RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438888.5

PRAME-208, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 4

Gene PRAME, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-208ENST00000438888 FAM126BQ8IXS8 530 aa14.55□□□□□ -0.08
PRAME-208ENST00000438888 RASEFQ8IZ41 740 aa14.55□□□□□ -0.08
PRAME-208ENST00000438888 IL17RAQ96F46 866 aa14.55□□□□□ -0.08
PRAME-208ENST00000438888 PDGFCQ9NRA1 345 aa14.55□□□□□ -0.08
PRAME-208ENST00000438888 SNX14Q9Y5W7 946 aa14.55□□□□□ -0.08
PRAME-208ENST00000438888 ASTN1O14525 1302 aa14.55□□□□□ -0.08
PRAME-208ENST00000438888 VCANP13611 3396 aa14.54□□□□□ -0.08
PRAME-208ENST00000438888 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
PRAME-208ENST00000438888 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
PRAME-208ENST00000438888 ASB14A6NK59 587 aa14.54□□□□□ -0.08
PRAME-208ENST00000438888 GRXCR1A8MXD5 290 aa14.54□□□□□ -0.08
PRAME-208ENST00000438888 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
PRAME-208ENST00000438888 CYP2C18P33260 490 aa14.54□□□□□ -0.08
PRAME-208ENST00000438888 SLC16A2P36021 539 aa14.54□□□□□ -0.08
PRAME-208ENST00000438888 KRT32Q14532 448 aa14.54□□□□□ -0.08
PRAME-208ENST00000438888 GRIN2CQ14957 1233 aa14.54□□□□□ -0.08
PRAME-208ENST00000438888 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
PRAME-208ENST00000438888 TKFCQ3LXA3 575 aa14.54□□□□□ -0.08
PRAME-208ENST00000438888 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa14.54□□□□□ -0.08
PRAME-208ENST00000438888 RCSD1Q6JBY9 416 aa14.54□□□□□ -0.08
PRAME-208ENST00000438888 TMEM199Q8N511 208 aa14.54□□□□□ -0.08
PRAME-208ENST00000438888 TIFAQ96CG3 184 aa14.54□□□□□ -0.08
PRAME-208ENST00000438888 AP5M1Q9H0R1 490 aa14.54□□□□□ -0.08
PRAME-208ENST00000438888 ANAPC4Q9UJX5 808 aa14.54□□□□□ -0.08
PRAME-208ENST00000438888 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
PRAME-208ENST00000438888 UMODL1Q5DID0 1318 aa14.53□□□□□ -0.08
PRAME-208ENST00000438888 TMEM265A0A087WTH1 108 aa14.53□□□□□ -0.08
PRAME-208ENST00000438888 SMPD1P17405 629 aa14.53□□□□□ -0.08
PRAME-208ENST00000438888 PBX2P40425 430 aa14.53□□□□□ -0.08
PRAME-208ENST00000438888 TMEM240Q5SV17 173 aa14.53□□□□□ -0.08
PRAME-208ENST00000438888 TMEM63BQ5T3F8 832 aa14.53□□□□□ -0.08
PRAME-208ENST00000438888 TTBK2Q6IQ55 1244 aa14.53□□□□□ -0.08
PRAME-208ENST00000438888 C16orf59Q7L2K0 433 aa14.53□□□□□ -0.08
PRAME-208ENST00000438888 KIF2CQ99661 725 aa14.53□□□□□ -0.08
PRAME-208ENST00000438888 ZNF576Q9H609 170 aa14.53□□□□□ -0.08
PRAME-208ENST00000438888 GPCPD1Q9NPB8 672 aa14.53□□□□□ -0.08
PRAME-208ENST00000438888 CYP39A1Q9NYL5 469 aa14.53□□□□□ -0.08
PRAME-208ENST00000438888 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
PRAME-208ENST00000438888 TAF6LQ9Y6J9 622 aa14.53□□□□□ -0.08
PRAME-208ENST00000438888 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa14.52□□□□□ -0.08
PRAME-208ENST00000438888 E7EWF7 191 aa14.52□□□□□ -0.09
PRAME-208ENST00000438888 PSMC6P62333 389 aa14.52□□□□□ -0.09
PRAME-208ENST00000438888 ZNF365Q70YC5 407 aa14.52□□□□□ -0.09
PRAME-208ENST00000438888 TBC1D10CQ8IV04 446 aa14.52□□□□□ -0.09
PRAME-208ENST00000438888 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
PRAME-208ENST00000438888 PTPDC1A2A3K4 754 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-208ENST00000438888 PLA2G6O60733 806 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-208ENST00000438888 ICAM1P05362 532 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-208ENST00000438888 PSMA5P28066 241 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-208ENST00000438888 CCL23P55773 120 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-208ENST00000438888 ITGA7Q13683 1181 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-208ENST00000438888 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
PRAME-208ENST00000438888 RABEP1Q15276 862 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-208ENST00000438888 ADCK5Q3MIX3 580 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-208ENST00000438888 AKNAD1Q5T1N1 836 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-208ENST00000438888 SYDE2Q5VT97 1194 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-208ENST00000438888 TAPT1Q6NXT6 567 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-208ENST00000438888 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
PRAME-208ENST00000438888 STOX1Q6ZVD7 989 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-208ENST00000438888 USP38Q8NB14 1042 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-208ENST00000438888 DCAF4Q8WV16 495 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-208ENST00000438888 PPM1EQ8WY54 764 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-208ENST00000438888 PBX4Q9BYU1 374 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-208ENST00000438888 TM6SF1Q9BZW5 370 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-208ENST00000438888 TRPV6Q9H1D0 765 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-208ENST00000438888 HIPK3Q9H422 1215 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-208ENST00000438888 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
PRAME-208ENST00000438888 LRRC37A2A6NM11 1700 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-208ENST00000438888 NFIBO00712 420 aa14.5□□□□□ -0.09
PRAME-208ENST00000438888 ORC4O43929 436 aa14.5□□□□□ -0.09
PRAME-208ENST00000438888 ZEB2O60315 1214 aa14.5□□□□□ -0.09
PRAME-208ENST00000438888 CD4P01730 458 aa14.5□□□□□ -0.09
PRAME-208ENST00000438888 PCP11498 1178 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
PRAME-208ENST00000438888 CASTP20810 708 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
PRAME-208ENST00000438888 CALML3P27482 149 aa14.5□□□□□ -0.09
PRAME-208ENST00000438888 TRDNQ13061 729 aa14.5□□□□□ -0.09
PRAME-208ENST00000438888 MFSD6Q6ZSS7 791 aa14.5□□□□□ -0.09
PRAME-208ENST00000438888 NEK1Q96PY6 1258 aa14.5□□□□□ -0.09
PRAME-208ENST00000438888 TMEM47Q9BQJ4 181 aa14.5□□□□□ -0.09
PRAME-208ENST00000438888 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
PRAME-208ENST00000438888 CNNM2Q9H8M5 875 aa14.5□□□□□ -0.09
PRAME-208ENST00000438888 GRIN2DO15399 1336 aa14.49□□□□□ -0.09
PRAME-208ENST00000438888 NEDD4P46934 1319 aa14.49□□□□□ -0.09
PRAME-208ENST00000438888 B4GALT4O60513 344 aa14.49□□□□□ -0.09
PRAME-208ENST00000438888 CABYRO75952 493 aa14.49□□□□□ -0.09
PRAME-208ENST00000438888 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
PRAME-208ENST00000438888 TOP1P11387 765 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
PRAME-208ENST00000438888 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
PRAME-208ENST00000438888 NKX3-2P78367 333 aa14.49□□□□□ -0.09
PRAME-208ENST00000438888 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa14.49□□□□□ -0.09
PRAME-208ENST00000438888 SLC30A10Q6XR72 485 aa14.49□□□□□ -0.09
PRAME-208ENST00000438888 OTOP2Q7RTS6 562 aa14.49□□□□□ -0.09
PRAME-208ENST00000438888 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
PRAME-208ENST00000438888 NCOA7Q8NI08 942 aa14.49□□□□□ -0.09
PRAME-208ENST00000438888 KRT23Q9C075 422 aa14.49□□□□□ -0.09
PRAME-208ENST00000438888 PRDM12Q9H4Q4 367 aa14.49□□□□□ -0.09
PRAME-208ENST00000438888 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa14.49□□□□□ -0.09
PRAME-208ENST00000438888 VTA1Q9NP79 307 aa14.49□□□□□ -0.09
PRAME-208ENST00000438888 IL23AQ9NPF7 189 aa14.49□□□□□ -0.09
PRAME-208ENST00000438888 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms