RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492545.1

CTDSP1-211, Transcript of CTD small phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDSP1, Length 634 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1-211ENST00000492545 WTAPQ15007 396 aa27.57■■■□□ 2
CTDSP1-211ENST00000492545 QRICH1Q2TAL8 776 aa27.57■■■□□ 2
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CTDSP1-211ENST00000492545 VAT1LQ9HCJ6 419 aa27.57■■■□□ 2
CTDSP1-211ENST00000492545 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP27.56■■■□□ 2
CTDSP1-211ENST00000492545 MYADML2A6NDP7 307 aa27.56■■■□□ 2
CTDSP1-211ENST00000492545 CABYRO75952 493 aa27.56■■■□□ 2
CTDSP1-211ENST00000492545 SMPD1P17405 629 aa27.56■■■□□ 2
CTDSP1-211ENST00000492545 LRIT3Q3SXY7 679 aa27.56■■■□□ 2
CTDSP1-211ENST00000492545 EEPD1Q7L9B9 569 aa27.56■■■□□ 2
CTDSP1-211ENST00000492545 TLK2Q86UE8 772 aa27.56■■■□□ 2
CTDSP1-211ENST00000492545 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP27.56■■■□□ 2
CTDSP1-211ENST00000492545 AMNQ9BXJ7 453 aa27.56■■■□□ 2
CTDSP1-211ENST00000492545 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP27.56■■■□□ 2
CTDSP1-211ENST00000492545 PDLIM7Q9NR12 457 aa27.56■■■□□ 2
CTDSP1-211ENST00000492545 MAD2L2Q9UI95 211 aa27.56■■■□□ 2
CTDSP1-211ENST00000492545 MROH7Q68CQ1 1323 aa27.56■■■□□ 2
CTDSP1-211ENST00000492545 DCDC2CA8MYV0 355 aa27.55■■■□□ 2
CTDSP1-211ENST00000492545 CTAGE5O15320 804 aa27.55■■■□□ 2
CTDSP1-211ENST00000492545 CLTBP09497 229 aa27.55■■■□□ 2
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CTDSP1-211ENST00000492545 PDE4DQ08499 809 aa27.55■■■□□ 2
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CTDSP1-211ENST00000492545 DUSP28Q4G0W2 176 aa27.55■■■□□ 2
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CTDSP1-211ENST00000492545 CATIPQ7Z7H3 387 aa27.55■■■□□ 2
CTDSP1-211ENST00000492545 STAG2Q8N3U4 1231 aa27.55■■■□□ 2
CTDSP1-211ENST00000492545 MTMR8Q96EF0 704 aa27.55■■■□□ 2
CTDSP1-211ENST00000492545 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa27.55■■■□□ 2
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CTDSP1-211ENST00000492545 TAF6LQ9Y6J9 622 aa27.55■■■□□ 2
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CTDSP1-211ENST00000492545 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP27.54■■■□□ 2
CTDSP1-211ENST00000492545 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP27.54■■■□□ 2
CTDSP1-211ENST00000492545 CASC1Q6TDU7 716 aa27.54■■■□□ 2
CTDSP1-211ENST00000492545 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP27.54■■■□□ 2
CTDSP1-211ENST00000492545 TMTC2Q8N394 836 aa27.54■■■□□ 2
CTDSP1-211ENST00000492545 SAMD3Q8N6K7 520 aa27.54■■■□□ 2
CTDSP1-211ENST00000492545 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa27.54■■■□□ 2
CTDSP1-211ENST00000492545 VTI1AQ96AJ9 217 aa27.54■■■□□ 2
CTDSP1-211ENST00000492545 LAMA3Q16787 3333 aa27.53■■■□□ 2
CTDSP1-211ENST00000492545 ZBTB5O15062 677 aa27.53■■■□□ 2
CTDSP1-211ENST00000492545 KIAA0355O15063 1070 aa27.53■■■□□ 2
CTDSP1-211ENST00000492545 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
CTDSP1-211ENST00000492545 TROAPQ12815 778 aa27.53■■■□□ 2
CTDSP1-211ENST00000492545 GPR153Q6NV75 609 aa27.53■■■□□ 2
CTDSP1-211ENST00000492545 MAP3K14Q99558 947 aa27.53■■■□□ 2
CTDSP1-211ENST00000492545 WDR11Q9BZH6 1224 aa27.53■■■□□ 2
CTDSP1-211ENST00000492545 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
CTDSP1-211ENST00000492545 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP27.52■■■□□ 2
CTDSP1-211ENST00000492545 MCM5P33992 734 aa27.52■■■□□ 2
CTDSP1-211ENST00000492545 CDK7P50613 346 aa27.52■■■□□ 2
CTDSP1-211ENST00000492545 NECTIN1Q15223 517 aa27.52■■■□□ 2
CTDSP1-211ENST00000492545 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP27.52■■■□□ 2
CTDSP1-211ENST00000492545 CCDC136Q96JN2 1154 aa27.52■■■□□ 2
CTDSP1-211ENST00000492545 IWS1Q96ST2 819 aa27.52■■■□□ 2
CTDSP1-211ENST00000492545 RIOX1Q9H6W3 641 aa27.52■■■□□ 2
CTDSP1-211ENST00000492545 ANO2Q9NQ90 1003 aa27.52■■■□□ 2
CTDSP1-211ENST00000492545 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP27.52■■■□□ 2
CTDSP1-211ENST00000492545 TRIM43BA6NCK2 446 aa27.51■■□□□ 1.99
CTDSP1-211ENST00000492545 ARVCFO00192 962 aa27.51■■□□□ 1.99
CTDSP1-211ENST00000492545 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP27.51■■□□□ 1.995e-9■□□□□ 8.8
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CTDSP1-211ENST00000492545 CHST3Q7LGC8 479 aa27.51■■□□□ 1.99
CTDSP1-211ENST00000492545 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP27.51■■□□□ 1.99
CTDSP1-211ENST00000492545 SCFD2Q8WU76 684 aa27.51■■□□□ 1.99
CTDSP1-211ENST00000492545 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP27.51■■□□□ 1.99
CTDSP1-211ENST00000492545 TMEM87BQ96K49 555 aa27.51■■□□□ 1.99
CTDSP1-211ENST00000492545 TMEM39AQ9NV64 488 aa27.51■■□□□ 1.99
CTDSP1-211ENST00000492545 SLC27A2O14975 620 aa27.5■■□□□ 1.99
CTDSP1-211ENST00000492545 ANTXR2P58335 489 aa27.5■■□□□ 1.99
CTDSP1-211ENST00000492545 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP27.5■■□□□ 1.99
CTDSP1-211ENST00000492545 GHRHRQ02643 423 aa27.5■■□□□ 1.99
CTDSP1-211ENST00000492545 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa27.5■■□□□ 1.99
CTDSP1-211ENST00000492545 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa27.5■■□□□ 1.99
CTDSP1-211ENST00000492545 BEX3Q00994 111 aa27.49■■□□□ 1.99
CTDSP1-211ENST00000492545 FAAP100Q0VG06 881 aa27.49■■□□□ 1.99
CTDSP1-211ENST00000492545 CREB3L3Q68CJ9 461 aa27.49■■□□□ 1.99
CTDSP1-211ENST00000492545 BADQ92934 168 aa27.49■■□□□ 1.99
CTDSP1-211ENST00000492545 SENP2Q9HC62 589 aa27.49■■□□□ 1.99
CTDSP1-211ENST00000492545 DDAH1O94760 285 aa27.48■■□□□ 1.99
CTDSP1-211ENST00000492545 RAG1P15918 1043 aa27.48■■□□□ 1.99
CTDSP1-211ENST00000492545 KIF5BP33176 963 aa27.48■■□□□ 1.99
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CTDSP1-211ENST00000492545 PPP2R5BQ15173 497 aa27.48■■□□□ 1.99
CTDSP1-211ENST00000492545 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP27.48■■□□□ 1.99
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CTDSP1-211ENST00000492545 RMDN3Q96TC7 470 aa27.48■■□□□ 1.99
CTDSP1-211ENST00000492545 SZT2Q5T011 3432 aa27.48■■□□□ 1.99
CTDSP1-211ENST00000492545 LCTP09848 1927 aa27.47■■□□□ 1.99
CTDSP1-211ENST00000492545 TLR3O15455 904 aaKnown RBP27.47■■□□□ 1.99
CTDSP1-211ENST00000492545 PRC1O43663 620 aa27.47■■□□□ 1.99
CTDSP1-211ENST00000492545 SMARCA1P28370 1054 aa27.47■■□□□ 1.99
CTDSP1-211ENST00000492545 HSD17B4P51659 736 aa27.47■■□□□ 1.99
CTDSP1-211ENST00000492545 CXCL17Q6UXB2 119 aa27.47■■□□□ 1.99
CTDSP1-211ENST00000492545 SLC43A3Q8NBI5 491 aa27.47■■□□□ 1.99
CTDSP1-211ENST00000492545 LZTS2Q9BRK4 669 aa27.47■■□□□ 1.99
CTDSP1-211ENST00000492545 LY9Q9HBG7 655 aa27.47■■□□□ 1.99
CTDSP1-211ENST00000492545 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa27.46■■□□□ 1.99
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