RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464168.5

USP4-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

TSL 4

Gene USP4, Length 601 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4-208ENST00000464168 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
USP4-208ENST00000464168 CCL23P55773 120 aa26.67■■□□□ 1.86
USP4-208ENST00000464168 PRDM12Q9H4Q4 367 aa26.67■■□□□ 1.86
USP4-208ENST00000464168 MUC3AQ02505 3323 aa26.67■■□□□ 1.86
USP4-208ENST00000464168 CLEC4DQ8WXI8 215 aa26.66■■□□□ 1.86
USP4-208ENST00000464168 WDR11Q9BZH6 1224 aa26.66■■□□□ 1.86
USP4-208ENST00000464168 WNT8AQ9H1J5 351 aa26.66■■□□□ 1.86
USP4-208ENST00000464168 LCTP09848 1927 aa26.66■■□□□ 1.86
USP4-208ENST00000464168 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa26.65■■□□□ 1.86
USP4-208ENST00000464168 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
USP4-208ENST00000464168 RRP1P56182 461 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
USP4-208ENST00000464168 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
USP4-208ENST00000464168 RAB30Q15771 203 aa26.65■■□□□ 1.86
USP4-208ENST00000464168 OTOP2Q7RTS6 562 aa26.65■■□□□ 1.86
USP4-208ENST00000464168 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
USP4-208ENST00000464168 VWCEQ96DN2 955 aa26.65■■□□□ 1.86
USP4-208ENST00000464168 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
USP4-208ENST00000464168 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
USP4-208ENST00000464168 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
USP4-208ENST00000464168 MSRAQ9UJ68 235 aa26.65■■□□□ 1.86
USP4-208ENST00000464168 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
USP4-208ENST00000464168 PTPDC1A2A3K4 754 aa26.64■■□□□ 1.86
USP4-208ENST00000464168 PDHBP11177 359 aa26.64■■□□□ 1.86
USP4-208ENST00000464168 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
USP4-208ENST00000464168 TICAM2Q86XR7 235 aa26.64■■□□□ 1.86
USP4-208ENST00000464168 CRBNQ96SW2 442 aa26.64■■□□□ 1.86
USP4-208ENST00000464168 HAND2P61296 217 aa26.63■■□□□ 1.85
USP4-208ENST00000464168 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
USP4-208ENST00000464168 SLC30A10Q6XR72 485 aa26.63■■□□□ 1.85
USP4-208ENST00000464168 PRDM6Q9NQX0 595 aa26.63■■□□□ 1.85
USP4-208ENST00000464168 ZMYM6O95789 1325 aa26.63■■□□□ 1.85
USP4-208ENST00000464168 CALML3P27482 149 aa26.62■■□□□ 1.85
USP4-208ENST00000464168 ZNF543Q08ER8 600 aa26.62■■□□□ 1.85
USP4-208ENST00000464168 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
USP4-208ENST00000464168 ADGRE1Q14246 886 aa26.62■■□□□ 1.85
USP4-208ENST00000464168 AKNAD1Q5T1N1 836 aa26.62■■□□□ 1.85
USP4-208ENST00000464168 TTC14Q96N46 770 aa26.62■■□□□ 1.85
USP4-208ENST00000464168 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa26.62■■□□□ 1.85
USP4-208ENST00000464168 POLR3EQ9NVU0 708 aa26.62■■□□□ 1.85
USP4-208ENST00000464168 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
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USP4-208ENST00000464168 TJAP1Q5JTD0 557 aa26.61■■□□□ 1.85
USP4-208ENST00000464168 RNF207Q6ZRF8 634 aa26.61■■□□□ 1.85
USP4-208ENST00000464168 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
USP4-208ENST00000464168 PPM1EQ8WY54 764 aa26.61■■□□□ 1.85
USP4-208ENST00000464168 SCLYQ96I15 445 aa26.61■■□□□ 1.85
USP4-208ENST00000464168 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
USP4-208ENST00000464168 PNMA2Q9UL42 364 aa26.61■■□□□ 1.85
USP4-208ENST00000464168 SNHG28P0DPA3 235 aa26.6■■□□□ 1.85
USP4-208ENST00000464168 CPT1AP50416 773 aa26.6■■□□□ 1.85
USP4-208ENST00000464168 RPS6P62753 249 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
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USP4-208ENST00000464168 SLC28A3Q9HAS3 691 aa26.6■■□□□ 1.85
USP4-208ENST00000464168 MYL3P08590 195 aa26.59■■□□□ 1.85
USP4-208ENST00000464168 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa26.59■■□□□ 1.85
USP4-208ENST00000464168 CYP2C9P11712 490 aa26.59■■□□□ 1.85
USP4-208ENST00000464168 EDNRBP24530 442 aa26.59■■□□□ 1.85
USP4-208ENST00000464168 TBC1D10CQ8IV04 446 aa26.59■■□□□ 1.85
USP4-208ENST00000464168 OR6J1Q8NGC5 347 aa26.59■■□□□ 1.85
USP4-208ENST00000464168 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa26.59■■□□□ 1.85
USP4-208ENST00000464168 TNKSO95271 1327 aa26.59■■□□□ 1.85
USP4-208ENST00000464168 CCDC171Q6TFL3 1326 aa26.59■■□□□ 1.85
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USP4-208ENST00000464168 RABGGTBP53611 331 aa26.58■■□□□ 1.85
USP4-208ENST00000464168 PDE4DQ08499 809 aa26.58■■□□□ 1.85
USP4-208ENST00000464168 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
USP4-208ENST00000464168 WDR19Q8NEZ3 1342 aa26.58■■□□□ 1.85
USP4-208ENST00000464168 DNERQ8NFT8 737 aa26.57■■□□□ 1.84
USP4-208ENST00000464168 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
USP4-208ENST00000464168 NCOR1O75376 2440 aa26.56■■□□□ 1.84
USP4-208ENST00000464168 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa26.56■■□□□ 1.84
USP4-208ENST00000464168 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP26.56■■□□□ 1.84
USP4-208ENST00000464168 IGFBP4P22692 258 aa26.56■■□□□ 1.84
USP4-208ENST00000464168 PPP2R5BQ15173 497 aa26.56■■□□□ 1.84
USP4-208ENST00000464168 NBPF20Q3BBV1 942 aa26.56■■□□□ 1.84
USP4-208ENST00000464168 SCFD2Q8WU76 684 aa26.56■■□□□ 1.84
USP4-208ENST00000464168 COPS5Q92905 334 aa26.56■■□□□ 1.84
USP4-208ENST00000464168 LNPKQ9C0E8 428 aa26.56■■□□□ 1.84
USP4-208ENST00000464168 BDP1A6H8Y1 2624 aa26.55■■□□□ 1.84
USP4-208ENST00000464168 A6NJR5 290 aa26.55■■□□□ 1.84
USP4-208ENST00000464168 GOLGA8HP0CJ92 632 aa26.55■■□□□ 1.84
USP4-208ENST00000464168 MYOGP15173 224 aa26.55■■□□□ 1.84
USP4-208ENST00000464168 TTLL4Q14679 1199 aa26.55■■□□□ 1.84
USP4-208ENST00000464168 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
USP4-208ENST00000464168 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
USP4-208ENST00000464168 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
USP4-208ENST00000464168 RILPL2Q969X0 211 aa26.55■■□□□ 1.84
USP4-208ENST00000464168 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa26.55■■□□□ 1.84
USP4-208ENST00000464168 TRANK1O15050 2925 aa26.54■■□□□ 1.84
USP4-208ENST00000464168 ZBBXA8MT70 800 aa26.54■■□□□ 1.84
USP4-208ENST00000464168 PFKMP08237 780 aa26.54■■□□□ 1.84
USP4-208ENST00000464168 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
USP4-208ENST00000464168 RGS22Q8NE09 1264 aa26.54■■□□□ 1.84
USP4-208ENST00000464168 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa26.54■■□□□ 1.84
USP4-208ENST00000464168 ESR2Q92731 530 aa26.54■■□□□ 1.84
USP4-208ENST00000464168 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
USP4-208ENST00000464168 UBA5Q9GZZ9 404 aa26.54■■□□□ 1.84
USP4-208ENST00000464168 CPVLQ9H3G5 476 aa26.54■■□□□ 1.84
USP4-208ENST00000464168 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
USP4-208ENST00000464168 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa26.54■■□□□ 1.84
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