	198 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
NVL-222	ENST00000493060	TACC3	Q9Y6A5	838 aa		10.16	□□□□□ -0.78
NVL-222	ENST00000493060	TET1	Q8NFU7	2136 aa		10.16	□□□□□ -0.78
NVL-222	ENST00000493060	PLIN4	Q96Q06	1357 aa		10.15	□□□□□ -0.78
NVL-222	ENST00000493060		F5H6K3	240 aa		10.15	□□□□□ -0.78
NVL-222	ENST00000493060	RAD21	O60216	631 aa		10.15	□□□□□ -0.78
NVL-222	ENST00000493060	AVP	P01185	164 aa		10.15	□□□□□ -0.78
NVL-222	ENST00000493060	RAG1	P15918	1043 aa		10.15	□□□□□ -0.78
NVL-222	ENST00000493060	FPGS	Q05932	587 aa		10.15	□□□□□ -0.78
NVL-222	ENST00000493060	KLRC3	Q07444	240 aa		10.15	□□□□□ -0.78
NVL-222	ENST00000493060	RABEP1	Q15276	862 aa		10.15	□□□□□ -0.78

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