RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000377095.9

SLC25A39-202, Transcript of solute carrier family 25 member 39, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC25A39, Length 1,565 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A39-202ENST00000377095 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa22.16■■□□□ 1.14
SLC25A39-202ENST00000377095 TINF2Q9BSI4 451 aa22.16■■□□□ 1.14
SLC25A39-202ENST00000377095 MYCP01106 439 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
SLC25A39-202ENST00000377095 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
SLC25A39-202ENST00000377095 RABEP1Q15276 862 aa22.16■■□□□ 1.14
SLC25A39-202ENST00000377095 ME3Q16798 604 aa22.16■■□□□ 1.14
SLC25A39-202ENST00000377095 MCF2L2Q86YR7 1114 aa22.16■■□□□ 1.14
SLC25A39-202ENST00000377095 DNAH12Q6ZR08 3092 aa22.15■■□□□ 1.14
SLC25A39-202ENST00000377095 LARGE1O95461 756 aa22.15■■□□□ 1.14
SLC25A39-202ENST00000377095 CALML3P27482 149 aa22.15■■□□□ 1.14
SLC25A39-202ENST00000377095 MFSD14CQ5VZR4 134 aa22.15■■□□□ 1.14
SLC25A39-202ENST00000377095 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
SLC25A39-202ENST00000377095 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
SLC25A39-202ENST00000377095 PHKBQ93100 1093 aa22.15■■□□□ 1.14
SLC25A39-202ENST00000377095 UNC93B1Q9H1C4 597 aa22.15■■□□□ 1.14
SLC25A39-202ENST00000377095 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
SLC25A39-202ENST00000377095 CCL5P13501 91 aa22.14■■□□□ 1.13
SLC25A39-202ENST00000377095 HSD17B4P51659 736 aa22.14■■□□□ 1.13
SLC25A39-202ENST00000377095 TRPV1Q8NER1 839 aa22.14■■□□□ 1.13
SLC25A39-202ENST00000377095 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
SLC25A39-202ENST00000377095 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
SLC25A39-202ENST00000377095 COL20A1Q9P218 1284 aa22.14■■□□□ 1.13
SLC25A39-202ENST00000377095 PPFIA3O75145 1194 aa22.13■■□□□ 1.13
SLC25A39-202ENST00000377095 CFBP00751 764 aa22.13■■□□□ 1.13
SLC25A39-202ENST00000377095 PKN1Q16512 942 aa22.13■■□□□ 1.13
SLC25A39-202ENST00000377095 WWC2Q6AWC2 1192 aa22.13■■□□□ 1.13
SLC25A39-202ENST00000377095 TYW1BQ6NUM6 668 aa22.13■■□□□ 1.13
SLC25A39-202ENST00000377095 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP22.13■■□□□ 1.13
SLC25A39-202ENST00000377095 RPTORQ8N122 1335 aa22.13■■□□□ 1.13
SLC25A39-202ENST00000377095 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa22.13■■□□□ 1.13
SLC25A39-202ENST00000377095 CCDC85CA6NKD9 419 aa22.12■■□□□ 1.13
SLC25A39-202ENST00000377095 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
SLC25A39-202ENST00000377095 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
SLC25A39-202ENST00000377095 SAMD3Q8N6K7 520 aa22.12■■□□□ 1.13
SLC25A39-202ENST00000377095 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
SLC25A39-202ENST00000377095 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
SLC25A39-202ENST00000377095 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SLC25A39-202ENST00000377095 CYBAP13498 195 aa22.12■■□□□ 1.13
SLC25A39-202ENST00000377095 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
SLC25A39-202ENST00000377095 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
SLC25A39-202ENST00000377095 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa22.12■■□□□ 1.13
SLC25A39-202ENST00000377095 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa22.12■■□□□ 1.13
SLC25A39-202ENST00000377095 NECAB1Q8N987 351 aa22.12■■□□□ 1.13
SLC25A39-202ENST00000377095 GTF3C6Q969F1 213 aa22.12■■□□□ 1.13
SLC25A39-202ENST00000377095 SLC26A6Q9BXS9 759 aa22.12■■□□□ 1.13
SLC25A39-202ENST00000377095 RNF208Q9H0X6 261 aa22.12■■□□□ 1.13
SLC25A39-202ENST00000377095 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
SLC25A39-202ENST00000377095 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa22.12■■□□□ 1.13
SLC25A39-202ENST00000377095 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SLC25A39-202ENST00000377095 STXBP3O00186 592 aa22.11■■□□□ 1.13
SLC25A39-202ENST00000377095 ARMCX2Q7L311 632 aa22.11■■□□□ 1.13
SLC25A39-202ENST00000377095 MORC4Q8TE76 937 aa22.11■■□□□ 1.13
SLC25A39-202ENST00000377095 TAAR1Q96RJ0 339 aa22.11■■□□□ 1.13
SLC25A39-202ENST00000377095 BARHL2Q9NY43 387 aa22.11■■□□□ 1.13
SLC25A39-202ENST00000377095 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SLC25A39-202ENST00000377095 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SLC25A39-202ENST00000377095 ASB14A6NK59 587 aa22.1■■□□□ 1.13
SLC25A39-202ENST00000377095 MEIS2O14770 477 aa22.1■■□□□ 1.13
SLC25A39-202ENST00000377095 CPLX1O14810 134 aa22.1■■□□□ 1.13
SLC25A39-202ENST00000377095 CTDNEP1O95476 244 aa22.1■■□□□ 1.13
SLC25A39-202ENST00000377095 SCG2P13521 617 aa22.1■■□□□ 1.13
SLC25A39-202ENST00000377095 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
SLC25A39-202ENST00000377095 ST3GAL1Q11201 340 aa22.1■■□□□ 1.13
SLC25A39-202ENST00000377095 DNERQ8NFT8 737 aa22.1■■□□□ 1.13
SLC25A39-202ENST00000377095 KATNBL1Q9H079 304 aa22.1■■□□□ 1.13
SLC25A39-202ENST00000377095 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP22.1■■□□□ 1.134e-7■■■■■ 39.7
SLC25A39-202ENST00000377095 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
SLC25A39-202ENST00000377095 NRBP1Q9UHY1 535 aa22.1■■□□□ 1.13
SLC25A39-202ENST00000377095 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa22.09■■□□□ 1.13
SLC25A39-202ENST00000377095 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
SLC25A39-202ENST00000377095 hCG_1984214I3L0E3 225 aa22.09■■□□□ 1.13
SLC25A39-202ENST00000377095 POLR2MP0CAP2 368 aa22.09■■□□□ 1.13
SLC25A39-202ENST00000377095 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
SLC25A39-202ENST00000377095 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SLC25A39-202ENST00000377095 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
SLC25A39-202ENST00000377095 IL27Q8NEV9 243 aa22.09■■□□□ 1.13
SLC25A39-202ENST00000377095 LRRC37A2A6NM11 1700 aa22.08■■□□□ 1.13
SLC25A39-202ENST00000377095 POTEFA5A3E0 1075 aa22.08■■□□□ 1.13
SLC25A39-202ENST00000377095 PIK3CDO00329 1044 aa22.08■■□□□ 1.13
SLC25A39-202ENST00000377095 GJB1P08034 283 aa22.08■■□□□ 1.13
SLC25A39-202ENST00000377095 EDNRBP24530 442 aa22.08■■□□□ 1.13
SLC25A39-202ENST00000377095 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
SLC25A39-202ENST00000377095 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
SLC25A39-202ENST00000377095 SHISA4Q96DD7 197 aa22.08■■□□□ 1.13
SLC25A39-202ENST00000377095 PSTPIP2Q9H939 334 aa22.08■■□□□ 1.13
SLC25A39-202ENST00000377095 DTNBO60941 627 aa22.08■■□□□ 1.12
SLC25A39-202ENST00000377095 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
SLC25A39-202ENST00000377095 NAPAP54920 295 aa22.08■■□□□ 1.12
SLC25A39-202ENST00000377095 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
SLC25A39-202ENST00000377095 PPP1R18Q6NYC8 613 aa22.08■■□□□ 1.12
SLC25A39-202ENST00000377095 USP17L6PQ6QN14 398 aa22.08■■□□□ 1.12
SLC25A39-202ENST00000377095 RMDN3Q96TC7 470 aa22.08■■□□□ 1.12
SLC25A39-202ENST00000377095 TMEM106CQ9BVX2 250 aa22.08■■□□□ 1.12
SLC25A39-202ENST00000377095 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa22.08■■□□□ 1.12
SLC25A39-202ENST00000377095 FRMPD3Q5JV73 1810 aa22.07■■□□□ 1.12
SLC25A39-202ENST00000377095 ST18O60284 1047 aa22.07■■□□□ 1.12
SLC25A39-202ENST00000377095 ACVR2BQ13705 512 aa22.07■■□□□ 1.12
SLC25A39-202ENST00000377095 LHX8Q68G74 356 aa22.07■■□□□ 1.12
SLC25A39-202ENST00000377095 TRIM22Q8IYM9 498 aa22.07■■□□□ 1.12
SLC25A39-202ENST00000377095 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
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