RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489824.1

RPS6KB1-208, Transcript of ribosomal protein S6 kinase B1, humanhuman

TSL 3

Gene RPS6KB1, Length 909 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1-208ENST00000489824 CD4P01730 458 aa22.85■■□□□ 1.25
RPS6KB1-208ENST00000489824 CYP2C18P33260 490 aa22.85■■□□□ 1.25
RPS6KB1-208ENST00000489824 TMEM240Q5SV17 173 aa22.85■■□□□ 1.25
RPS6KB1-208ENST00000489824 SLC43A3Q8NBI5 491 aa22.85■■□□□ 1.25
RPS6KB1-208ENST00000489824 TIFAQ96CG3 184 aa22.85■■□□□ 1.25
RPS6KB1-208ENST00000489824 WDR11Q9BZH6 1224 aa22.85■■□□□ 1.25
RPS6KB1-208ENST00000489824 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
RPS6KB1-208ENST00000489824 ACRP10323 421 aa22.84■■□□□ 1.25
RPS6KB1-208ENST00000489824 PTGS1P23219 599 aa22.84■■□□□ 1.25
RPS6KB1-208ENST00000489824 NT5C2P49902 561 aa22.84■■□□□ 1.25
RPS6KB1-208ENST00000489824 PDE4DQ08499 809 aa22.84■■□□□ 1.25
RPS6KB1-208ENST00000489824 DUSP28Q4G0W2 176 aa22.84■■□□□ 1.25
RPS6KB1-208ENST00000489824 CCDC178Q5BJE1 867 aa22.84■■□□□ 1.25
RPS6KB1-208ENST00000489824 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
RPS6KB1-208ENST00000489824 SLC30A10Q6XR72 485 aa22.84■■□□□ 1.25
RPS6KB1-208ENST00000489824 IQCA1Q86XH1 822 aa22.84■■□□□ 1.25
RPS6KB1-208ENST00000489824 WDR19Q8NEZ3 1342 aa22.83■■□□□ 1.25
RPS6KB1-208ENST00000489824 B4DLN1 442 aa22.83■■□□□ 1.25
RPS6KB1-208ENST00000489824 HIP1O00291 1037 aa22.83■■□□□ 1.25
RPS6KB1-208ENST00000489824 CPT1AP50416 773 aa22.83■■□□□ 1.25
RPS6KB1-208ENST00000489824 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
RPS6KB1-208ENST00000489824 PSMC6P62333 389 aa22.83■■□□□ 1.25
RPS6KB1-208ENST00000489824 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
RPS6KB1-208ENST00000489824 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
RPS6KB1-208ENST00000489824 ZNF365Q70YC5 407 aa22.83■■□□□ 1.25
RPS6KB1-208ENST00000489824 CLEC4DQ8WXI8 215 aa22.83■■□□□ 1.25
RPS6KB1-208ENST00000489824 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa22.83■■□□□ 1.25
RPS6KB1-208ENST00000489824 IL23AQ9NPF7 189 aa22.83■■□□□ 1.25
RPS6KB1-208ENST00000489824 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
RPS6KB1-208ENST00000489824 POLR3EQ9NVU0 708 aa22.83■■□□□ 1.25
RPS6KB1-208ENST00000489824 NEDD4P46934 1319 aa22.82■■□□□ 1.24
RPS6KB1-208ENST00000489824 RAD50Q92878 1312 aa22.82■■□□□ 1.24
RPS6KB1-208ENST00000489824 SNHG28P0DPA3 235 aa22.82■■□□□ 1.24
RPS6KB1-208ENST00000489824 NUCB1Q02818 461 aa22.82■■□□□ 1.24
RPS6KB1-208ENST00000489824 TMEM63BQ5T3F8 832 aa22.82■■□□□ 1.24
RPS6KB1-208ENST00000489824 C16orf59Q7L2K0 433 aa22.82■■□□□ 1.24
RPS6KB1-208ENST00000489824 DGKHQ86XP1 1220 aa22.82■■□□□ 1.24
RPS6KB1-208ENST00000489824 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa22.82■■□□□ 1.24
RPS6KB1-208ENST00000489824 OR6J1Q8NGC5 347 aa22.82■■□□□ 1.24
RPS6KB1-208ENST00000489824 TRPV6Q9H1D0 765 aa22.82■■□□□ 1.24
RPS6KB1-208ENST00000489824 OSBPL3Q9H4L5 887 aa22.82■■□□□ 1.24
RPS6KB1-208ENST00000489824 ZNF576Q9H609 170 aa22.82■■□□□ 1.24
RPS6KB1-208ENST00000489824 EYSQ5T1H1 3165 aa22.82■■□□□ 1.24
RPS6KB1-208ENST00000489824 B4GALT4O60513 344 aa22.81■■□□□ 1.24
RPS6KB1-208ENST00000489824 GOLGA8HP0CJ92 632 aa22.81■■□□□ 1.24
RPS6KB1-208ENST00000489824 RPS6P62753 249 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
RPS6KB1-208ENST00000489824 PPP2R5BQ15173 497 aa22.81■■□□□ 1.24
RPS6KB1-208ENST00000489824 USH1GQ495M9 461 aa22.81■■□□□ 1.24
RPS6KB1-208ENST00000489824 KAT14Q9H8E8 782 aa22.81■■□□□ 1.24
RPS6KB1-208ENST00000489824 LRRC37A2A6NM11 1700 aa22.81■■□□□ 1.24
RPS6KB1-208ENST00000489824 GRIN2DO15399 1336 aa22.81■■□□□ 1.24
RPS6KB1-208ENST00000489824 CDH23Q9H251 3354 aa22.8■■□□□ 1.24
RPS6KB1-208ENST00000489824 FGBP02675 491 aa22.8■■□□□ 1.24
RPS6KB1-208ENST00000489824 MYL3P08590 195 aa22.8■■□□□ 1.24
RPS6KB1-208ENST00000489824 CCL23P55773 120 aa22.8■■□□□ 1.24
RPS6KB1-208ENST00000489824 GRIN2CQ14957 1233 aa22.8■■□□□ 1.24
RPS6KB1-208ENST00000489824 PNMA1Q8ND90 353 aa22.8■■□□□ 1.24
RPS6KB1-208ENST00000489824 DNERQ8NFT8 737 aa22.8■■□□□ 1.24
RPS6KB1-208ENST00000489824 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
RPS6KB1-208ENST00000489824 CUL9Q8IWT3 2517 aa22.79■■□□□ 1.24
RPS6KB1-208ENST00000489824 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP22.79■■□□□ 1.24
RPS6KB1-208ENST00000489824 KDM4AO75164 1064 aa22.79■■□□□ 1.24
RPS6KB1-208ENST00000489824 IGHDP01880 384 aa22.79■■□□□ 1.24
RPS6KB1-208ENST00000489824 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa22.79■■□□□ 1.24
RPS6KB1-208ENST00000489824 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
RPS6KB1-208ENST00000489824 SCFD2Q8WU76 684 aa22.79■■□□□ 1.24
RPS6KB1-208ENST00000489824 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
RPS6KB1-208ENST00000489824 UBA5Q9GZZ9 404 aa22.79■■□□□ 1.24
RPS6KB1-208ENST00000489824 CTNNA3Q9UI47 895 aa22.79■■□□□ 1.24
RPS6KB1-208ENST00000489824 MSRAQ9UJ68 235 aa22.79■■□□□ 1.24
RPS6KB1-208ENST00000489824 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
RPS6KB1-208ENST00000489824 RAB30Q15771 203 aa22.78■■□□□ 1.24
RPS6KB1-208ENST00000489824 RASIP1Q5U651 963 aa22.78■■□□□ 1.24
RPS6KB1-208ENST00000489824 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
RPS6KB1-208ENST00000489824 HERVK_113Q902F9 699 aa22.78■■□□□ 1.24
RPS6KB1-208ENST00000489824 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
RPS6KB1-208ENST00000489824 PBX4Q9BYU1 374 aa22.78■■□□□ 1.24
RPS6KB1-208ENST00000489824 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
RPS6KB1-208ENST00000489824 UMODL1Q5DID0 1318 aa22.78■■□□□ 1.24
RPS6KB1-208ENST00000489824 GRXCR1A8MXD5 290 aa22.77■■□□□ 1.24
RPS6KB1-208ENST00000489824 B4E1Z4 1266 aa22.77■■□□□ 1.24
RPS6KB1-208ENST00000489824 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
RPS6KB1-208ENST00000489824 PURAQ00577 322 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
RPS6KB1-208ENST00000489824 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
RPS6KB1-208ENST00000489824 FAM47CQ5HY64 1035 aa22.77■■□□□ 1.24
RPS6KB1-208ENST00000489824 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
RPS6KB1-208ENST00000489824 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
RPS6KB1-208ENST00000489824 DSCC1Q9BVC3 393 aa22.77■■□□□ 1.24
RPS6KB1-208ENST00000489824 KPNA6O60684 536 aa22.76■■□□□ 1.23
RPS6KB1-208ENST00000489824 EDNRBP24530 442 aa22.76■■□□□ 1.23
RPS6KB1-208ENST00000489824 PBX2P40425 430 aa22.76■■□□□ 1.23
RPS6KB1-208ENST00000489824 ASPRV1Q53RT3 343 aa22.76■■□□□ 1.23
RPS6KB1-208ENST00000489824 OTOP2Q7RTS6 562 aa22.76■■□□□ 1.23
RPS6KB1-208ENST00000489824 RGS22Q8NE09 1264 aa22.76■■□□□ 1.23
RPS6KB1-208ENST00000489824 EXOC6Q8TAG9 804 aa22.76■■□□□ 1.23
RPS6KB1-208ENST00000489824 UBAC1Q9BSL1 405 aa22.76■■□□□ 1.23
RPS6KB1-208ENST00000489824 KRT23Q9C075 422 aa22.76■■□□□ 1.23
RPS6KB1-208ENST00000489824 CPVLQ9H3G5 476 aa22.76■■□□□ 1.23
RPS6KB1-208ENST00000489824 TNKSO95271 1327 aa22.76■■□□□ 1.23
RPS6KB1-208ENST00000489824 ABCB11O95342 1321 aa22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.3 ms