RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445003.5

SMIM25-204, Transcript of small integral membrane protein 25, humanhuman

TSL 3

Gene SMIM25, Length 539 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM25-204ENST00000445003 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
SMIM25-204ENST00000445003 AMNQ9BXJ7 453 aa15.61■□□□□ 0.09
SMIM25-204ENST00000445003 TRIM9Q9C026 710 aa15.61■□□□□ 0.09
SMIM25-204ENST00000445003 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
SMIM25-204ENST00000445003 GINM1Q9NU53 330 aa15.61■□□□□ 0.09
SMIM25-204ENST00000445003 LRWD1Q9UFC0 647 aa15.61■□□□□ 0.09
SMIM25-204ENST00000445003 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP15.61■□□□□ 0.09
SMIM25-204ENST00000445003 SCN9AQ15858 1988 aa15.61■□□□□ 0.09
SMIM25-204ENST00000445003 EP400Q96L91 3159 aa15.6■□□□□ 0.09
SMIM25-204ENST00000445003 ZSCAN12O43309 604 aa15.6■□□□□ 0.09
SMIM25-204ENST00000445003 EDIL3O43854 480 aa15.6■□□□□ 0.09
SMIM25-204ENST00000445003 FECHP22830 423 aa15.6■□□□□ 0.09
SMIM25-204ENST00000445003 MAP3K10Q02779 954 aa15.6■□□□□ 0.09
SMIM25-204ENST00000445003 TCP10Q12799 353 aa15.6■□□□□ 0.09
SMIM25-204ENST00000445003 PSMD2Q13200 908 aa15.6■□□□□ 0.09
SMIM25-204ENST00000445003 DLGAP5Q15398 846 aa15.6■□□□□ 0.09
SMIM25-204ENST00000445003 QRICH1Q2TAL8 776 aa15.6■□□□□ 0.09
SMIM25-204ENST00000445003 SPDYE2Q495Y8 402 aa15.6■□□□□ 0.09
SMIM25-204ENST00000445003 KMT5BQ4FZB7 885 aa15.6■□□□□ 0.09
SMIM25-204ENST00000445003 CEP135Q66GS9 1140 aa15.6■□□□□ 0.09
SMIM25-204ENST00000445003 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
SMIM25-204ENST00000445003 TTBK2Q6IQ55 1244 aa15.6■□□□□ 0.09
SMIM25-204ENST00000445003 SV2BQ7L1I2 683 aa15.6■□□□□ 0.09
SMIM25-204ENST00000445003 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
SMIM25-204ENST00000445003 NELFBQ8WX92 580 aa15.6■□□□□ 0.09
SMIM25-204ENST00000445003 BLZF1Q9H2G9 400 aa15.6■□□□□ 0.09
SMIM25-204ENST00000445003 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa15.6■□□□□ 0.09
SMIM25-204ENST00000445003 ZNRF3Q9ULT6 936 aa15.6■□□□□ 0.09
SMIM25-204ENST00000445003 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
SMIM25-204ENST00000445003 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa15.6■□□□□ 0.09
SMIM25-204ENST00000445003 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa15.59■□□□□ 0.09
SMIM25-204ENST00000445003 TPM1P09493 284 aa15.59■□□□□ 0.09
SMIM25-204ENST00000445003 BMP3P12645 472 aa15.59■□□□□ 0.09
SMIM25-204ENST00000445003 KCNA3P22001 575 aa15.59■□□□□ 0.09
SMIM25-204ENST00000445003 PRCPP42785 496 aa15.59■□□□□ 0.09
SMIM25-204ENST00000445003 ATP2B2Q01814 1243 aa15.59■□□□□ 0.09
SMIM25-204ENST00000445003 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
SMIM25-204ENST00000445003 TMEM119Q4V9L6 283 aa15.59■□□□□ 0.09
SMIM25-204ENST00000445003 SYDE2Q5VT97 1194 aa15.59■□□□□ 0.09
SMIM25-204ENST00000445003 KRT79Q5XKE5 535 aa15.59■□□□□ 0.09
SMIM25-204ENST00000445003 KLHL10Q6JEL2 608 aa15.59■□□□□ 0.09
SMIM25-204ENST00000445003 KCTD1Q719H9 257 aa15.59■□□□□ 0.09
SMIM25-204ENST00000445003 POTEDQ86YR6 584 aa15.59■□□□□ 0.09
SMIM25-204ENST00000445003 SLFN12Q8IYM2 578 aa15.59■□□□□ 0.09
SMIM25-204ENST00000445003 LARGE2Q8N3Y3 721 aa15.59■□□□□ 0.09
SMIM25-204ENST00000445003 IQCDQ96DY2 449 aa15.59■□□□□ 0.09
SMIM25-204ENST00000445003 CSRNP1Q96S65 589 aa15.59■□□□□ 0.09
SMIM25-204ENST00000445003 NT5C3AQ9H0P0 336 aa15.59■□□□□ 0.09
SMIM25-204ENST00000445003 SH2D4AQ9H788 454 aa15.59■□□□□ 0.09
SMIM25-204ENST00000445003 TMEM260Q9NX78 707 aa15.59■□□□□ 0.09
SMIM25-204ENST00000445003 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
SMIM25-204ENST00000445003 CTNND2Q9UQB3 1225 aa15.59■□□□□ 0.09
SMIM25-204ENST00000445003 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa15.59■□□□□ 0.09
SMIM25-204ENST00000445003 TMEM232C9JQI7 657 aa15.58■□□□□ 0.08
SMIM25-204ENST00000445003 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
SMIM25-204ENST00000445003 PIK3CDO00329 1044 aa15.58■□□□□ 0.08
SMIM25-204ENST00000445003 CTIFO43310 598 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
SMIM25-204ENST00000445003 NDUFB10O96000 172 aa15.58■□□□□ 0.08
SMIM25-204ENST00000445003 CCNE1P24864 410 aa15.58■□□□□ 0.08
SMIM25-204ENST00000445003 CASP1P29466 404 aa15.58■□□□□ 0.08
SMIM25-204ENST00000445003 CIITAP33076 1130 aa15.58■□□□□ 0.08
SMIM25-204ENST00000445003 TECP42680 631 aa15.58■□□□□ 0.08
SMIM25-204ENST00000445003 TNNI2P48788 182 aa15.58■□□□□ 0.08
SMIM25-204ENST00000445003 CACNB3P54284 484 aa15.58■□□□□ 0.08
SMIM25-204ENST00000445003 TCP11X2Q5H9J9 407 aa15.58■□□□□ 0.08
SMIM25-204ENST00000445003 UNC13DQ70J99 1090 aa15.58■□□□□ 0.08
SMIM25-204ENST00000445003 PPFIBP1Q86W92 1011 aa15.58■□□□□ 0.08
SMIM25-204ENST00000445003 FBXO11Q86XK2 927 aa15.58■□□□□ 0.08
SMIM25-204ENST00000445003 CLEC10AQ8IUN9 316 aa15.58■□□□□ 0.08
SMIM25-204ENST00000445003 TMEM139Q8IV31 216 aa15.58■□□□□ 0.08
SMIM25-204ENST00000445003 CNGA4Q8IV77 575 aa15.58■□□□□ 0.08
SMIM25-204ENST00000445003 FAM114A1Q8IWE2 563 aa15.58■□□□□ 0.08
SMIM25-204ENST00000445003 TC2NQ8N9U0 490 aa15.58■□□□□ 0.08
SMIM25-204ENST00000445003 KIF18AQ8NI77 898 aa15.58■□□□□ 0.08
SMIM25-204ENST00000445003 CRYGNQ8WXF5 182 aa15.58■□□□□ 0.08
SMIM25-204ENST00000445003 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
SMIM25-204ENST00000445003 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
SMIM25-204ENST00000445003 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
SMIM25-204ENST00000445003 EXOC1Q9NV70 894 aa15.58■□□□□ 0.08
SMIM25-204ENST00000445003 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
SMIM25-204ENST00000445003 TMX2Q9Y320 296 aa15.58■□□□□ 0.08
SMIM25-204ENST00000445003 ABCB11O95342 1321 aa15.58■□□□□ 0.08
SMIM25-204ENST00000445003 KIF13BQ9NQT8 1826 aa15.57■□□□□ 0.08
SMIM25-204ENST00000445003 A0A1W2PQC6 194 aa15.57■□□□□ 0.08
SMIM25-204ENST00000445003 PP2D1A8MPX8 630 aa15.57■□□□□ 0.08
SMIM25-204ENST00000445003 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
SMIM25-204ENST00000445003 CDC25AP30304 524 aa15.57■□□□□ 0.08
SMIM25-204ENST00000445003 TXKP42681 527 aa15.57■□□□□ 0.08
SMIM25-204ENST00000445003 GRB10Q13322 594 aa15.57■□□□□ 0.08
SMIM25-204ENST00000445003 Q4G0T1 1027 aa15.57■□□□□ 0.08
SMIM25-204ENST00000445003 CCDC125Q86Z20 511 aa15.57■□□□□ 0.08
SMIM25-204ENST00000445003 NIM1KQ8IY84 436 aa15.57■□□□□ 0.08
SMIM25-204ENST00000445003 STAMQ92783 540 aa15.57■□□□□ 0.08
SMIM25-204ENST00000445003 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa15.57■□□□□ 0.08
SMIM25-204ENST00000445003 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa15.57■□□□□ 0.08
SMIM25-204ENST00000445003 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP15.57■□□□□ 0.08
SMIM25-204ENST00000445003 GOPCQ9HD26 462 aa15.57■□□□□ 0.08
SMIM25-204ENST00000445003 KCNMB3Q9NPA1 279 aa15.57■□□□□ 0.08
SMIM25-204ENST00000445003 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa15.57■□□□□ 0.08
SMIM25-204ENST00000445003 KCNJ18B7U540 433 aa15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms