RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486679.2

MYCBP2-208, Transcript of MYC binding protein 2, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 3

Gene MYCBP2, Length 545 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MYCBP2-208	ENST00000486679	CUL7	Q14999	1698 aa		7.02	□□□□□ -1.29
MYCBP2-208	ENST00000486679	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		7.02	□□□□□ -1.29
MYCBP2-208	ENST00000486679	ANKRD34B	A5PLL1	514 aa		7.01	□□□□□ -1.29
MYCBP2-208	ENST00000486679	SMAD7	O15105	426 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
MYCBP2-208	ENST00000486679	NUAK1	O60285	661 aa		7.01	□□□□□ -1.29
MYCBP2-208	ENST00000486679	NAT2	P11245	290 aa		7.01	□□□□□ -1.29
MYCBP2-208	ENST00000486679	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		7.01	□□□□□ -1.29
MYCBP2-208	ENST00000486679	TMEM52	Q8NDY8	209 aa		7.01	□□□□□ -1.29
MYCBP2-208	ENST00000486679	KLHL6	Q8WZ60	621 aa		7.01	□□□□□ -1.29
MYCBP2-208	ENST00000486679	ARMC5	Q96C12	935 aa		7.01	□□□□□ -1.29
MYCBP2-208	ENST00000486679	PTCHD1	Q96NR3	888 aa		7.01	□□□□□ -1.29
MYCBP2-208	ENST00000486679	CGGBP1	Q9UFW8	167 aa	Predicted RBP	7.01	□□□□□ -1.29
MYCBP2-208	ENST00000486679	AKT3	Q9Y243	479 aa		7.01	□□□□□ -1.29
MYCBP2-208	ENST00000486679	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		7	□□□□□ -1.29
MYCBP2-208	ENST00000486679	TEX51	A0A1B0GUA7	166 aa		7	□□□□□ -1.29
MYCBP2-208	ENST00000486679	ABLIM1	O14639	778 aa		7	□□□□□ -1.29
MYCBP2-208	ENST00000486679	FGF10	O15520	208 aa	Predicted RBP	7	□□□□□ -1.29
MYCBP2-208	ENST00000486679	KRT1	P04264	644 aa		7	□□□□□ -1.29
MYCBP2-208	ENST00000486679	TACR1	P25103	407 aa		7	□□□□□ -1.29
MYCBP2-208	ENST00000486679	TMEM62	Q0P6H9	643 aa		7	□□□□□ -1.29
MYCBP2-208	ENST00000486679	BICRAL	Q6AI39	1079 aa		7	□□□□□ -1.29
MYCBP2-208	ENST00000486679	APBA2	Q99767	749 aa		7	□□□□□ -1.29
MYCBP2-208	ENST00000486679	CD320	Q9NPF0	282 aa		7	□□□□□ -1.29
MYCBP2-208	ENST00000486679	ACTR10	Q9NZ32	417 aa		7	□□□□□ -1.29
MYCBP2-208	ENST00000486679	CNOT6	Q9ULM6	557 aa	Known RBP	7	□□□□□ -1.29
MYCBP2-208	ENST00000486679	R3HCC1	Q9Y3T6	440 aa	Known RBP	7	□□□□□ -1.29
MYCBP2-208	ENST00000486679	MAP3K1	Q13233	1512 aa		7	□□□□□ -1.29
MYCBP2-208	ENST00000486679	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		6.99	□□□□□ -1.29
MYCBP2-208	ENST00000486679	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
MYCBP2-208	ENST00000486679	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
MYCBP2-208	ENST00000486679	KCNH1	O95259	989 aa		6.99	□□□□□ -1.29
MYCBP2-208	ENST00000486679	MED14OS	P0DP75	135 aa		6.99	□□□□□ -1.29
MYCBP2-208	ENST00000486679	CFP	P27918	469 aa		6.99	□□□□□ -1.29
MYCBP2-208	ENST00000486679	DNAJA1	P31689	397 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
MYCBP2-208	ENST00000486679	VIPR1	P32241	457 aa		6.99	□□□□□ -1.29
MYCBP2-208	ENST00000486679	LINC00310	P59036	64 aa		6.99	□□□□□ -1.29
MYCBP2-208	ENST00000486679	ERVFRD-1	P60508	538 aa		6.99	□□□□□ -1.29
MYCBP2-208	ENST00000486679	ARID5A	Q03989	594 aa		6.99	□□□□□ -1.29
MYCBP2-208	ENST00000486679	NCAPH	Q15003	741 aa		6.99	□□□□□ -1.29
MYCBP2-208	ENST00000486679	TNNI3K	Q59H18	835 aa		6.99	□□□□□ -1.29
MYCBP2-208	ENST00000486679	EEF1DP3	Q658K8	133 aa		6.99	□□□□□ -1.29
MYCBP2-208	ENST00000486679	TMC6	Q7Z403	805 aa		6.99	□□□□□ -1.29
MYCBP2-208	ENST00000486679	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
MYCBP2-208	ENST00000486679	IRF2BPL	Q9H1B7	796 aa		6.99	□□□□□ -1.29
MYCBP2-208	ENST00000486679	DBR1	Q9UK59	544 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
MYCBP2-208	ENST00000486679	ACSL6	Q9UKU0	697 aa		6.99	□□□□□ -1.29
MYCBP2-208	ENST00000486679	C2orf71	A6NGG8	1288 aa		6.98	□□□□□ -1.29
MYCBP2-208	ENST00000486679	DDAH1	O94760	285 aa		6.98	□□□□□ -1.29
MYCBP2-208	ENST00000486679	L1CAM	P32004	1257 aa		6.98	□□□□□ -1.29
MYCBP2-208	ENST00000486679	POMZP3	Q6PJE2	187 aa		6.98	□□□□□ -1.29
MYCBP2-208	ENST00000486679	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		6.98	□□□□□ -1.29
MYCBP2-208	ENST00000486679	TINF2	Q9BSI4	451 aa		6.98	□□□□□ -1.29
MYCBP2-208	ENST00000486679	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		6.98	□□□□□ -1.29
MYCBP2-208	ENST00000486679	APEX2	Q9UBZ4	518 aa		6.98	□□□□□ -1.29
MYCBP2-208	ENST00000486679	BACE2	Q9Y5Z0	518 aa		6.98	□□□□□ -1.29
MYCBP2-208	ENST00000486679	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		6.97	□□□□□ -1.29
MYCBP2-208	ENST00000486679	WDR62	O43379	1518 aa		6.97	□□□□□ -1.29
MYCBP2-208	ENST00000486679	RFXAP	O00287	272 aa		6.97	□□□□□ -1.29
MYCBP2-208	ENST00000486679	AURKA	O14965	403 aa		6.97	□□□□□ -1.29
MYCBP2-208	ENST00000486679	MSL3P1	P0C860	447 aa		6.97	□□□□□ -1.29
MYCBP2-208	ENST00000486679	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
MYCBP2-208	ENST00000486679	MVK	Q03426	396 aa		6.97	□□□□□ -1.29
MYCBP2-208	ENST00000486679	SOGA3	Q5TF21	947 aa		6.97	□□□□□ -1.29
MYCBP2-208	ENST00000486679	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		6.97	□□□□□ -1.29
MYCBP2-208	ENST00000486679	C6orf15	Q6UXA7	325 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
MYCBP2-208	ENST00000486679	ARHGEF39	Q8N4T4	335 aa		6.97	□□□□□ -1.29
MYCBP2-208	ENST00000486679	RCC1L	Q96I51	464 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
MYCBP2-208	ENST00000486679	MCMBP	Q9BTE3	642 aa		6.97	□□□□□ -1.29
MYCBP2-208	ENST00000486679	IRAK3	Q9Y616	596 aa		6.97	□□□□□ -1.29
MYCBP2-208	ENST00000486679	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
MYCBP2-208	ENST00000486679	NPHP3-ACAD11	A0A0J9YXS1	232 aa		6.96	□□□□□ -1.3
MYCBP2-208	ENST00000486679	ANKRD62	A6NC57	917 aa		6.96	□□□□□ -1.3
MYCBP2-208	ENST00000486679	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	6.96	□□□□□ -1.3
MYCBP2-208	ENST00000486679	ETFB	P38117	255 aa		6.96	□□□□□ -1.3
MYCBP2-208	ENST00000486679	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
MYCBP2-208	ENST00000486679	GRB10	Q13322	594 aa		6.96	□□□□□ -1.3
MYCBP2-208	ENST00000486679	SV2C	Q496J9	727 aa		6.96	□□□□□ -1.3
MYCBP2-208	ENST00000486679	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		6.96	□□□□□ -1.3
MYCBP2-208	ENST00000486679	RPTN	Q6XPR3	784 aa		6.96	□□□□□ -1.3
MYCBP2-208	ENST00000486679	CABP7	Q86V35	215 aa		6.96	□□□□□ -1.3
MYCBP2-208	ENST00000486679	BVES	Q8NE79	360 aa		6.96	□□□□□ -1.3
MYCBP2-208	ENST00000486679	USP33	Q8TEY7	942 aa		6.96	□□□□□ -1.3
MYCBP2-208	ENST00000486679	GML	Q99445	158 aa		6.96	□□□□□ -1.3
MYCBP2-208	ENST00000486679	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
MYCBP2-208	ENST00000486679	TNFRSF12A	Q9NP84	129 aa		6.96	□□□□□ -1.3
MYCBP2-208	ENST00000486679	PDLIM7	Q9NR12	457 aa		6.96	□□□□□ -1.3
MYCBP2-208	ENST00000486679	KLHL14	Q9P2G3	628 aa		6.96	□□□□□ -1.3
MYCBP2-208	ENST00000486679	SUSD2	Q9UGT4	822 aa		6.96	□□□□□ -1.3
MYCBP2-208	ENST00000486679	MBD1	Q9UIS9	605 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
MYCBP2-208	ENST00000486679	TMA7	Q9Y2S6	64 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
MYCBP2-208	ENST00000486679	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	6.96	□□□□□ -1.3
MYCBP2-208	ENST00000486679	ARID1B	Q8NFD5	2236 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
MYCBP2-208	ENST00000486679		B2RBV5	119 aa		6.95	□□□□□ -1.3
MYCBP2-208	ENST00000486679	HRK	O00198	91 aa		6.95	□□□□□ -1.3
MYCBP2-208	ENST00000486679	PAM	P19021	973 aa		6.95	□□□□□ -1.3
MYCBP2-208	ENST00000486679	EPHB3	P54753	998 aa		6.95	□□□□□ -1.3
MYCBP2-208	ENST00000486679	YBX1	P67809	324 aa	Known RBP	6.95	□□□□□ -1.3
MYCBP2-208	ENST00000486679	NR1I3	Q14994	352 aa		6.95	□□□□□ -1.3
MYCBP2-208	ENST00000486679	ZNF385B	Q569K4	471 aa		6.95	□□□□□ -1.3
MYCBP2-208	ENST00000486679	ZC3H14	Q6PJT7	736 aa	Known RBP	6.95	□□□□□ -1.3

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.6 ms