RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373166.7

TRAPPC3-204, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-204ENST00000373166 CHD7Q9P2D1 2997 aa22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC3-204ENST00000373166 XIRP2A4UGR9 3374 aa22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC3-204ENST00000373166 PFKMP08237 780 aa22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC3-204ENST00000373166 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC3-204ENST00000373166 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC3-204ENST00000373166 PTGS1P23219 599 aa22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC3-204ENST00000373166 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC3-204ENST00000373166 RCSD1Q6JBY9 416 aa22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC3-204ENST00000373166 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC3-204ENST00000373166 KCTD1Q719H9 257 aa22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC3-204ENST00000373166 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC3-204ENST00000373166 STX8Q9UNK0 236 aa22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC3-204ENST00000373166 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC3-204ENST00000373166 PPARAQ07869 468 aa22.61■■□□□ 1.21
TRAPPC3-204ENST00000373166 AAK1Q2M2I8 961 aa22.61■■□□□ 1.21
TRAPPC3-204ENST00000373166 MUM1L1Q5H9M0 696 aa22.61■■□□□ 1.21
TRAPPC3-204ENST00000373166 NSMFQ6X4W1 530 aa22.61■■□□□ 1.21
TRAPPC3-204ENST00000373166 MICALL1Q8N3F8 863 aa22.61■■□□□ 1.21
TRAPPC3-204ENST00000373166 SCLYQ96I15 445 aa22.61■■□□□ 1.21
TRAPPC3-204ENST00000373166 CCPG1Q9ULG6 757 aa22.61■■□□□ 1.21
TRAPPC3-204ENST00000373166 PRR12Q9ULL5 1215 aa22.61■■□□□ 1.21
TRAPPC3-204ENST00000373166 MYOGP15173 224 aa22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC3-204ENST00000373166 SDSP20132 328 aa22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC3-204ENST00000373166 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC3-204ENST00000373166 SNAP25P60880 206 aa22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC3-204ENST00000373166 TMEM63BQ5T3F8 832 aa22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC3-204ENST00000373166 MORC4Q8TE76 937 aa22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC3-204ENST00000373166 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC3-204ENST00000373166 POLR3EQ9NVU0 708 aa22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC3-204ENST00000373166 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC3-204ENST00000373166 MCM3APO60318 1980 aa22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC3-204ENST00000373166 CCDC171Q6TFL3 1326 aa22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC3-204ENST00000373166 TSPY2A6NKD2 308 aa22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC3-204ENST00000373166 HIP1O00291 1037 aa22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC3-204ENST00000373166 FOXP2O15409 715 aa22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC3-204ENST00000373166 PDE4AP27815 886 aa22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC3-204ENST00000373166 DUSP28Q4G0W2 176 aa22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC3-204ENST00000373166 VPS53Q5VIR6 699 aa22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC3-204ENST00000373166 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC3-204ENST00000373166 MYH4Q9Y623 1939 aa22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC3-204ENST00000373166 BMP1P13497 986 aa22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC3-204ENST00000373166 CPT1AP50416 773 aa22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC3-204ENST00000373166 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC3-204ENST00000373166 TMEM67Q5HYA8 995 aa22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC3-204ENST00000373166 VWCEQ96DN2 955 aa22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC3-204ENST00000373166 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC3-204ENST00000373166 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC3-204ENST00000373166 BDP1A6H8Y1 2624 aa22.58■■□□□ 1.2
TRAPPC3-204ENST00000373166 TNKSO95271 1327 aa22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC3-204ENST00000373166 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC3-204ENST00000373166 ICAM1P05362 532 aa22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC3-204ENST00000373166 CYP2C9P11712 490 aa22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC3-204ENST00000373166 ACTN1P12814 892 aa22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC3-204ENST00000373166 TTLL4Q14679 1199 aa22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC3-204ENST00000373166 ALX1Q15699 326 aa22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC3-204ENST00000373166 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC3-204ENST00000373166 WDR11Q9BZH6 1224 aa22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC3-204ENST00000373166 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa22.56■■□□□ 1.2
TRAPPC3-204ENST00000373166 PURAQ00577 322 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
TRAPPC3-204ENST00000373166 TFF2Q03403 129 aa22.56■■□□□ 1.2
TRAPPC3-204ENST00000373166 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
TRAPPC3-204ENST00000373166 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
TRAPPC3-204ENST00000373166 TTC22Q5TAA0 569 aa22.56■■□□□ 1.2
TRAPPC3-204ENST00000373166 DEFB128Q7Z7B8 93 aa22.56■■□□□ 1.2
TRAPPC3-204ENST00000373166 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa22.56■■□□□ 1.2
TRAPPC3-204ENST00000373166 IL17RBQ9NRM6 502 aa22.56■■□□□ 1.2
TRAPPC3-204ENST00000373166 MTMR7Q9Y216 660 aa22.56■■□□□ 1.2
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZMYM6O95789 1325 aa22.56■■□□□ 1.2
TRAPPC3-204ENST00000373166 CA3P07451 260 aa22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC3-204ENST00000373166 MYL3P08590 195 aa22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC3-204ENST00000373166 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC3-204ENST00000373166 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC3-204ENST00000373166 RFC2P35250 354 aa22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC3-204ENST00000373166 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC3-204ENST00000373166 CCDC96Q2M329 555 aa22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC3-204ENST00000373166 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC3-204ENST00000373166 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC3-204ENST00000373166 DCAF4Q8WV16 495 aa22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC3-204ENST00000373166 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC3-204ENST00000373166 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC3-204ENST00000373166 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC3-204ENST00000373166 NMT2O60551 498 aa22.54■■□□□ 1.2
TRAPPC3-204ENST00000373166 PLA2G5P39877 138 aa22.54■■□□□ 1.2
TRAPPC3-204ENST00000373166 CTDSPL2Q05D32 466 aa22.54■■□□□ 1.2
TRAPPC3-204ENST00000373166 FAM47CQ5HY64 1035 aa22.54■■□□□ 1.2
TRAPPC3-204ENST00000373166 OR6J1Q8NGC5 347 aa22.54■■□□□ 1.2
TRAPPC3-204ENST00000373166 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa22.54■■□□□ 1.2
TRAPPC3-204ENST00000373166 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
TRAPPC3-204ENST00000373166 ANAPC4Q9UJX5 808 aa22.54■■□□□ 1.2
TRAPPC3-204ENST00000373166 MTCH2Q9Y6C9 303 aa22.54■■□□□ 1.2
TRAPPC3-204ENST00000373166 MYO9BQ13459 2157 aa22.54■■□□□ 1.2
TRAPPC3-204ENST00000373166 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
TRAPPC3-204ENST00000373166 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
TRAPPC3-204ENST00000373166 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
TRAPPC3-204ENST00000373166 RASGRP2Q7LDG7 609 aa22.53■■□□□ 1.2
TRAPPC3-204ENST00000373166 RETREG2Q8NC44 543 aa22.53■■□□□ 1.2
TRAPPC3-204ENST00000373166 FAM122AQ96E09 287 aa22.53■■□□□ 1.2
TRAPPC3-204ENST00000373166 SLC9A7Q96T83 725 aa22.53■■□□□ 1.2
TRAPPC3-204ENST00000373166 RAD50Q92878 1312 aa22.53■■□□□ 1.2
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