RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439106.5

PRAME-209, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 891 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-209ENST00000439106 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
PRAME-209ENST00000439106 TRIM43BA6NCK2 446 aa16.14■□□□□ 0.17
PRAME-209ENST00000439106 KLRF2D3W0D1 207 aa16.14■□□□□ 0.17
PRAME-209ENST00000439106 ITGB8P26012 769 aa16.14■□□□□ 0.17
PRAME-209ENST00000439106 CST5P28325 142 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
PRAME-209ENST00000439106 WTAPQ15007 396 aa16.14■□□□□ 0.17
PRAME-209ENST00000439106 BMP2KLQ5H9B9 411 aa16.14■□□□□ 0.17
PRAME-209ENST00000439106 GNASQ5JWF2 1037 aa16.14■□□□□ 0.17
PRAME-209ENST00000439106 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa16.14■□□□□ 0.17
PRAME-209ENST00000439106 MORC4Q8TE76 937 aa16.14■□□□□ 0.17
PRAME-209ENST00000439106 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
PRAME-209ENST00000439106 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
PRAME-209ENST00000439106 MYL10Q9BUA6 226 aa16.14■□□□□ 0.17
PRAME-209ENST00000439106 ANO2Q9NQ90 1003 aa16.14■□□□□ 0.17
PRAME-209ENST00000439106 COL20A1Q9P218 1284 aa16.14■□□□□ 0.17
PRAME-209ENST00000439106 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
PRAME-209ENST00000439106 ABCB11O95342 1321 aa16.14■□□□□ 0.17
PRAME-209ENST00000439106 A0A1W2PPC1 479 aa16.13■□□□□ 0.17
PRAME-209ENST00000439106 ERICH2A1L162 156 aa16.13■□□□□ 0.17
PRAME-209ENST00000439106 MOXD2PA6NHM9 499 aa16.13■□□□□ 0.17
PRAME-209ENST00000439106 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
PRAME-209ENST00000439106 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
PRAME-209ENST00000439106 GRM4Q14833 912 aa16.13■□□□□ 0.17
PRAME-209ENST00000439106 TMEM67Q5HYA8 995 aa16.13■□□□□ 0.17
PRAME-209ENST00000439106 C1orf53Q5VUE5 145 aa16.13■□□□□ 0.17
PRAME-209ENST00000439106 FBXO11Q86XK2 927 aa16.13■□□□□ 0.17
PRAME-209ENST00000439106 HOMER1Q86YM7 354 aa16.13■□□□□ 0.17
PRAME-209ENST00000439106 TDHQ8IZJ6 230 aa16.13■□□□□ 0.17
PRAME-209ENST00000439106 SPC25Q9HBM1 224 aa16.13■□□□□ 0.17
PRAME-209ENST00000439106 VTA1Q9NP79 307 aa16.13■□□□□ 0.17
PRAME-209ENST00000439106 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa16.13■□□□□ 0.17
PRAME-209ENST00000439106 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
PRAME-209ENST00000439106 SLC27A2O14975 620 aa16.12■□□□□ 0.17
PRAME-209ENST00000439106 CLTBP09497 229 aa16.12■□□□□ 0.17
PRAME-209ENST00000439106 CXCL17Q6UXB2 119 aa16.12■□□□□ 0.17
PRAME-209ENST00000439106 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa16.12■□□□□ 0.17
PRAME-209ENST00000439106 NUP133Q8WUM0 1156 aa16.12■□□□□ 0.17
PRAME-209ENST00000439106 BADQ92934 168 aa16.12■□□□□ 0.17
PRAME-209ENST00000439106 VTI1AQ96AJ9 217 aa16.12■□□□□ 0.17
PRAME-209ENST00000439106 CCDC136Q96JN2 1154 aa16.12■□□□□ 0.17
PRAME-209ENST00000439106 GLT1D1Q96MS3 346 aa16.12■□□□□ 0.17
PRAME-209ENST00000439106 TAAR1Q96RJ0 339 aa16.12■□□□□ 0.17
PRAME-209ENST00000439106 PIGSQ96S52 555 aa16.12■□□□□ 0.17
PRAME-209ENST00000439106 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
PRAME-209ENST00000439106 PNMA2Q9UL42 364 aa16.12■□□□□ 0.17
PRAME-209ENST00000439106 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
PRAME-209ENST00000439106 SCN5AQ14524 2016 aa16.11■□□□□ 0.17
PRAME-209ENST00000439106 OPLAHO14841 1288 aa16.11■□□□□ 0.17
PRAME-209ENST00000439106 PRC1O43663 620 aa16.11■□□□□ 0.17
PRAME-209ENST00000439106 PDE4DQ08499 809 aa16.11■□□□□ 0.17
PRAME-209ENST00000439106 TROAPQ12815 778 aa16.11■□□□□ 0.17
PRAME-209ENST00000439106 SART3Q15020 963 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
PRAME-209ENST00000439106 CREB3L3Q68CJ9 461 aa16.11■□□□□ 0.17
PRAME-209ENST00000439106 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa16.11■□□□□ 0.17
PRAME-209ENST00000439106 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
PRAME-209ENST00000439106 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
PRAME-209ENST00000439106 PIBF1Q8WXW3 757 aa16.11■□□□□ 0.17
PRAME-209ENST00000439106 COPS5Q92905 334 aa16.11■□□□□ 0.17
PRAME-209ENST00000439106 LRRC2Q9BYS8 371 aa16.11■□□□□ 0.17
PRAME-209ENST00000439106 LY9Q9HBG7 655 aa16.11■□□□□ 0.17
PRAME-209ENST00000439106 GBF1Q92538 1859 aa16.11■□□□□ 0.17
PRAME-209ENST00000439106 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
PRAME-209ENST00000439106 ZBTB5O15062 677 aa16.1■□□□□ 0.17
PRAME-209ENST00000439106 CYTH3O43739 400 aa16.1■□□□□ 0.17
PRAME-209ENST00000439106 CFBP00751 764 aa16.1■□□□□ 0.17
PRAME-209ENST00000439106 RXRAP19793 462 aa16.1■□□□□ 0.17
PRAME-209ENST00000439106 EDNRBP24530 442 aa16.1■□□□□ 0.17
PRAME-209ENST00000439106 PSMC6P62333 389 aa16.1■□□□□ 0.17
PRAME-209ENST00000439106 FAAP100Q0VG06 881 aa16.1■□□□□ 0.17
PRAME-209ENST00000439106 NECTIN1Q15223 517 aa16.1■□□□□ 0.17
PRAME-209ENST00000439106 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
PRAME-209ENST00000439106 IQSEC1Q6DN90 963 aa16.1■□□□□ 0.17
PRAME-209ENST00000439106 DNERQ8NFT8 737 aa16.1■□□□□ 0.17
PRAME-209ENST00000439106 MTMR8Q96EF0 704 aa16.1■□□□□ 0.17
PRAME-209ENST00000439106 WDR11Q9BZH6 1224 aa16.1■□□□□ 0.17
PRAME-209ENST00000439106 AP5M1Q9H0R1 490 aa16.1■□□□□ 0.17
PRAME-209ENST00000439106 ARIH2O95376 493 aa16.09■□□□□ 0.17
PRAME-209ENST00000439106 DUSP28Q4G0W2 176 aa16.09■□□□□ 0.17
PRAME-209ENST00000439106 C9orf50Q5SZB4 431 aa16.09■□□□□ 0.17
PRAME-209ENST00000439106 CASC1Q6TDU7 716 aa16.09■□□□□ 0.17
PRAME-209ENST00000439106 ZNF654Q8IZM8 581 aa16.09■□□□□ 0.17
PRAME-209ENST00000439106 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa16.09■□□□□ 0.17
PRAME-209ENST00000439106 AMNQ9BXJ7 453 aa16.09■□□□□ 0.17
PRAME-209ENST00000439106 TMEM39AQ9NV64 488 aa16.09■□□□□ 0.17
PRAME-209ENST00000439106 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
PRAME-209ENST00000439106 ELP1O95163 1332 aa16.09■□□□□ 0.17
PRAME-209ENST00000439106 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
PRAME-209ENST00000439106 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
PRAME-209ENST00000439106 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
PRAME-209ENST00000439106 CDC45O75419 566 aa16.08■□□□□ 0.16
PRAME-209ENST00000439106 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
PRAME-209ENST00000439106 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
PRAME-209ENST00000439106 NKX3-2P78367 333 aa16.08■□□□□ 0.16
PRAME-209ENST00000439106 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa16.08■□□□□ 0.16
PRAME-209ENST00000439106 CATIPQ7Z7H3 387 aa16.08■□□□□ 0.16
PRAME-209ENST00000439106 RGS22Q8NE09 1264 aa16.08■□□□□ 0.16
PRAME-209ENST00000439106 OR6J1Q8NGC5 347 aa16.08■□□□□ 0.16
PRAME-209ENST00000439106 TCEANC2Q96MN5 208 aa16.08■□□□□ 0.16
PRAME-209ENST00000439106 RIOX1Q9H6W3 641 aa16.08■□□□□ 0.16
PRAME-209ENST00000439106 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.1 ms