RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400183.6

USP25-204, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 5,341 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-204ENST00000400183 SLC17A8Q8NDX2 589 aa20.23■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 FAM71BQ8TC56 605 aa20.23■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 AK8Q96MA6 479 aa20.23■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 ATF2P15336 505 aa20.23■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 SATB1Q01826 763 aa20.23■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 SORBS3O60504 671 aa20.23■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 ZNF148Q9UQR1 794 aa20.23■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 OATP04181 439 aa20.23■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 LRCH2Q5VUJ6 765 aa20.23■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 CEP120Q8N960 986 aa20.23■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa20.22■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 PASKQ96RG2 1323 aa20.22■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 PPP2R5AQ15172 486 aa20.22■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 SULF1Q8IWU6 871 aa20.22■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 PCDHA4Q9UN74 947 aa20.22■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 CRKLP46109 303 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 SH2D4BQ5SQS7 431 aa20.22■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 RASEFQ8IZ41 740 aa20.22■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 ATP6V0A1Q93050 837 aa20.22■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 NT5C1BQ96P26 610 aa20.22■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 OSBPL3Q9H4L5 887 aa20.22■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 PYCARDQ9ULZ3 195 aa20.22■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 MFAP3P55082 362 aa20.22■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 ADCK5Q3MIX3 580 aa20.22■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 MUM1L1Q5H9M0 696 aa20.22■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 MAP7D3Q8IWC1 876 aa20.22■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 ATP10DQ9P241 1426 aa20.22■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 KIF3CO14782 793 aa20.21■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 LMNB1P20700 586 aa20.21■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 MYL7Q01449 175 aa20.21■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 POLR3EQ9NVU0 708 aa20.21■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 PFDN6O15212 129 aa20.21■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 CYP21A2P08686 494 aa20.21■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 LTKP29376 864 aa20.21■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 ARHGAP4P98171 946 aa20.21■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 TFDP1Q14186 410 aa20.21■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 USH1CQ9Y6N9 552 aa20.21■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 MYO1FO00160 1098 aa20.21■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 ABL1P00519 1130 aa20.21■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 PIK3CAP42336 1068 aa20.21■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa20.21■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 APBA1Q02410 837 aa20.21■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 CHAMP1Q96JM3 812 aa20.21■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 MLH3Q9UHC1 1453 aa20.2■□□□□ 0.82
USP25-204ENST00000400183 NR2F2P24468 414 aa20.2■□□□□ 0.82
USP25-204ENST00000400183 MAP2K2P36507 400 aa20.2■□□□□ 0.82
USP25-204ENST00000400183 EHHADHQ08426 723 aa20.2■□□□□ 0.82
USP25-204ENST00000400183 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa20.2■□□□□ 0.82
USP25-204ENST00000400183 CCDC170Q8IYT3 715 aa20.2■□□□□ 0.82
USP25-204ENST00000400183 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
USP25-204ENST00000400183 CASP14P31944 242 aa20.2■□□□□ 0.82
USP25-204ENST00000400183 IRX4P78413 519 aa20.2■□□□□ 0.82
USP25-204ENST00000400183 RINT1Q6NUQ1 792 aa20.2■□□□□ 0.82
USP25-204ENST00000400183 CAPN12Q6ZSI9 719 aa20.2■□□□□ 0.82
USP25-204ENST00000400183 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
USP25-204ENST00000400183 RUNDC3BQ96NL0 473 aa20.2■□□□□ 0.82
USP25-204ENST00000400183 MED4Q9NPJ6 270 aa20.2■□□□□ 0.82
USP25-204ENST00000400183 GAP43P17677 238 aa20.2■□□□□ 0.82
USP25-204ENST00000400183 PLCB4Q15147 1175 aa20.2■□□□□ 0.82
USP25-204ENST00000400183 CCDC68Q9H2F9 335 aa20.2■□□□□ 0.82
USP25-204ENST00000400183 CARMIL3Q8ND23 1372 aa20.2■□□□□ 0.82
USP25-204ENST00000400183 TTLL1O95922 423 aa20.2■□□□□ 0.82
USP25-204ENST00000400183 RFX1P22670 979 aa20.2■□□□□ 0.82
USP25-204ENST00000400183 NME8Q8N427 588 aa20.2■□□□□ 0.82
USP25-204ENST00000400183 STK38LQ9Y2H1 464 aa20.2■□□□□ 0.82
USP25-204ENST00000400183 ARHGAP42A6NI28 874 aa20.19■□□□□ 0.82
USP25-204ENST00000400183 ITKQ08881 620 aa20.19■□□□□ 0.82
USP25-204ENST00000400183 PROSER3Q2NL68 480 aa20.19■□□□□ 0.82
USP25-204ENST00000400183 TMC4Q7Z404 712 aa20.19■□□□□ 0.82
USP25-204ENST00000400183 AATKQ6ZMQ8 1374 aa20.19■□□□□ 0.82
USP25-204ENST00000400183 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
USP25-204ENST00000400183 XPOTO43592 962 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
USP25-204ENST00000400183 ATP1A2P50993 1020 aa20.19■□□□□ 0.82
USP25-204ENST00000400183 KCTD2Q14681 263 aa20.19■□□□□ 0.82
USP25-204ENST00000400183 SPDYE2Q495Y8 402 aa20.19■□□□□ 0.82
USP25-204ENST00000400183 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
USP25-204ENST00000400183 CSRNP1Q96S65 589 aa20.19■□□□□ 0.82
USP25-204ENST00000400183 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
USP25-204ENST00000400183 SEPT10Q9P0V9 454 aa20.19■□□□□ 0.82
USP25-204ENST00000400183 RASSF7Q02833 373 aa20.19■□□□□ 0.82
USP25-204ENST00000400183 LMNB2Q03252 620 aa20.19■□□□□ 0.82
USP25-204ENST00000400183 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
USP25-204ENST00000400183 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
USP25-204ENST00000400183 CDKL2Q92772 493 aa20.19■□□□□ 0.82
USP25-204ENST00000400183 EEF2KMTQ96G04 330 aa20.19■□□□□ 0.82
USP25-204ENST00000400183 CAPS2Q9BXY5 557 aa20.19■□□□□ 0.82
USP25-204ENST00000400183 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
USP25-204ENST00000400183 KIF22Q14807 665 aa20.18■□□□□ 0.82
USP25-204ENST00000400183 NXNQ6DKJ4 435 aa20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 361.6 ms