RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415164.5

UBXN4-202, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene UBXN4, Length 548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-202ENST00000415164 SLC30A10Q6XR72 485 aa22.77■■□□□ 1.24
UBXN4-202ENST00000415164 OR6J1Q8NGC5 347 aa22.77■■□□□ 1.24
UBXN4-202ENST00000415164 FAM227BQ96M60 508 aa22.77■■□□□ 1.24
UBXN4-202ENST00000415164 TMEM47Q9BQJ4 181 aa22.77■■□□□ 1.24
UBXN4-202ENST00000415164 WDR11Q9BZH6 1224 aa22.77■■□□□ 1.24
UBXN4-202ENST00000415164 SLC28A3Q9HAS3 691 aa22.77■■□□□ 1.24
UBXN4-202ENST00000415164 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
UBXN4-202ENST00000415164 HELLSQ9NRZ9 838 aa22.77■■□□□ 1.24
UBXN4-202ENST00000415164 LRRC37A2A6NM11 1700 aa22.77■■□□□ 1.23
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UBXN4-202ENST00000415164 WNT8AQ9H1J5 351 aa22.76■■□□□ 1.23
UBXN4-202ENST00000415164 Q9Y3F1 56 aa22.76■■□□□ 1.23
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UBXN4-202ENST00000415164 FGAP02671 866 aa22.75■■□□□ 1.23
UBXN4-202ENST00000415164 CYP2C9P11712 490 aa22.75■■□□□ 1.23
UBXN4-202ENST00000415164 CHMP4BP1P59074 171 aa22.75■■□□□ 1.23
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UBXN4-202ENST00000415164 DUSP28Q4G0W2 176 aa22.75■■□□□ 1.23
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UBXN4-202ENST00000415164 POLR3EQ9NVU0 708 aa22.75■■□□□ 1.23
UBXN4-202ENST00000415164 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
UBXN4-202ENST00000415164 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa22.75■■□□□ 1.23
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UBXN4-202ENST00000415164 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa22.74■■□□□ 1.23
UBXN4-202ENST00000415164 CPT1AP50416 773 aa22.74■■□□□ 1.23
UBXN4-202ENST00000415164 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa22.74■■□□□ 1.23
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UBXN4-202ENST00000415164 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa22.74■■□□□ 1.23
UBXN4-202ENST00000415164 PDE1AP54750 535 aa22.73■■□□□ 1.23
UBXN4-202ENST00000415164 ADGRE1Q14246 886 aa22.73■■□□□ 1.23
UBXN4-202ENST00000415164 ALX1Q15699 326 aa22.73■■□□□ 1.23
UBXN4-202ENST00000415164 PPP2R2DQ66LE6 453 aa22.73■■□□□ 1.23
UBXN4-202ENST00000415164 BTNL9Q6UXG8 535 aa22.73■■□□□ 1.23
UBXN4-202ENST00000415164 MORC4Q8TE76 937 aa22.73■■□□□ 1.23
UBXN4-202ENST00000415164 RILPL2Q969X0 211 aa22.73■■□□□ 1.23
UBXN4-202ENST00000415164 CRBNQ96SW2 442 aa22.73■■□□□ 1.23
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UBXN4-202ENST00000415164 THEGQ9P2T0 379 aa22.73■■□□□ 1.23
UBXN4-202ENST00000415164 TNKSO95271 1327 aa22.73■■□□□ 1.23
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UBXN4-202ENST00000415164 MYOGP15173 224 aa22.72■■□□□ 1.23
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UBXN4-202ENST00000415164 USH1GQ495M9 461 aa22.72■■□□□ 1.23
UBXN4-202ENST00000415164 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
UBXN4-202ENST00000415164 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
UBXN4-202ENST00000415164 IL27Q8NEV9 243 aa22.72■■□□□ 1.23
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UBXN4-202ENST00000415164 COPS5Q92905 334 aa22.71■■□□□ 1.23
UBXN4-202ENST00000415164 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa22.71■■□□□ 1.23
UBXN4-202ENST00000415164 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
UBXN4-202ENST00000415164 RAD50Q92878 1312 aa22.71■■□□□ 1.23
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UBXN4-202ENST00000415164 CLEC4DQ8WXI8 215 aa22.7■■□□□ 1.22
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UBXN4-202ENST00000415164 ZNF543Q08ER8 600 aa22.69■■□□□ 1.22
UBXN4-202ENST00000415164 TTLL4Q14679 1199 aa22.69■■□□□ 1.22
UBXN4-202ENST00000415164 NBPF20Q3BBV1 942 aa22.69■■□□□ 1.22
UBXN4-202ENST00000415164 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa22.69■■□□□ 1.22
UBXN4-202ENST00000415164 NOD1Q9Y239 953 aa22.69■■□□□ 1.22
UBXN4-202ENST00000415164 LCTP09848 1927 aa22.69■■□□□ 1.22
UBXN4-202ENST00000415164 CCDC171Q6TFL3 1326 aa22.68■■□□□ 1.22
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UBXN4-202ENST00000415164 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
UBXN4-202ENST00000415164 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP22.68■■□□□ 1.22
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UBXN4-202ENST00000415164 UBA5Q9GZZ9 404 aa22.68■■□□□ 1.22
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UBXN4-202ENST00000415164 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa22.67■■□□□ 1.22
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UBXN4-202ENST00000415164 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
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UBXN4-202ENST00000415164 RETREG2Q8NC44 543 aa22.67■■□□□ 1.22
UBXN4-202ENST00000415164 SCFD2Q8WU76 684 aa22.67■■□□□ 1.22
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UBXN4-202ENST00000415164 CERS4Q9HA82 394 aa22.67■■□□□ 1.22
UBXN4-202ENST00000415164 PNMA2Q9UL42 364 aa22.67■■□□□ 1.22
UBXN4-202ENST00000415164 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa22.67■■□□□ 1.22
UBXN4-202ENST00000415164 NEDD4P46934 1319 aa22.66■■□□□ 1.22
UBXN4-202ENST00000415164 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
UBXN4-202ENST00000415164 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP22.66■■□□□ 1.22
UBXN4-202ENST00000415164 ACTN1P12814 892 aa22.66■■□□□ 1.22
UBXN4-202ENST00000415164 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
UBXN4-202ENST00000415164 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa22.66■■□□□ 1.22
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