RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464611.1

ACTB-208, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 715 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-208ENST00000464611 ADKP55263 362 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 CBX1P83916 185 aa9.55□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 CDK17Q00537 523 aa9.55□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 GPS2Q13227 327 aa9.55□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 KCNJ12Q14500 433 aa9.55□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 KRT31Q15323 416 aa9.55□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 ELF2Q15723 593 aa9.55□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa9.55□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 TMEM266Q2M3C6 531 aa9.55□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 KMT5BQ4FZB7 885 aa9.55□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa9.55□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 TEX35Q5T0J7 233 aa9.55□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 KLHL10Q6JEL2 608 aa9.55□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 NEK8Q86SG6 692 aa9.55□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 CCDC170Q8IYT3 715 aa9.55□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 KCTD17Q8N5Z5 321 aa9.55□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 RASSF8Q8NHQ8 419 aa9.55□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 SHISA4Q96DD7 197 aa9.55□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 MED15Q96RN5 788 aa9.55□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 EYA3Q99504 573 aa9.55□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 MRIQ9BWK5 157 aa9.55□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 EDEM3Q9BZQ6 932 aa9.55□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 TAOK3Q9H2K8 898 aa9.55□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 HAUS4Q9H6D7 363 aa9.55□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 RIOX1Q9H6W3 641 aa9.55□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 CD209Q9NNX6 404 aa9.55□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 CDC23Q9UJX2 597 aa9.55□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 MRFAP1Q9Y605 127 aa9.55□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 LTBP3Q9NS15 1303 aa9.55□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 A0A1W2PQJ5 194 aa9.54□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 FAM205CA6NFA0 338 aa9.54□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 C21orf2O43822 256 aa9.54□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 GRIN3BO60391 1043 aa9.54□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 CCNE1P24864 410 aa9.54□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 NAPAP54920 295 aa9.54□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 PPP2R3AQ06190 1150 aa9.54□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa9.54□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa9.54□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa9.54□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa9.54□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 CABP7Q86V35 215 aa9.54□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 TEX11Q8IYF3 940 aa9.54□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa9.54□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa9.54□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 CCDC17Q96LX7 622 aa9.54□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 PSMD1Q99460 953 aa9.54□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 COA1Q9GZY4 146 aa9.54□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 ZMYND15Q9H091 742 aa9.54□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 ABHD10Q9NUJ1 306 aa9.54□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 CAPN11Q9UMQ6 739 aa9.54□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 STX8Q9UNK0 236 aa9.54□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 CTNND2Q9UQB3 1225 aa9.54□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 V9GYY5 206 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 CCDC151A5D8V7 595 aa9.53□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 SMCO2A6NFE2 343 aa9.53□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 LGALS16A8MUM7 142 aa9.53□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 TEX33O43247 280 aa9.53□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 NMT2O60551 498 aa9.53□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 UFL1O94874 794 aa9.53□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 CYP2D6P10635 497 aa9.53□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 CASP14P31944 242 aa9.53□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 PRCPP42785 496 aa9.53□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 BTDP43251 543 aa9.53□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 GPSM2P81274 684 aa9.53□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 UBXN1Q04323 297 aa9.53□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 TRAF1Q13077 416 aa9.53□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 GPR162Q16538 588 aa9.53□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 IL17AQ16552 155 aa9.53□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 FKBP15Q5T1M5 1219 aa9.53□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 PPP4R3AQ6IN85 833 aa9.53□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 SV2BQ7L1I2 683 aa9.53□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 MB21D1Q8N884 522 aa9.53□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 C7orf43Q8WVR3 580 aa9.53□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 KIFC2Q96AC6 838 aa9.53□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 DNAJC7Q99615 494 aa9.53□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 CARD6Q9BX69 1037 aa9.53□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 VPS33BQ9H267 617 aa9.53□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 ARFGAP3Q9NP61 516 aa9.53□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 RIC8AQ9NPQ8 531 aa9.53□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 EXOC1Q9NV70 894 aa9.53□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
ACTB-208ENST00000464611 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa9.52□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 KRT86O43790 486 aa9.52□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 GYPCP04921 128 aa9.52□□□□□ -0.89
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