RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488033.5

HCLS1-209, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

TSL 4

Gene HCLS1, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-209ENST00000488033 PITPNM1O00562 1244 aa16.07■□□□□ 0.16
HCLS1-209ENST00000488033 BAIAP3O94812 1187 aa16.07■□□□□ 0.16
HCLS1-209ENST00000488033 PURAQ00577 322 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
HCLS1-209ENST00000488033 BFSP2Q13515 415 aa16.07■□□□□ 0.16
HCLS1-209ENST00000488033 UBE3CQ15386 1083 aa16.07■□□□□ 0.16
HCLS1-209ENST00000488033 NBPF20Q3BBV1 942 aa16.07■□□□□ 0.16
HCLS1-209ENST00000488033 TKFCQ3LXA3 575 aa16.07■□□□□ 0.16
HCLS1-209ENST00000488033 DUSP28Q4G0W2 176 aa16.07■□□□□ 0.16
HCLS1-209ENST00000488033 SLFN13Q68D06 897 aa16.07■□□□□ 0.16
HCLS1-209ENST00000488033 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
HCLS1-209ENST00000488033 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa16.07■□□□□ 0.16
HCLS1-209ENST00000488033 MKL1Q969V6 931 aa16.07■□□□□ 0.16
HCLS1-209ENST00000488033 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
HCLS1-209ENST00000488033 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa16.06■□□□□ 0.16
HCLS1-209ENST00000488033 CPT1AP50416 773 aa16.06■□□□□ 0.16
HCLS1-209ENST00000488033 IKQ13123 557 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
HCLS1-209ENST00000488033 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
HCLS1-209ENST00000488033 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
HCLS1-209ENST00000488033 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
HCLS1-209ENST00000488033 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
HCLS1-209ENST00000488033 KCNH6Q9H252 994 aa16.06■□□□□ 0.16
HCLS1-209ENST00000488033 SUGCTQ9HAC7 445 aa16.06■□□□□ 0.16
HCLS1-209ENST00000488033 NOD1Q9Y239 953 aa16.06■□□□□ 0.16
HCLS1-209ENST00000488033 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa16.06■□□□□ 0.16
HCLS1-209ENST00000488033 DCXO43602 365 aa16.05■□□□□ 0.16
HCLS1-209ENST00000488033 STAT2P52630 851 aa16.05■□□□□ 0.16
HCLS1-209ENST00000488033 WDR5P61964 334 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
HCLS1-209ENST00000488033 SBK1Q52WX2 424 aa16.05■□□□□ 0.16
HCLS1-209ENST00000488033 NSMFQ6X4W1 530 aa16.05■□□□□ 0.16
HCLS1-209ENST00000488033 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
HCLS1-209ENST00000488033 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa16.05■□□□□ 0.16
HCLS1-209ENST00000488033 OR6J1Q8NGC5 347 aa16.05■□□□□ 0.16
HCLS1-209ENST00000488033 CHURC1Q8WUH1 139 aa16.05■□□□□ 0.16
HCLS1-209ENST00000488033 CHMP4CQ96CF2 233 aa16.05■□□□□ 0.16
HCLS1-209ENST00000488033 KIF1BPQ96EK5 621 aa16.05■□□□□ 0.16
HCLS1-209ENST00000488033 CEP95Q96GE4 821 aa16.05■□□□□ 0.16
HCLS1-209ENST00000488033 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
HCLS1-209ENST00000488033 WDR11Q9BZH6 1224 aa16.05■□□□□ 0.16
HCLS1-209ENST00000488033 MTMR4Q9NYA4 1195 aa16.05■□□□□ 0.16
HCLS1-209ENST00000488033 CYP39A1Q9NYL5 469 aa16.05■□□□□ 0.16
HCLS1-209ENST00000488033 TRIOO75962 3097 aa16.05■□□□□ 0.16
HCLS1-209ENST00000488033 TTLL1O95922 423 aa16.04■□□□□ 0.16
HCLS1-209ENST00000488033 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
HCLS1-209ENST00000488033 MUM1L1Q5H9M0 696 aa16.04■□□□□ 0.16
HCLS1-209ENST00000488033 NFRKBQ6P4R8 1299 aa16.04■□□□□ 0.16
HCLS1-209ENST00000488033 FAM160B2Q86V87 743 aa16.04■□□□□ 0.16
HCLS1-209ENST00000488033 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
HCLS1-209ENST00000488033 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa16.04■□□□□ 0.16
HCLS1-209ENST00000488033 GRXCR2A6NFK2 248 aa16.03■□□□□ 0.16
HCLS1-209ENST00000488033 PRDM1O75626 825 aa16.03■□□□□ 0.16
HCLS1-209ENST00000488033 CHMP4BP1P59074 171 aa16.03■□□□□ 0.16
HCLS1-209ENST00000488033 SNAP25P60880 206 aa16.03■□□□□ 0.16
HCLS1-209ENST00000488033 ERVK-21P61565 698 aa16.03■□□□□ 0.16
HCLS1-209ENST00000488033 DEFB103AP81534 67 aa16.03■□□□□ 0.16
HCLS1-209ENST00000488033 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
HCLS1-209ENST00000488033 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa16.03■□□□□ 0.16
HCLS1-209ENST00000488033 MORC4Q8TE76 937 aa16.03■□□□□ 0.16
HCLS1-209ENST00000488033 STAG1Q8WVM7 1258 aa16.03■□□□□ 0.16
HCLS1-209ENST00000488033 CRBNQ96SW2 442 aa16.03■□□□□ 0.16
HCLS1-209ENST00000488033 RAD9AQ99638 391 aa16.03■□□□□ 0.16
HCLS1-209ENST00000488033 HAUS7Q99871 368 aa16.03■□□□□ 0.16
HCLS1-209ENST00000488033 LCTP09848 1927 aa16.03■□□□□ 0.16
HCLS1-209ENST00000488033 SIP14410 1827 aa16.03■□□□□ 0.16
HCLS1-209ENST00000488033 RLBP1P12271 317 aa16.02■□□□□ 0.16
HCLS1-209ENST00000488033 ATP5JP18859 108 aa16.02■□□□□ 0.16
HCLS1-209ENST00000488033 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
HCLS1-209ENST00000488033 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
HCLS1-209ENST00000488033 CCDC155Q8N6L0 562 aa16.02■□□□□ 0.16
HCLS1-209ENST00000488033 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
HCLS1-209ENST00000488033 ZNF287Q9HBT7 754 aa16.02■□□□□ 0.16
HCLS1-209ENST00000488033 RAD50Q92878 1312 aa16.01■□□□□ 0.15
HCLS1-209ENST00000488033 POTEB3A0JP26 581 aa16.01■□□□□ 0.15
HCLS1-209ENST00000488033 LINC01553A4QN01 128 aa16.01■□□□□ 0.15
HCLS1-209ENST00000488033 GSG1L2A8MUP6 293 aa16.01■□□□□ 0.15
HCLS1-209ENST00000488033 GJB5O95377 273 aa16.01■□□□□ 0.15
HCLS1-209ENST00000488033 SLC1A4P43007 532 aa16.01■□□□□ 0.15
HCLS1-209ENST00000488033 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
HCLS1-209ENST00000488033 GIMAP6Q6P9H5 292 aa16.01■□□□□ 0.15
HCLS1-209ENST00000488033 POTEBQ6S5H4 581 aa16.01■□□□□ 0.15
HCLS1-209ENST00000488033 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
HCLS1-209ENST00000488033 ZNF318Q5VUA4 2279 aa16.01■□□□□ 0.15
HCLS1-209ENST00000488033 USP34Q70CQ2 3546 aa16.01■□□□□ 0.15
HCLS1-209ENST00000488033 C5orf42Q9H799 3197 aa16■□□□□ 0.15
HCLS1-209ENST00000488033 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
HCLS1-209ENST00000488033 H3BQ06 376 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
HCLS1-209ENST00000488033 KPNA6O60684 536 aa16■□□□□ 0.15
HCLS1-209ENST00000488033 TSPY3P0CV98 308 aa16■□□□□ 0.15
HCLS1-209ENST00000488033 TSPY8P0CW00 308 aa16■□□□□ 0.15
HCLS1-209ENST00000488033 MCCP23508 829 aa16■□□□□ 0.15
HCLS1-209ENST00000488033 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
HCLS1-209ENST00000488033 PTGISQ16647 500 aa16■□□□□ 0.15
HCLS1-209ENST00000488033 FAM117BQ6P1L5 589 aa16■□□□□ 0.15
HCLS1-209ENST00000488033 CNKSR3Q6P9H4 555 aa16■□□□□ 0.15
HCLS1-209ENST00000488033 CAGE1Q8TC20 777 aa16■□□□□ 0.15
HCLS1-209ENST00000488033 AFAP1L1Q8TED9 768 aa16■□□□□ 0.15
HCLS1-209ENST00000488033 CCPG1Q9ULG6 757 aa16■□□□□ 0.15
HCLS1-209ENST00000488033 TDO2P48775 406 aa15.99■□□□□ 0.15
HCLS1-209ENST00000488033 GPNMBQ14956 572 aa15.99■□□□□ 0.15
HCLS1-209ENST00000488033 PPP2R5BQ15173 497 aa15.99■□□□□ 0.15
HCLS1-209ENST00000488033 EP400NLQ6ZTU2 488 aa15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.9 ms