RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384540.1

RNU6-601P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 601, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-601P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-601P-201ENST00000384540 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-601P-201ENST00000384540 ANKRD34BA5PLL1 514 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-601P-201ENST00000384540 C2orf71A6NGG8 1288 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-601P-201ENST00000384540 VAMP4O75379 141 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-601P-201ENST00000384540 LIMS1P48059 325 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-601P-201ENST00000384540 SEPHS1P49903 392 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
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RNU6-601P-201ENST00000384540 FAM169BQ8N8A8 192 aa4.6□□□□□ -1.67
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RNU6-601P-201ENST00000384540 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa4.59□□□□□ -1.67
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RNU6-601P-201ENST00000384540 SYN1P17600 705 aa4.58□□□□□ -1.68
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RNU6-601P-201ENST00000384540 MC3RP41968 323 aa4.56□□□□□ -1.68
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RNU6-601P-201ENST00000384540 TRIM59Q8IWR1 403 aa4.56□□□□□ -1.68
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RNU6-601P-201ENST00000384540 CPA5Q8WXQ8 436 aa4.56□□□□□ -1.68
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RNU6-601P-201ENST00000384540 APBA2Q99767 749 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-601P-201ENST00000384540 FAN1Q9Y2M0 1017 aa4.56□□□□□ -1.68
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