RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475959.1

GTPBP1-208, Transcript of GTP binding protein 1, human

TSL 2

Gene GTPBP1, Length 475 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GTPBP1-208	ENST00000475959	LRRC26	Q2I0M4	334 aa		12.92	□□□□□ -0.34
GTPBP1-208	ENST00000475959	CCDC144B	Q3MJ40	725 aa		12.92	□□□□□ -0.34
GTPBP1-208	ENST00000475959	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	12.92	□□□□□ -0.34
GTPBP1-208	ENST00000475959	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	12.92	□□□□□ -0.34
GTPBP1-208	ENST00000475959	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	12.92	□□□□□ -0.34
GTPBP1-208	ENST00000475959	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	12.92	□□□□□ -0.34
GTPBP1-208	ENST00000475959	AMN	Q9BXJ7	453 aa		12.92	□□□□□ -0.34
GTPBP1-208	ENST00000475959	ABHD16B	Q9H3Z7	469 aa		12.92	□□□□□ -0.34
GTPBP1-208	ENST00000475959	ASB14	A6NK59	587 aa		12.91	□□□□□ -0.34
GTPBP1-208	ENST00000475959		H0YGN5	161 aa		12.91	□□□□□ -0.34
GTPBP1-208	ENST00000475959	CTAGE5	O15320	804 aa		12.91	□□□□□ -0.34
GTPBP1-208	ENST00000475959	RARB	P10826	455 aa		12.91	□□□□□ -0.34
GTPBP1-208	ENST00000475959	EDNRB	P24530	442 aa		12.91	□□□□□ -0.34
GTPBP1-208	ENST00000475959	KRT32	Q14532	448 aa		12.91	□□□□□ -0.34
GTPBP1-208	ENST00000475959	TAPT1	Q6NXT6	567 aa		12.91	□□□□□ -0.34
GTPBP1-208	ENST00000475959	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		12.91	□□□□□ -0.34
GTPBP1-208	ENST00000475959	C7orf61	Q8IZ16	206 aa		12.91	□□□□□ -0.34
GTPBP1-208	ENST00000475959	DPF3	Q92784	378 aa		12.91	□□□□□ -0.34
GTPBP1-208	ENST00000475959	TAAR1	Q96RJ0	339 aa		12.91	□□□□□ -0.34
GTPBP1-208	ENST00000475959	MAP3K14	Q99558	947 aa		12.91	□□□□□ -0.34
GTPBP1-208	ENST00000475959	HTATIP2	Q9BUP3	242 aa		12.91	□□□□□ -0.34
GTPBP1-208	ENST00000475959	SPZ1	Q9BXG8	430 aa		12.91	□□□□□ -0.34
GTPBP1-208	ENST00000475959	USP26	Q9BXU7	913 aa		12.91	□□□□□ -0.34
GTPBP1-208	ENST00000475959	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		12.91	□□□□□ -0.34
GTPBP1-208	ENST00000475959	CEP290	O15078	2479 aa		12.9	□□□□□ -0.34
GTPBP1-208	ENST00000475959	MYH7B	A7E2Y1	1941 aa		12.9	□□□□□ -0.34
GTPBP1-208	ENST00000475959	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		12.9	□□□□□ -0.34
GTPBP1-208	ENST00000475959	CFB	P00751	764 aa		12.9	□□□□□ -0.34
GTPBP1-208	ENST00000475959	SMPD1	P17405	629 aa		12.9	□□□□□ -0.34
GTPBP1-208	ENST00000475959	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	12.9	□□□□□ -0.34
GTPBP1-208	ENST00000475959	RPS6KB1	P23443	525 aa		12.9	□□□□□ -0.34
GTPBP1-208	ENST00000475959	CDC27	P30260	824 aa		12.9	□□□□□ -0.34
GTPBP1-208	ENST00000475959	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	12.9	□□□□□ -0.34
GTPBP1-208	ENST00000475959	HSD17B4	P51659	736 aa		12.9	□□□□□ -0.34
GTPBP1-208	ENST00000475959	ATN1	P54259	1190 aa	Predicted RBP	12.9	□□□□□ -0.34
GTPBP1-208	ENST00000475959	GHRHR	Q02643	423 aa		12.9	□□□□□ -0.34
GTPBP1-208	ENST00000475959	APOBR	Q0VD83	1088 aa		12.9	□□□□□ -0.34
GTPBP1-208	ENST00000475959		Q6ZUG5	572 aa		12.9	□□□□□ -0.34
GTPBP1-208	ENST00000475959	IL31RA	Q8NI17	732 aa		12.9	□□□□□ -0.34
GTPBP1-208	ENST00000475959	FERMT2	Q96AC1	680 aa		12.9	□□□□□ -0.34
GTPBP1-208	ENST00000475959	SENP6	Q9GZR1	1112 aa	Predicted RBP	12.9	□□□□□ -0.34
GTPBP1-208	ENST00000475959	FAM217B	Q9NTX9	383 aa	Predicted RBP	12.9	□□□□□ -0.34
GTPBP1-208	ENST00000475959	PNMA2	Q9UL42	364 aa		12.9	□□□□□ -0.34
GTPBP1-208	ENST00000475959	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		12.9	□□□□□ -0.34
GTPBP1-208	ENST00000475959	MRPL11	Q9Y3B7	192 aa	Known RBP	12.9	□□□□□ -0.34
GTPBP1-208	ENST00000475959	PCDHA1	Q9Y5I3	950 aa		12.9	□□□□□ -0.34
GTPBP1-208	ENST00000475959	PNMA6F	A0A0J9YX94	578 aa		12.89	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	KBTBD13	C9JR72	458 aa		12.89	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	CAPN2	P17655	700 aa		12.89	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	KIF5B	P33176	963 aa		12.89	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	BEX3	Q00994	111 aa		12.89	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	FUT2	Q10981	343 aa		12.89	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	12.89	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		12.89	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	CCDC82	Q8N4S0	544 aa		12.89	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	RGS22	Q8NE09	1264 aa		12.89	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	GPKOW	Q92917	476 aa	Predicted RBP eCLIP	12.89	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	BRF1	Q92994	677 aa		12.89	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	UPF3A	Q9H1J1	476 aa	Known RBP	12.89	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	ADD3	Q9UEY8	706 aa	Known RBP	12.89	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	12.89	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	PHF24	Q9UPV7	400 aa		12.89	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	GNE	Q9Y223	722 aa	Known RBP	12.89	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	NID2	Q14112	1375 aa		12.89	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959		A0A1W2PQ45	241 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959		A0A1W2PQY0	241 aa		12.88	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		12.88	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		12.88	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	DUSP11	O75319	330 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	ARIH2	O95376	493 aa		12.88	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	SEC24B	O95487	1268 aa		12.88	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	C6orf222	P0C671	652 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	CALM1	P0DP23	149 aa		12.88	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	CALM2	P0DP24	149 aa		12.88	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	CALM3	P0DP25	149 aa		12.88	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	SYN1	P17600	705 aa		12.88	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	TLK2	Q86UE8	772 aa		12.88	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	TMTC2	Q8N394	836 aa		12.88	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	FANCB	Q8NB91	859 aa		12.88	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	KLHDC9	Q8NEP7	349 aa		12.88	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	DNER	Q8NFT8	737 aa		12.88	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		12.88	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	VTA1	Q9NP79	307 aa		12.88	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		12.87	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZBTB43	O43298	467 aa		12.87	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	EVI5	O60447	810 aa		12.87	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	CST5	P28325	142 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	GJA9	P57773	515 aa		12.87	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	RTP1	P59025	263 aa		12.87	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	TNFAIP2	Q03169	654 aa		12.87	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	PDE4D	Q08499	809 aa		12.87	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	RTN1	Q16799	776 aa		12.87	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	TYW1B	Q6NUM6	668 aa		12.87	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		12.87	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	ARRDC4	Q8NCT1	418 aa		12.87	□□□□□ -0.35
GTPBP1-208	ENST00000475959	COPS5	Q92905	334 aa		12.87	□□□□□ -0.35

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