RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480273.5

RTEL1-TNFRSF6B-201, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 2

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 5,751 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CPXCR1Q8N123 301 aa18.76■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PARD6BQ9BYG5 372 aa18.76■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 STAM2O75886 525 aa18.76■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RPS8P62241 208 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLC39A14Q15043 492 aa18.76■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PCDHA12Q9UN75 941 aa18.76■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GINS2Q9Y248 185 aa18.76■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 UNC13BO14795 1591 aa18.76■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ALDH1B1P30837 517 aa18.76■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SERPINB6P35237 376 aa18.76■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KRT27Q7Z3Y8 459 aa18.76■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 BBOF1Q8ND07 529 aa18.76■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa18.76■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TMOD4Q9NZQ9 345 aa18.76■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RPS6KA2Q15349 733 aa18.75■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MIER3Q7Z3K6 550 aa18.75■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MAP4K1Q92918 833 aa18.75■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PICK1Q9NRD5 415 aa18.75■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ALKQ9UM73 1620 aa18.75■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PRR16Q569H4 304 aa18.75■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ST7Q9NRC1 585 aa18.75■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CARMIL3Q8ND23 1372 aa18.75■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SMIM24O75264 130 aa18.75■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 IL9RQ01113 521 aa18.75■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TCP10Q12799 353 aa18.75■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DIXDC1Q155Q3 683 aa18.75■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HADHQ16836 314 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SDR42E1Q8WUS8 393 aa18.75■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ERBB4Q15303 1308 aa18.74■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KCNQ4P56696 695 aa18.74■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DBN1Q16643 649 aa18.74■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 EEF2KMTQ96G04 330 aa18.74■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 IWS1Q96ST2 819 aa18.74■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 AZI2Q9H6S1 392 aa18.74■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NSMCE1Q8WV22 266 aa18.74■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa18.74■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PDE6BP35913 854 aa18.74■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PROSER3Q2NL68 480 aa18.74■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SCYL2Q6P3W7 929 aa18.74■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GSDMAQ96QA5 445 aa18.74■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa18.74■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 K7ENM7 598 aa18.74■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KAZNQ674X7 775 aa18.74■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TCP11Q8WWU5 503 aa18.74■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa18.74■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SOWAHDA6NJG2 315 aa18.74■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZBED4O75132 1171 aa18.74■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PDE6AP16499 860 aa18.74■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ACRBPQ8NEB7 543 aa18.74■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ANTXR1Q9H6X2 564 aa18.74■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PSTPIP2Q9H939 334 aa18.74■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa18.74■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa18.73■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NSMFQ6X4W1 530 aa18.73■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 BFSP1Q12934 665 aa18.73■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 STAP2Q9UGK3 403 aa18.73■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ADGRB3O60242 1522 aa18.73■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CCDC93Q567U6 631 aa18.73■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLFN12Q8IYM2 578 aa18.73■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RUNDC3BQ96NL0 473 aa18.73■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DDAH1O94760 285 aa18.73■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 EXOC4Q96A65 974 aa18.73■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 C1orf112Q9NSG2 853 aa18.73■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 POLR3EQ9NVU0 708 aa18.73■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF148Q9UQR1 794 aa18.73■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa18.72■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 EXOC3L4Q17RC7 722 aa18.72■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FAM26FQ5R3K3 315 aa18.72■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OTUD6AQ7L8S5 288 aa18.72■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GOLGA8HP0CJ92 632 aa18.72■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 P4HA1P13674 534 aa18.72■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SUPT20HQ8NEM7 779 aa18.72■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HVCN1Q96D96 273 aa18.72■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SCYL1Q96KG9 808 aa18.72■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MAN1B1Q9UKM7 699 aa18.72■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GALNT17Q6IS24 598 aa18.72■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PNMA1Q8ND90 353 aa18.72■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TRPC6Q9Y210 931 aa18.72■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SEPT12Q8IYM1 358 aa18.72■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NNTQ13423 1086 aa18.72■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PPM1KQ8N3J5 372 aa18.72■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DEPTORQ8TB45 409 aa18.72■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LRRC43Q8N309 656 aa18.71■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms