RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390606.3

IGHV3-20-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable 3-20, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene IGHV3-20, Length 415 nt, Biotype IG V gene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-20-201ENST00000390606 Q6ZUG5 572 aa25.55■■□□□ 1.68
IGHV3-20-201ENST00000390606 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
IGHV3-20-201ENST00000390606 AGXT2Q9BYV1 514 aa25.55■■□□□ 1.68
IGHV3-20-201ENST00000390606 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
IGHV3-20-201ENST00000390606 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa25.54■■□□□ 1.68
IGHV3-20-201ENST00000390606 GHRHRQ02643 423 aa25.54■■□□□ 1.68
IGHV3-20-201ENST00000390606 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
IGHV3-20-201ENST00000390606 TMTC3Q6ZXV5 915 aa25.54■■□□□ 1.68
IGHV3-20-201ENST00000390606 NECAB2Q7Z6G3 386 aa25.54■■□□□ 1.68
IGHV3-20-201ENST00000390606 MCF2L2Q86YR7 1114 aa25.54■■□□□ 1.68
IGHV3-20-201ENST00000390606 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
IGHV3-20-201ENST00000390606 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa25.54■■□□□ 1.68
IGHV3-20-201ENST00000390606 COL20A1Q9P218 1284 aa25.54■■□□□ 1.68
IGHV3-20-201ENST00000390606 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa25.53■■□□□ 1.68
IGHV3-20-201ENST00000390606 ZBTB43O43298 467 aa25.53■■□□□ 1.68
IGHV3-20-201ENST00000390606 COL6A1P12109 1028 aa25.53■■□□□ 1.68
IGHV3-20-201ENST00000390606 PIBF1Q8WXW3 757 aa25.53■■□□□ 1.68
IGHV3-20-201ENST00000390606 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
IGHV3-20-201ENST00000390606 TM6SF1Q9BZW5 370 aa25.53■■□□□ 1.68
IGHV3-20-201ENST00000390606 FAM184BQ9ULE4 1060 aa25.53■■□□□ 1.68
IGHV3-20-201ENST00000390606 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
IGHV3-20-201ENST00000390606 ADCY6O43306 1168 aa25.52■■□□□ 1.68
IGHV3-20-201ENST00000390606 RARBP10826 455 aa25.52■■□□□ 1.68
IGHV3-20-201ENST00000390606 RCAN1P53805 252 aa25.52■■□□□ 1.68
IGHV3-20-201ENST00000390606 TRAF1Q13077 416 aa25.52■■□□□ 1.68
IGHV3-20-201ENST00000390606 DNERQ8NFT8 737 aa25.52■■□□□ 1.68
IGHV3-20-201ENST00000390606 BRF1Q92994 677 aa25.52■■□□□ 1.68
IGHV3-20-201ENST00000390606 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
IGHV3-20-201ENST00000390606 C11orf49Q9H6J7 331 aa25.52■■□□□ 1.68
IGHV3-20-201ENST00000390606 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
IGHV3-20-201ENST00000390606 EDNRBP24530 442 aa25.51■■□□□ 1.67
IGHV3-20-201ENST00000390606 HSD17B4P51659 736 aa25.51■■□□□ 1.67
IGHV3-20-201ENST00000390606 FGD1P98174 961 aa25.51■■□□□ 1.67
IGHV3-20-201ENST00000390606 APOBRQ0VD83 1088 aa25.51■■□□□ 1.67
IGHV3-20-201ENST00000390606 RTN1Q16799 776 aa25.51■■□□□ 1.67
IGHV3-20-201ENST00000390606 CCDC144BQ3MJ40 725 aa25.51■■□□□ 1.67
IGHV3-20-201ENST00000390606 RUFY3Q7L099 469 aa25.51■■□□□ 1.67
IGHV3-20-201ENST00000390606 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
IGHV3-20-201ENST00000390606 LRRC37A2A6NM11 1700 aa25.51■■□□□ 1.67
IGHV3-20-201ENST00000390606 DNM1LO00429 736 aa25.5■■□□□ 1.67
IGHV3-20-201ENST00000390606 CFBP00751 764 aa25.5■■□□□ 1.67
IGHV3-20-201ENST00000390606 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
IGHV3-20-201ENST00000390606 TAPT1Q6NXT6 567 aa25.5■■□□□ 1.67
IGHV3-20-201ENST00000390606 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
IGHV3-20-201ENST00000390606 ARRDC4Q8NCT1 418 aa25.5■■□□□ 1.67
IGHV3-20-201ENST00000390606 TAAR1Q96RJ0 339 aa25.5■■□□□ 1.67
IGHV3-20-201ENST00000390606 HTATIP2Q9BUP3 242 aa25.5■■□□□ 1.67
IGHV3-20-201ENST00000390606 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa25.5■■□□□ 1.67
IGHV3-20-201ENST00000390606 GOLGA8AA7E2F4 631 aa25.49■■□□□ 1.67
IGHV3-20-201ENST00000390606 GOLGA8BA8MQT2 603 aa25.49■■□□□ 1.67
IGHV3-20-201ENST00000390606 SEC24BO95487 1268 aa25.49■■□□□ 1.67
IGHV3-20-201ENST00000390606 CDC27P30260 824 aa25.49■■□□□ 1.67
IGHV3-20-201ENST00000390606 FUT2Q10981 343 aa25.49■■□□□ 1.67
IGHV3-20-201ENST00000390606 LRRC41Q15345 812 aa25.49■■□□□ 1.67
IGHV3-20-201ENST00000390606 EEPD1Q7L9B9 569 aa25.49■■□□□ 1.67
IGHV3-20-201ENST00000390606 CCDC82Q8N4S0 544 aa25.49■■□□□ 1.67
IGHV3-20-201ENST00000390606 VTA1Q9NP79 307 aa25.49■■□□□ 1.67
IGHV3-20-201ENST00000390606 PDGFCQ9NRA1 345 aa25.49■■□□□ 1.67
IGHV3-20-201ENST00000390606 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa25.48■■□□□ 1.67
IGHV3-20-201ENST00000390606 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
IGHV3-20-201ENST00000390606 ADAMTS4O75173 837 aa25.48■■□□□ 1.67
IGHV3-20-201ENST00000390606 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
IGHV3-20-201ENST00000390606 PGK1P00558 417 aa25.48■■□□□ 1.67
IGHV3-20-201ENST00000390606 ADCYAP1R1P41586 468 aa25.48■■□□□ 1.67
IGHV3-20-201ENST00000390606 EVCP57679 992 aa25.48■■□□□ 1.67
IGHV3-20-201ENST00000390606 SAMD3Q8N6K7 520 aa25.48■■□□□ 1.67
IGHV3-20-201ENST00000390606 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
IGHV3-20-201ENST00000390606 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
IGHV3-20-201ENST00000390606 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
IGHV3-20-201ENST00000390606 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa25.48■■□□□ 1.67
IGHV3-20-201ENST00000390606 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa25.47■■□□□ 1.67
IGHV3-20-201ENST00000390606 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
IGHV3-20-201ENST00000390606 NID2Q14112 1375 aa25.46■■□□□ 1.67
IGHV3-20-201ENST00000390606 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa25.46■■□□□ 1.67
IGHV3-20-201ENST00000390606 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
IGHV3-20-201ENST00000390606 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
IGHV3-20-201ENST00000390606 ANAPC15P60006 121 aa25.46■■□□□ 1.67
IGHV3-20-201ENST00000390606 PPP2R5BQ15173 497 aa25.46■■□□□ 1.67
IGHV3-20-201ENST00000390606 C8orf34Q49A92 452 aa25.46■■□□□ 1.67
IGHV3-20-201ENST00000390606 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
IGHV3-20-201ENST00000390606 IL17RAQ96F46 866 aa25.46■■□□□ 1.67
IGHV3-20-201ENST00000390606 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
IGHV3-20-201ENST00000390606 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
IGHV3-20-201ENST00000390606 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP25.45■■□□□ 1.66
IGHV3-20-201ENST00000390606 TNFAIP2Q03169 654 aa25.45■■□□□ 1.66
IGHV3-20-201ENST00000390606 PDE4DQ08499 809 aa25.45■■□□□ 1.66
IGHV3-20-201ENST00000390606 KLHDC9Q8NEP7 349 aa25.45■■□□□ 1.66
IGHV3-20-201ENST00000390606 DPF3Q92784 378 aa25.45■■□□□ 1.66
IGHV3-20-201ENST00000390606 RMDN3Q96TC7 470 aa25.45■■□□□ 1.66
IGHV3-20-201ENST00000390606 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
IGHV3-20-201ENST00000390606 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
IGHV3-20-201ENST00000390606 MYADML2A6NDP7 307 aa25.44■■□□□ 1.66
IGHV3-20-201ENST00000390606 B4DLN1 442 aa25.44■■□□□ 1.66
IGHV3-20-201ENST00000390606 KBTBD13C9JR72 458 aa25.44■■□□□ 1.66
IGHV3-20-201ENST00000390606 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
IGHV3-20-201ENST00000390606 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
IGHV3-20-201ENST00000390606 POLR2MP0CAP2 368 aa25.44■■□□□ 1.66
IGHV3-20-201ENST00000390606 SMPD1P17405 629 aa25.44■■□□□ 1.66
IGHV3-20-201ENST00000390606 ADD1P35611 737 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
IGHV3-20-201ENST00000390606 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
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