RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000433317.1

TTC28-AS1-212, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TTC28-AS1, Length 3,080 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-212ENST00000433317 GRIN2DO15399 1336 aa16.04■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-212ENST00000433317 SHTN1A0MZ66 631 aa16.04■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-212ENST00000433317 RCSD1Q6JBY9 416 aa16.04■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CABP7Q86V35 215 aa16.04■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-212ENST00000433317 SH2D3CQ8N5H7 860 aa16.04■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-212ENST00000433317 SLC39A2Q9NP94 309 aa16.04■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-212ENST00000433317 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-212ENST00000433317 BICDL2A1A5D9 508 aa16.03■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-212ENST00000433317 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP16.03■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ATP1A2P50993 1020 aa16.03■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-212ENST00000433317 TXNRD1Q16881 649 aa16.03■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-212ENST00000433317 TTMPQ5BVD1 217 aa16.03■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-212ENST00000433317 FAM114A1Q8IWE2 563 aa16.03■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-212ENST00000433317 KAT2BQ92831 832 aa16.03■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-212ENST00000433317 TRIM9Q9C026 710 aa16.03■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-212ENST00000433317 COL4A1P02462 1669 aa16.03■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-212ENST00000433317 BUB1O43683 1085 aa16.03■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ZPR1O75312 459 aa16.03■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-212ENST00000433317 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-212ENST00000433317 PDCLQ13371 301 aa16.03■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-212ENST00000433317 MS4A14Q96JA4 679 aa16.03■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ZNF804BA4D1E1 1349 aa16.03■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-212ENST00000433317 GOLGA8KD6RF30 607 aa16.03■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ORC4O43929 436 aa16.03■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-212ENST00000433317 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CAVIN4Q5BKX8 364 aa16.03■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-212ENST00000433317 HAUS3Q68CZ6 603 aa16.03■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-212ENST00000433317 RRAGAQ7L523 313 aa16.03■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CCSER1Q9C0I3 900 aa16.03■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-212ENST00000433317 STIM2Q9P246 746 aa16.03■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-212ENST00000433317 SALL4Q9UJQ4 1053 aa16.03■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-212ENST00000433317 HYOU1Q9Y4L1 999 aa16.03■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-212ENST00000433317 HSF2BPO75031 334 aa16.02■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-212ENST00000433317 MECOMQ03112 1051 aa16.02■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-212ENST00000433317 FBXW10Q5XX13 1052 aa16.02■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-212ENST00000433317 C8orf74Q6P047 294 aa16.02■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-212ENST00000433317 PNMA1Q8ND90 353 aa16.02■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ERGIC2Q96RQ1 377 aa16.02■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-212ENST00000433317 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-212ENST00000433317 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa16.02■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CACNA1SQ13698 1873 aa16.02■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-212ENST00000433317 DCCP43146 1447 aa16.02■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ITGB4P16144 1822 aa16.02■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 OPA1O60313 960 aa16.02■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CPP00450 1065 aa16.02■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 PCP11498 1178 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 EPHB4P54760 987 aa16.02■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 TFAP4Q01664 338 aa16.02■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 LETM2Q2VYF4 491 aa16.02■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ALS2CR12Q96Q35 445 aa16.02■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 FAM107BQ9H098 131 aa16.02■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CPVLQ9H3G5 476 aa16.02■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 PLAGL2Q9UPG8 496 aa16.02■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 BCL9O00512 1426 aa16.02■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ESYT3A0FGR9 886 aa16.01■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ZEB2O60315 1214 aa16.01■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 KRT14P02533 472 aa16.01■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 KLRK1P26718 216 aa16.01■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 MAGEA1P43355 309 aa16.01■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 TMC4Q7Z404 712 aa16.01■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 SEMA6BQ9H3T3 888 aa16.01■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 MCM9Q9NXL9 1143 aa16.01■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 NHSL1Q5SYE7 1610 aa16.01■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 LRRC53A6NM62 1247 aa16.01■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 MYL1P05976 194 aa16.01■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 USP17L8P0C7I0 530 aa16.01■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 PAFAH1B1P43034 410 aa16.01■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 RASSF7Q02833 373 aa16.01■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 KIAA0895Q8NCT3 520 aa16.01■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ZIM3Q96PE6 472 aa16.01■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 SH3GL2Q99962 352 aa16.01■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 FLT1P17948 1338 aa16.01■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 A0A1W2PQJ5 194 aa16■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 NTSR2O95665 410 aa16■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 TCP1P17987 556 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 GUCY2CP25092 1073 aa16■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 TECP42680 631 aa16■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 SLC35G1Q2M3R5 365 aa16■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa16■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 IFT81Q8WYA0 676 aa16■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 M0R2N6 131 aa16■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 NDUFAB1O14561 156 aa16■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 GOLGA8HP0CJ92 632 aa16■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 PRDX5P30044 214 aa16■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CDK17Q00537 523 aa16■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 PPARDQ03181 441 aa16■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 VWA3BQ502W6 1294 aa16■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 GBP6Q6ZN66 633 aa16■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 C3orf67Q6ZVT6 689 aa16■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 DYNLL2Q96FJ2 89 aa16■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 NDST4Q9H3R1 872 aa16■□□□□ 0.15
TTC28-AS1-212ENST00000433317 STRCP1A6NGW2 1772 aa16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms