RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399409.7

RABGGTA-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTA, Length 2,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-202ENST00000399409 SV2BQ7L1I2 683 aa25.84■■□□□ 1.73
RABGGTA-202ENST00000399409 LRRC37AA6NMS7 1700 aa25.84■■□□□ 1.73
RABGGTA-202ENST00000399409 C10orf71Q711Q0 1435 aa25.83■■□□□ 1.73
RABGGTA-202ENST00000399409 MYO3BQ8WXR4 1341 aa25.83■■□□□ 1.73
RABGGTA-202ENST00000399409 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa25.83■■□□□ 1.73
RABGGTA-202ENST00000399409 PLA2G4AP47712 749 aa25.83■■□□□ 1.73
RABGGTA-202ENST00000399409 CALCRLQ16602 461 aa25.83■■□□□ 1.73
RABGGTA-202ENST00000399409 SP8Q8IXZ3 490 aa25.83■■□□□ 1.73
RABGGTA-202ENST00000399409 IQCDQ96DY2 449 aa25.83■■□□□ 1.73
RABGGTA-202ENST00000399409 RAB34Q9BZG1 259 aa25.83■■□□□ 1.73
RABGGTA-202ENST00000399409 COA1Q9GZY4 146 aa25.83■■□□□ 1.73
RABGGTA-202ENST00000399409 HAUS4Q9H6D7 363 aa25.83■■□□□ 1.73
RABGGTA-202ENST00000399409 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.72
RABGGTA-202ENST00000399409 ANKRD40Q6AI12 368 aa25.83■■□□□ 1.72
RABGGTA-202ENST00000399409 ZNF662Q6ZS27 426 aa25.83■■□□□ 1.72
RABGGTA-202ENST00000399409 POTEDQ86YR6 584 aa25.83■■□□□ 1.72
RABGGTA-202ENST00000399409 CHP1Q99653 195 aa25.83■■□□□ 1.72
RABGGTA-202ENST00000399409 SWAP70Q9UH65 585 aa25.83■■□□□ 1.72
RABGGTA-202ENST00000399409 STK4Q13043 487 aa25.82■■□□□ 1.72
RABGGTA-202ENST00000399409 LTBP1Q14766 1721 aa25.82■■□□□ 1.72
RABGGTA-202ENST00000399409 MEA1Q16626 185 aa25.82■■□□□ 1.72
RABGGTA-202ENST00000399409 EPC1Q9H2F5 836 aa25.82■■□□□ 1.72
RABGGTA-202ENST00000399409 TMEM260Q9NX78 707 aa25.82■■□□□ 1.72
RABGGTA-202ENST00000399409 LRWD1Q9UFC0 647 aa25.82■■□□□ 1.72
RABGGTA-202ENST00000399409 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa25.81■■□□□ 1.72
RABGGTA-202ENST00000399409 CCDC151A5D8V7 595 aa25.81■■□□□ 1.72
RABGGTA-202ENST00000399409 B4DLN1 442 aa25.81■■□□□ 1.72
RABGGTA-202ENST00000399409 GTF2IP78347 998 aa25.81■■□□□ 1.72
RABGGTA-202ENST00000399409 KRT83P78385 493 aa25.81■■□□□ 1.72
RABGGTA-202ENST00000399409 PDIA5Q14554 519 aa25.81■■□□□ 1.72
RABGGTA-202ENST00000399409 SLC27A3Q5K4L6 730 aa25.81■■□□□ 1.72
RABGGTA-202ENST00000399409 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
RABGGTA-202ENST00000399409 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
RABGGTA-202ENST00000399409 TXKP42681 527 aa25.81■■□□□ 1.72
RABGGTA-202ENST00000399409 LRRC27Q9C0I9 530 aa25.81■■□□□ 1.72
RABGGTA-202ENST00000399409 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
RABGGTA-202ENST00000399409 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
RABGGTA-202ENST00000399409 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
RABGGTA-202ENST00000399409 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa25.8■■□□□ 1.72
RABGGTA-202ENST00000399409 GRB10Q13322 594 aa25.8■■□□□ 1.72
RABGGTA-202ENST00000399409 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
RABGGTA-202ENST00000399409 TTYH3Q9C0H2 523 aa25.8■■□□□ 1.72
RABGGTA-202ENST00000399409 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
RABGGTA-202ENST00000399409 TBC1D8O95759 1140 aa25.8■■□□□ 1.72
RABGGTA-202ENST00000399409 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
RABGGTA-202ENST00000399409 FIGNQ5HY92 759 aa25.8■■□□□ 1.72
RABGGTA-202ENST00000399409 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa25.8■■□□□ 1.72
RABGGTA-202ENST00000399409 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa25.79■■□□□ 1.72
RABGGTA-202ENST00000399409 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
RABGGTA-202ENST00000399409 TTLL1O95922 423 aa25.79■■□□□ 1.72
RABGGTA-202ENST00000399409 AKR1B1P15121 316 aa25.79■■□□□ 1.72
RABGGTA-202ENST00000399409 ZBED6P86452 979 aa25.79■■□□□ 1.72
RABGGTA-202ENST00000399409 UNC13DQ70J99 1090 aa25.79■■□□□ 1.72
RABGGTA-202ENST00000399409 MSANTD4Q8NCY6 345 aa25.79■■□□□ 1.72
RABGGTA-202ENST00000399409 ERGIC2Q96RQ1 377 aa25.79■■□□□ 1.72
RABGGTA-202ENST00000399409 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
RABGGTA-202ENST00000399409 A0A1W2PQJ5 194 aa25.79■■□□□ 1.72
RABGGTA-202ENST00000399409 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
RABGGTA-202ENST00000399409 PICALMQ13492 652 aa25.79■■□□□ 1.72
RABGGTA-202ENST00000399409 CENPPQ6IPU0 288 aa25.79■■□□□ 1.72
RABGGTA-202ENST00000399409 WDR59Q6PJI9 974 aa25.79■■□□□ 1.72
RABGGTA-202ENST00000399409 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
RABGGTA-202ENST00000399409 CCDC170Q8IYT3 715 aa25.79■■□□□ 1.72
RABGGTA-202ENST00000399409 RIC8AQ9NPQ8 531 aa25.79■■□□□ 1.72
RABGGTA-202ENST00000399409 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
RABGGTA-202ENST00000399409 FCER1AP12319 257 aa25.78■■□□□ 1.72
RABGGTA-202ENST00000399409 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
RABGGTA-202ENST00000399409 DDR1Q08345 913 aa25.78■■□□□ 1.72
RABGGTA-202ENST00000399409 ZNF543Q08ER8 600 aa25.78■■□□□ 1.72
RABGGTA-202ENST00000399409 FKBP15Q5T1M5 1219 aa25.78■■□□□ 1.72
RABGGTA-202ENST00000399409 EHBP1Q8NDI1 1231 aa25.78■■□□□ 1.72
RABGGTA-202ENST00000399409 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
RABGGTA-202ENST00000399409 COA7Q96BR5 231 aa25.78■■□□□ 1.72
RABGGTA-202ENST00000399409 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
RABGGTA-202ENST00000399409 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa25.78■■□□□ 1.72
RABGGTA-202ENST00000399409 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
RABGGTA-202ENST00000399409 ABL1P00519 1130 aa25.77■■□□□ 1.72
RABGGTA-202ENST00000399409 TUBBP07437 444 aa25.77■■□□□ 1.72
RABGGTA-202ENST00000399409 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
RABGGTA-202ENST00000399409 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
RABGGTA-202ENST00000399409 PNMA5Q96PV4 448 aa25.77■■□□□ 1.72
RABGGTA-202ENST00000399409 UBXN6Q9BZV1 441 aa25.77■■□□□ 1.72
RABGGTA-202ENST00000399409 QSER1Q2KHR3 1735 aa25.77■■□□□ 1.72
RABGGTA-202ENST00000399409 CTAGE15A4D2H0 777 aa25.77■■□□□ 1.72
RABGGTA-202ENST00000399409 PSMD14O00487 310 aa25.77■■□□□ 1.72
RABGGTA-202ENST00000399409 CTAGE8P0CG41 777 aa25.77■■□□□ 1.72
RABGGTA-202ENST00000399409 CDK17Q00537 523 aa25.77■■□□□ 1.72
RABGGTA-202ENST00000399409 PPP4R3AQ6IN85 833 aa25.77■■□□□ 1.72
RABGGTA-202ENST00000399409 CTAGE6Q86UF2 777 aa25.77■■□□□ 1.72
RABGGTA-202ENST00000399409 CTAGE4Q8IX94 777 aa25.77■■□□□ 1.72
RABGGTA-202ENST00000399409 KIAA0895Q8NCT3 520 aa25.77■■□□□ 1.72
RABGGTA-202ENST00000399409 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa25.77■■□□□ 1.72
RABGGTA-202ENST00000399409 SERPINB13Q9UIV8 391 aa25.77■■□□□ 1.72
RABGGTA-202ENST00000399409 RAB21Q9UL25 225 aa25.77■■□□□ 1.72
RABGGTA-202ENST00000399409 MYO6Q9UM54 1294 aa25.77■■□□□ 1.72
RABGGTA-202ENST00000399409 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa25.77■■□□□ 1.72
RABGGTA-202ENST00000399409 ABCB11O95342 1321 aa25.77■■□□□ 1.72
RABGGTA-202ENST00000399409 AMPD2Q01433 879 aa25.76■■□□□ 1.71
RABGGTA-202ENST00000399409 SEPT12Q8IYM1 358 aa25.76■■□□□ 1.71
RABGGTA-202ENST00000399409 PKNOX2Q96KN3 472 aa25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.6 ms