RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418331.6

PTPRJ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 5,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-201ENST00000418331 BMP3P12645 472 aa23.51■■□□□ 1.35
PTPRJ-201ENST00000418331 CDC25BP30305 580 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPRJ-201ENST00000418331 A0A087WWV3 80 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPRJ-201ENST00000418331 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
PTPRJ-201ENST00000418331 HACE1Q8IYU2 909 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPRJ-201ENST00000418331 P2RX5Q93086 422 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPRJ-201ENST00000418331 ITIH3Q06033 890 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPRJ-201ENST00000418331 PYCARDQ9ULZ3 195 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPRJ-201ENST00000418331 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
PTPRJ-201ENST00000418331 LRRIQ4A6NIV6 560 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPRJ-201ENST00000418331 OAS2P29728 719 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
PTPRJ-201ENST00000418331 YARSP54577 528 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
PTPRJ-201ENST00000418331 KRT71Q3SY84 523 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF577Q9BSK1 485 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPRJ-201ENST00000418331 KRIT1O00522 736 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPRJ-201ENST00000418331 PSMC4P43686 418 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPRJ-201ENST00000418331 NRBP2Q9NSY0 501 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPRJ-201ENST00000418331 PARP2Q9UGN5 583 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPRJ-201ENST00000418331 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
PTPRJ-201ENST00000418331 USP17L3A6NCW0 530 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPRJ-201ENST00000418331 USP17L4A6NCW7 530 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPRJ-201ENST00000418331 RPS6KA4O75676 772 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPRJ-201ENST00000418331 TNNC2P02585 160 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPRJ-201ENST00000418331 NR2F2P24468 414 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPRJ-201ENST00000418331 PDE6CP51160 858 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPRJ-201ENST00000418331 FYB2Q5VWT5 728 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPRJ-201ENST00000418331 USP17L1Q7RTZ2 530 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPRJ-201ENST00000418331 CCDC89Q8N998 374 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPRJ-201ENST00000418331 PI4KBQ9UBF8 816 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPRJ-201ENST00000418331 ALKQ9UM73 1620 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPRJ-201ENST00000418331 CDC25AP30304 524 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPRJ-201ENST00000418331 TSC1Q92574 1164 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPRJ-201ENST00000418331 MAN1B1Q9UKM7 699 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPRJ-201ENST00000418331 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPRJ-201ENST00000418331 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP23.49■■□□□ 1.35
PTPRJ-201ENST00000418331 STIM2Q9P246 746 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPRJ-201ENST00000418331 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
PTPRJ-201ENST00000418331 PTPROQ16827 1216 aa23.48■■□□□ 1.35
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
PTPRJ-201ENST00000418331 STK17AQ9UEE5 414 aa23.48■■□□□ 1.35
PTPRJ-201ENST00000418331 AOC3Q16853 763 aa23.48■■□□□ 1.35
PTPRJ-201ENST00000418331 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa23.48■■□□□ 1.35
PTPRJ-201ENST00000418331 ADPGKQ9BRR6 497 aa23.48■■□□□ 1.35
PTPRJ-201ENST00000418331 BRIP1Q9BX63 1249 aa23.48■■□□□ 1.35
PTPRJ-201ENST00000418331 EFCAB8A8MWE9 144 aa23.48■■□□□ 1.35
PTPRJ-201ENST00000418331 FAM184BQ9ULE4 1060 aa23.48■■□□□ 1.35
PTPRJ-201ENST00000418331 PPP2R5EQ16537 467 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPRJ-201ENST00000418331 DENND2CQ68D51 928 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPRJ-201ENST00000418331 C10orf67Q8IYJ2 551 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPRJ-201ENST00000418331 POMGNT1Q8WZA1 660 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPRJ-201ENST00000418331 KRT15P19012 456 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPRJ-201ENST00000418331 CDK8P49336 464 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPRJ-201ENST00000418331 CCDC125Q86Z20 511 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPRJ-201ENST00000418331 WDR11Q9BZH6 1224 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPRJ-201ENST00000418331 SPC25Q9HBM1 224 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPRJ-201ENST00000418331 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
PTPRJ-201ENST00000418331 MYL1P05976 194 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPRJ-201ENST00000418331 LRRC41Q15345 812 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPRJ-201ENST00000418331 SEPT12Q8IYM1 358 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPRJ-201ENST00000418331 GPATCH11Q8N954 259 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPRJ-201ENST00000418331 RABEP2Q9H5N1 569 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPRJ-201ENST00000418331 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
PTPRJ-201ENST00000418331 SLFNL1Q499Z3 407 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPRJ-201ENST00000418331 RIC8AQ9NPQ8 531 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPRJ-201ENST00000418331 GUCY2FP51841 1108 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
PTPRJ-201ENST00000418331 DGKHQ86XP1 1220 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPRJ-201ENST00000418331 ATP6V0A1Q93050 837 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPRJ-201ENST00000418331 PLCB1Q9NQ66 1216 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPRJ-201ENST00000418331 IFNB1P01574 187 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRJ-201ENST00000418331 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
PTPRJ-201ENST00000418331 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
PTPRJ-201ENST00000418331 PPARDQ03181 441 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRJ-201ENST00000418331 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
PTPRJ-201ENST00000418331 LGSNQ5TDP6 509 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRJ-201ENST00000418331 HHATQ5VTY9 493 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRJ-201ENST00000418331 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
PTPRJ-201ENST00000418331 COA1Q9GZY4 146 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRJ-201ENST00000418331 RAD17O75943 681 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRJ-201ENST00000418331 TMEM191BP0C7N4 346 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRJ-201ENST00000418331 GAP43P17677 238 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRJ-201ENST00000418331 ODF2LQ9ULJ1 636 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRJ-201ENST00000418331 NPR1P16066 1061 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRJ-201ENST00000418331 PPP2R5DQ14738 602 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRJ-201ENST00000418331 USP14P54578 494 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRJ-201ENST00000418331 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
PTPRJ-201ENST00000418331 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
PTPRJ-201ENST00000418331 RAB20Q9NX57 234 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRJ-201ENST00000418331 UNC13BO14795 1591 aa23.45■■□□□ 1.35
PTPRJ-201ENST00000418331 STAT2P52630 851 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPRJ-201ENST00000418331 GPR162Q16538 588 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPRJ-201ENST00000418331 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
PTPRJ-201ENST00000418331 FAM160B1Q5W0V3 765 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPRJ-201ENST00000418331 CASC4Q6P4E1 433 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPRJ-201ENST00000418331 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
PTPRJ-201ENST00000418331 RXRBP28702 533 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPRJ-201ENST00000418331 NT5C2P49902 561 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPRJ-201ENST00000418331 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
PTPRJ-201ENST00000418331 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
PTPRJ-201ENST00000418331 SNAP23O00161 211 aa23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.2 ms