RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409189.7

CCL20-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 839 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-202ENST00000409189 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
CCL20-202ENST00000409189 EPHX2P34913 555 aa8.35□□□□□ -1.07
CCL20-202ENST00000409189 ECE1P42892 770 aa8.35□□□□□ -1.07
CCL20-202ENST00000409189 FCGRTP55899 365 aa8.35□□□□□ -1.07
CCL20-202ENST00000409189 PPP2R3AQ06190 1150 aa8.35□□□□□ -1.07
CCL20-202ENST00000409189 PDE4CQ08493 712 aa8.35□□□□□ -1.07
CCL20-202ENST00000409189 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
CCL20-202ENST00000409189 NFE2L2Q16236 605 aa8.35□□□□□ -1.07
CCL20-202ENST00000409189 NETO1Q8TDF5 533 aa8.35□□□□□ -1.07
CCL20-202ENST00000409189 STK35Q8TDR2 534 aa8.35□□□□□ -1.07
CCL20-202ENST00000409189 BCO2Q9BYV7 579 aa8.35□□□□□ -1.07
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CCL20-202ENST00000409189 FANCIQ9NVI1 1328 aa8.34□□□□□ -1.07
CCL20-202ENST00000409189 MAP2K2P36507 400 aa8.34□□□□□ -1.07
CCL20-202ENST00000409189 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa8.34□□□□□ -1.07
CCL20-202ENST00000409189 ZNF792Q3KQV3 632 aa8.34□□□□□ -1.07
CCL20-202ENST00000409189 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
CCL20-202ENST00000409189 CIAPIN1Q6FI81 312 aa8.34□□□□□ -1.07
CCL20-202ENST00000409189 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
CCL20-202ENST00000409189 TAOK3Q9H2K8 898 aa8.34□□□□□ -1.07
CCL20-202ENST00000409189 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
CCL20-202ENST00000409189 HACL1Q9UJ83 578 aa8.34□□□□□ -1.07
CCL20-202ENST00000409189 TJP1Q07157 1748 aa8.34□□□□□ -1.07
CCL20-202ENST00000409189 CA12O43570 354 aa8.33□□□□□ -1.08
CCL20-202ENST00000409189 BRD1O95696 1058 aa8.33□□□□□ -1.08
CCL20-202ENST00000409189 SERPINB2P05120 415 aa8.33□□□□□ -1.08
CCL20-202ENST00000409189 PHKG2P15735 406 aa8.33□□□□□ -1.08
CCL20-202ENST00000409189 ERVK-24P63145 666 aa8.33□□□□□ -1.08
CCL20-202ENST00000409189 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
CCL20-202ENST00000409189 SULF2Q8IWU5 870 aa8.33□□□□□ -1.08
CCL20-202ENST00000409189 FAM181AQ8N9Y4 354 aa8.33□□□□□ -1.08
CCL20-202ENST00000409189 C3orf58Q8NDZ4 430 aa8.33□□□□□ -1.08
CCL20-202ENST00000409189 GCC1Q96CN9 775 aa8.33□□□□□ -1.08
CCL20-202ENST00000409189 DUSP23Q9BVJ7 150 aa8.33□□□□□ -1.08
CCL20-202ENST00000409189 DCTN4Q9UJW0 460 aa8.33□□□□□ -1.08
CCL20-202ENST00000409189 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa8.33□□□□□ -1.08
CCL20-202ENST00000409189 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
CCL20-202ENST00000409189 H0YIN7 160 aa8.32□□□□□ -1.08
CCL20-202ENST00000409189 TREHO43280 583 aa8.32□□□□□ -1.08
CCL20-202ENST00000409189 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
CCL20-202ENST00000409189 FUT4P22083 530 aa8.32□□□□□ -1.08
CCL20-202ENST00000409189 ARNTP27540 789 aa8.32□□□□□ -1.08
CCL20-202ENST00000409189 BNIP3Q12983 259 aa8.32□□□□□ -1.08
CCL20-202ENST00000409189 PLCL1Q15111 1095 aa8.32□□□□□ -1.08
CCL20-202ENST00000409189 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
CCL20-202ENST00000409189 HOMEZQ8IX15 550 aa8.32□□□□□ -1.08
CCL20-202ENST00000409189 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP8.32□□□□□ -1.08
CCL20-202ENST00000409189 ISL2Q96A47 359 aa8.32□□□□□ -1.08
CCL20-202ENST00000409189 ZNF428Q96B54 188 aa8.32□□□□□ -1.08
CCL20-202ENST00000409189 VAV3Q9UKW4 847 aa8.32□□□□□ -1.08
CCL20-202ENST00000409189 CEP290O15078 2479 aa8.31□□□□□ -1.08
CCL20-202ENST00000409189 DLG5Q8TDM6 1919 aa8.31□□□□□ -1.08
CCL20-202ENST00000409189 LEFTY1O75610 366 aa8.31□□□□□ -1.08
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CCL20-202ENST00000409189 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
CCL20-202ENST00000409189 NME2P22392 152 aa8.31□□□□□ -1.08
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CCL20-202ENST00000409189 IFT57Q9NWB7 429 aa8.31□□□□□ -1.08
CCL20-202ENST00000409189 SPG7Q9UQ90 795 aa8.31□□□□□ -1.08
CCL20-202ENST00000409189 HTTP42858 3142 aa8.3□□□□□ -1.08
CCL20-202ENST00000409189 C8AP07357 584 aa8.3□□□□□ -1.08
CCL20-202ENST00000409189 CD8BP10966 210 aa8.3□□□□□ -1.08
CCL20-202ENST00000409189 NTF4P34130 210 aa8.3□□□□□ -1.08
CCL20-202ENST00000409189 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
CCL20-202ENST00000409189 NXPE4Q6UWF7 544 aa8.3□□□□□ -1.08
CCL20-202ENST00000409189 SAPCD2Q86UD0 394 aa8.3□□□□□ -1.08
CCL20-202ENST00000409189 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
CCL20-202ENST00000409189 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
CCL20-202ENST00000409189 SCN11AQ9UI33 1791 aa8.3□□□□□ -1.08
CCL20-202ENST00000409189 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
CCL20-202ENST00000409189 KIF16BQ96L93 1317 aa8.29□□□□□ -1.08
CCL20-202ENST00000409189 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa8.29□□□□□ -1.08
CCL20-202ENST00000409189 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
CCL20-202ENST00000409189 CEACAM5P06731 702 aa8.29□□□□□ -1.08
CCL20-202ENST00000409189 GNAI1P63096 354 aa8.29□□□□□ -1.08
CCL20-202ENST00000409189 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP8.29□□□□□ -1.08
CCL20-202ENST00000409189 SULT6B1Q6IMI4 303 aa8.29□□□□□ -1.08
CCL20-202ENST00000409189 OLFM4Q6UX06 510 aa8.29□□□□□ -1.08
CCL20-202ENST00000409189 FAM214BQ7L5A3 538 aa8.29□□□□□ -1.08
CCL20-202ENST00000409189 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
CCL20-202ENST00000409189 AEBP1Q8IUX7 1158 aa8.29□□□□□ -1.08
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CCL20-202ENST00000409189 GPBAR1Q8TDU6 330 aa8.29□□□□□ -1.08
CCL20-202ENST00000409189 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
CCL20-202ENST00000409189 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa8.29□□□□□ -1.08
CCL20-202ENST00000409189 TNKS2Q9H2K2 1166 aa8.29□□□□□ -1.08
CCL20-202ENST00000409189 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
CCL20-202ENST00000409189 PLAGL2Q9UPG8 496 aa8.29□□□□□ -1.08
CCL20-202ENST00000409189 COL4A5P29400 1685 aa8.29□□□□□ -1.08
CCL20-202ENST00000409189 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
CCL20-202ENST00000409189 BRCA2P51587 3418 aa8.28□□□□□ -1.08
CCL20-202ENST00000409189 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa8.28□□□□□ -1.08
CCL20-202ENST00000409189 EPS15P42566 896 aa8.28□□□□□ -1.08
CCL20-202ENST00000409189 RING1Q06587 406 aa8.28□□□□□ -1.08
CCL20-202ENST00000409189 CCDC136Q96JN2 1154 aa8.28□□□□□ -1.08
CCL20-202ENST00000409189 PHACTR3Q96KR7 559 aa8.28□□□□□ -1.08
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