RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425695.5

HTATSF1-202, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene HTATSF1, Length 885 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-202ENST00000425695 GNAQP50148 359 aa29■■■□□ 2.23
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HTATSF1-202ENST00000425695 MCF2L2Q86YR7 1114 aa29■■■□□ 2.23
HTATSF1-202ENST00000425695 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
HTATSF1-202ENST00000425695 FANCBQ8NB91 859 aa29■■■□□ 2.23
HTATSF1-202ENST00000425695 KATNBL1Q9H079 304 aa29■■■□□ 2.23
HTATSF1-202ENST00000425695 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa29■■■□□ 2.23
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HTATSF1-202ENST00000425695 COL20A1Q9P218 1284 aa28.97■■■□□ 2.23
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HTATSF1-202ENST00000425695 APOBRQ0VD83 1088 aa28.95■■■□□ 2.22
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HTATSF1-202ENST00000425695 RTN1Q16799 776 aa28.94■■■□□ 2.22
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HTATSF1-202ENST00000425695 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
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HTATSF1-202ENST00000425695 H0YGN5 161 aa28.91■■■□□ 2.22
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HTATSF1-202ENST00000425695 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
HTATSF1-202ENST00000425695 EDNRBP24530 442 aa28.89■■■□□ 2.22
HTATSF1-202ENST00000425695 CDC27P30260 824 aa28.89■■■□□ 2.22
HTATSF1-202ENST00000425695 FCHSD1Q86WN1 690 aa28.89■■■□□ 2.22
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HTATSF1-202ENST00000425695 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP28.88■■■□□ 2.21
HTATSF1-202ENST00000425695 KLHDC9Q8NEP7 349 aa28.88■■■□□ 2.21
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