RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450875.5

CITED1-208, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, human

TSL 2

Gene CITED1, Length 505 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CITED1-208	ENST00000450875	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	9.37	□□□□□ -0.91
CITED1-208	ENST00000450875	PRAMEF19	Q5SWL8	479 aa		9.37	□□□□□ -0.91
CITED1-208	ENST00000450875	MAMDC4	Q6UXC1	1216 aa		9.37	□□□□□ -0.91
CITED1-208	ENST00000450875	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		9.37	□□□□□ -0.91
CITED1-208	ENST00000450875	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	9.37	□□□□□ -0.91
CITED1-208	ENST00000450875	FAM133A	Q8N9E0	248 aa		9.37	□□□□□ -0.91
CITED1-208	ENST00000450875	CLEC4D	Q8WXI8	215 aa		9.37	□□□□□ -0.91
CITED1-208	ENST00000450875	MTMR8	Q96EF0	704 aa		9.37	□□□□□ -0.91
CITED1-208	ENST00000450875	MAF1	Q9H063	256 aa		9.37	□□□□□ -0.91
CITED1-208	ENST00000450875	ABHD16B	Q9H3Z7	469 aa		9.37	□□□□□ -0.91
CITED1-208	ENST00000450875	DDX20	Q9UHI6	824 aa	Known RBP	9.37	□□□□□ -0.91
CITED1-208	ENST00000450875	SOWAHB	A6NEL2	793 aa		9.36	□□□□□ -0.91
CITED1-208	ENST00000450875	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	9.36	□□□□□ -0.91
CITED1-208	ENST00000450875	SEPT4	O43236	478 aa		9.36	□□□□□ -0.91
CITED1-208	ENST00000450875	POLR2M	P0CAP2	368 aa		9.36	□□□□□ -0.91
CITED1-208	ENST00000450875	RARB	P10826	455 aa		9.36	□□□□□ -0.91
CITED1-208	ENST00000450875	AKR1A1	P14550	325 aa		9.36	□□□□□ -0.91
CITED1-208	ENST00000450875	RCAN1	P53805	252 aa		9.36	□□□□□ -0.91
CITED1-208	ENST00000450875	ACVR2B	Q13705	512 aa		9.36	□□□□□ -0.91
CITED1-208	ENST00000450875	ANKRD1	Q15327	319 aa		9.36	□□□□□ -0.91
CITED1-208	ENST00000450875	C8orf34	Q49A92	452 aa		9.36	□□□□□ -0.91
CITED1-208	ENST00000450875	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		9.36	□□□□□ -0.91
CITED1-208	ENST00000450875	ANO1	Q5XXA6	986 aa		9.36	□□□□□ -0.91
CITED1-208	ENST00000450875	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	9.36	□□□□□ -0.91
CITED1-208	ENST00000450875	SLC30A10	Q6XR72	485 aa		9.36	□□□□□ -0.91
CITED1-208	ENST00000450875	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	9.36	□□□□□ -0.91
CITED1-208	ENST00000450875	ARMCX2	Q7L311	632 aa		9.36	□□□□□ -0.91
CITED1-208	ENST00000450875	FBXL16	Q8N461	479 aa		9.36	□□□□□ -0.91
CITED1-208	ENST00000450875	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		9.36	□□□□□ -0.91
CITED1-208	ENST00000450875	RGS22	Q8NE09	1264 aa		9.36	□□□□□ -0.91
CITED1-208	ENST00000450875	CUL5	Q93034	780 aa		9.36	□□□□□ -0.91
CITED1-208	ENST00000450875	CDKN2AIP	Q9NXV6	580 aa	Predicted RBP	9.36	□□□□□ -0.91
CITED1-208	ENST00000450875	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	9.36	□□□□□ -0.91
CITED1-208	ENST00000450875	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		9.36	□□□□□ -0.91
CITED1-208	ENST00000450875	SSUH2	Q9Y2M2	353 aa		9.36	□□□□□ -0.91
CITED1-208	ENST00000450875	ZNFX1	Q9P2E3	1918 aa	Known RBP	9.36	□□□□□ -0.91
CITED1-208	ENST00000450875	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		9.35	□□□□□ -0.91
CITED1-208	ENST00000450875	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		9.35	□□□□□ -0.91
CITED1-208	ENST00000450875	CPLX1	O14810	134 aa		9.35	□□□□□ -0.91
CITED1-208	ENST00000450875	PPP1R11	O60927	126 aa	Predicted RBP	9.35	□□□□□ -0.91
CITED1-208	ENST00000450875	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	9.35	□□□□□ -0.91
CITED1-208	ENST00000450875	RGS19	P49795	217 aa		9.35	□□□□□ -0.91
CITED1-208	ENST00000450875	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	9.35	□□□□□ -0.91
CITED1-208	ENST00000450875	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	9.35	□□□□□ -0.91
CITED1-208	ENST00000450875	PDE4D	Q08499	809 aa		9.35	□□□□□ -0.91
CITED1-208	ENST00000450875	STK3	Q13188	491 aa		9.35	□□□□□ -0.91
CITED1-208	ENST00000450875	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	9.35	□□□□□ -0.91
CITED1-208	ENST00000450875	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	9.35	□□□□□ -0.91
CITED1-208	ENST00000450875	EEPD1	Q7L9B9	569 aa		9.35	□□□□□ -0.91
CITED1-208	ENST00000450875	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		9.35	□□□□□ -0.91
CITED1-208	ENST00000450875	ANKLE1	Q8NAG6	615 aa		9.35	□□□□□ -0.91
CITED1-208	ENST00000450875	ARRDC4	Q8NCT1	418 aa		9.35	□□□□□ -0.91
CITED1-208	ENST00000450875	DNER	Q8NFT8	737 aa		9.35	□□□□□ -0.91
CITED1-208	ENST00000450875	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		9.35	□□□□□ -0.91
CITED1-208	ENST00000450875	PURB	Q96QR8	312 aa	Known RBP	9.35	□□□□□ -0.91
CITED1-208	ENST00000450875	LARP6	Q9BRS8	491 aa	Known RBP	9.35	□□□□□ -0.91
CITED1-208	ENST00000450875	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		9.35	□□□□□ -0.91
CITED1-208	ENST00000450875	SPC25	Q9HBM1	224 aa		9.35	□□□□□ -0.91
CITED1-208	ENST00000450875	PLXNA1	Q9UIW2	1896 aa		9.35	□□□□□ -0.91
CITED1-208	ENST00000450875		V9GY48	417 aa	Predicted RBP	9.35	□□□□□ -0.91
CITED1-208	ENST00000450875	FARP2	O94887	1054 aa	Predicted RBP	9.34	□□□□□ -0.91
CITED1-208	ENST00000450875	SNAI1	O95863	264 aa	Predicted RBP	9.34	□□□□□ -0.91
CITED1-208	ENST00000450875	ZNF865	P0CJ78	1059 aa	Predicted RBP	9.34	□□□□□ -0.91
CITED1-208	ENST00000450875	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	9.34	□□□□□ -0.91
CITED1-208	ENST00000450875	CDC27	P30260	824 aa		9.34	□□□□□ -0.91
CITED1-208	ENST00000450875	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	9.34	□□□□□ -0.91
CITED1-208	ENST00000450875	NEK4	P51957	841 aa		9.34	□□□□□ -0.91
CITED1-208	ENST00000450875	NAPA	P54920	295 aa		9.34	□□□□□ -0.91
CITED1-208	ENST00000450875	STXBP2	Q15833	593 aa		9.34	□□□□□ -0.91
CITED1-208	ENST00000450875	LHX8	Q68G74	356 aa		9.34	□□□□□ -0.91
CITED1-208	ENST00000450875	NECAB2	Q7Z6G3	386 aa		9.34	□□□□□ -0.91
CITED1-208	ENST00000450875	FCHSD1	Q86WN1	690 aa		9.34	□□□□□ -0.91
CITED1-208	ENST00000450875	HS6ST3	Q8IZP7	471 aa		9.34	□□□□□ -0.91
CITED1-208	ENST00000450875	TRPV1	Q8NER1	839 aa		9.34	□□□□□ -0.91
CITED1-208	ENST00000450875	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	9.34	□□□□□ -0.91
CITED1-208	ENST00000450875	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	9.34	□□□□□ -0.91
CITED1-208	ENST00000450875	TBC1D5	Q92609	795 aa		9.34	□□□□□ -0.91
CITED1-208	ENST00000450875	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	9.34	□□□□□ -0.91
CITED1-208	ENST00000450875	TAAR1	Q96RJ0	339 aa		9.34	□□□□□ -0.91
CITED1-208	ENST00000450875	RMDN3	Q96TC7	470 aa		9.34	□□□□□ -0.91
CITED1-208	ENST00000450875	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		9.34	□□□□□ -0.91
CITED1-208	ENST00000450875	CRISPLD2	Q9H0B8	497 aa		9.34	□□□□□ -0.91
CITED1-208	ENST00000450875	RNF39	Q9H2S5	420 aa		9.34	□□□□□ -0.91
CITED1-208	ENST00000450875	VTA1	Q9NP79	307 aa		9.34	□□□□□ -0.91
CITED1-208	ENST00000450875	XPNPEP3	Q9NQH7	507 aa		9.34	□□□□□ -0.91
CITED1-208	ENST00000450875	RBM27	Q9P2N5	1060 aa	Known RBP	9.34	□□□□□ -0.91
CITED1-208	ENST00000450875	OGDHL	Q9ULD0	1010 aa		9.34	□□□□□ -0.91
CITED1-208	ENST00000450875	MYH6	P13533	1939 aa		9.34	□□□□□ -0.91
CITED1-208	ENST00000450875	CNTNAP5	Q8WYK1	1306 aa		9.33	□□□□□ -0.92
CITED1-208	ENST00000450875	KBTBD13	C9JR72	458 aa		9.33	□□□□□ -0.92
CITED1-208	ENST00000450875	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		9.33	□□□□□ -0.92
CITED1-208	ENST00000450875	IGHA2	P01877	340 aa		9.33	□□□□□ -0.92
CITED1-208	ENST00000450875	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	9.33	□□□□□ -0.92
CITED1-208	ENST00000450875	HSD17B4	P51659	736 aa		9.33	□□□□□ -0.92
CITED1-208	ENST00000450875	TNFAIP2	Q03169	654 aa		9.33	□□□□□ -0.92
CITED1-208	ENST00000450875	C1QBP	Q07021	282 aa	Known RBP	9.33	□□□□□ -0.92
CITED1-208	ENST00000450875	SSRP1	Q08945	709 aa	Known RBP	9.33	□□□□□ -0.92
CITED1-208	ENST00000450875	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		9.33	□□□□□ -0.92
CITED1-208	ENST00000450875	CCDC144B	Q3MJ40	725 aa		9.33	□□□□□ -0.92
CITED1-208	ENST00000450875	RNF180	Q86T96	592 aa		9.33	□□□□□ -0.92

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