RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000371786.3

C9orf116-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 116, humanhuman

TSL 2

Gene C9orf116, Length 612 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf116-201ENST00000371786 POLR3EQ9NVU0 708 aa20.35■□□□□ 0.85
C9orf116-201ENST00000371786 CLIC4Q9Y696 253 aa20.35■□□□□ 0.85
C9orf116-201ENST00000371786 FIBPO43427 364 aa20.34■□□□□ 0.85
C9orf116-201ENST00000371786 FOSP01100 380 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
C9orf116-201ENST00000371786 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
C9orf116-201ENST00000371786 HSD17B4P51659 736 aa20.34■□□□□ 0.85
C9orf116-201ENST00000371786 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
C9orf116-201ENST00000371786 NFKBIBQ15653 356 aa20.34■□□□□ 0.85
C9orf116-201ENST00000371786 INF2Q27J81 1249 aa20.34■□□□□ 0.85
C9orf116-201ENST00000371786 PGBD1Q96JS3 809 aa20.34■□□□□ 0.85
C9orf116-201ENST00000371786 SPATC1LQ9H0A9 340 aa20.34■□□□□ 0.85
C9orf116-201ENST00000371786 GDPD2Q9HCC8 539 aa20.34■□□□□ 0.85
C9orf116-201ENST00000371786 TXNRD2Q9NNW7 524 aa20.34■□□□□ 0.85
C9orf116-201ENST00000371786 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
C9orf116-201ENST00000371786 RCOR1Q9UKL0 485 aa20.34■□□□□ 0.85
C9orf116-201ENST00000371786 RASSF10A6NK89 507 aa20.33■□□□□ 0.85
C9orf116-201ENST00000371786 GOLGA6L22H0YM25 854 aa20.33■□□□□ 0.85
C9orf116-201ENST00000371786 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP20.33■□□□□ 0.85
C9orf116-201ENST00000371786 ATP2B1P20020 1258 aa20.33■□□□□ 0.85
C9orf116-201ENST00000371786 NASPP49321 788 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
C9orf116-201ENST00000371786 NBR1Q14596 966 aa20.33■□□□□ 0.85
C9orf116-201ENST00000371786 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
C9orf116-201ENST00000371786 DEFB115Q30KQ5 88 aa20.33■□□□□ 0.85
C9orf116-201ENST00000371786 TTC38Q5R3I4 469 aa20.33■□□□□ 0.85
C9orf116-201ENST00000371786 CYP4F22Q6NT55 531 aa20.33■□□□□ 0.85
C9orf116-201ENST00000371786 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
C9orf116-201ENST00000371786 CHST13Q8NET6 341 aa20.33■□□□□ 0.85
C9orf116-201ENST00000371786 TBCKQ8TEA7 893 aa20.33■□□□□ 0.85
C9orf116-201ENST00000371786 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
C9orf116-201ENST00000371786 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
C9orf116-201ENST00000371786 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
C9orf116-201ENST00000371786 MAF1Q9H063 256 aa20.33■□□□□ 0.85
C9orf116-201ENST00000371786 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa20.33■□□□□ 0.85
C9orf116-201ENST00000371786 YEATS4O95619 227 aa20.32■□□□□ 0.84
C9orf116-201ENST00000371786 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
C9orf116-201ENST00000371786 SREBF2Q12772 1141 aa20.32■□□□□ 0.84
C9orf116-201ENST00000371786 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa20.32■□□□□ 0.84
C9orf116-201ENST00000371786 Q3C1V9 767 aa20.32■□□□□ 0.84
C9orf116-201ENST00000371786 IFNL1Q8IU54 200 aa20.32■□□□□ 0.84
C9orf116-201ENST00000371786 TMEM87AQ8NBN3 555 aa20.32■□□□□ 0.84
C9orf116-201ENST00000371786 SPATA32Q96LK8 384 aa20.32■□□□□ 0.84
C9orf116-201ENST00000371786 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
C9orf116-201ENST00000371786 ANO3Q9BYT9 981 aa20.32■□□□□ 0.84
C9orf116-201ENST00000371786 ACAD9Q9H845 621 aa20.32■□□□□ 0.84
C9orf116-201ENST00000371786 SPDYE3A6NKU9 549 aa20.31■□□□□ 0.84
C9orf116-201ENST00000371786 WNT7AO00755 349 aa20.31■□□□□ 0.84
C9orf116-201ENST00000371786 SLC25A27O95847 323 aa20.31■□□□□ 0.84
C9orf116-201ENST00000371786 TM4SF4P48230 202 aa20.31■□□□□ 0.84
C9orf116-201ENST00000371786 PTPAQ15257 358 aa20.31■□□□□ 0.84
C9orf116-201ENST00000371786 NEK8Q86SG6 692 aa20.31■□□□□ 0.84
C9orf116-201ENST00000371786 FCHSD1Q86WN1 690 aa20.31■□□□□ 0.84
C9orf116-201ENST00000371786 LINC00301Q8NCQ3 95 aa20.31■□□□□ 0.84
C9orf116-201ENST00000371786 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
C9orf116-201ENST00000371786 FBXO40Q9UH90 709 aa20.31■□□□□ 0.84
C9orf116-201ENST00000371786 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
C9orf116-201ENST00000371786 ELP1O95163 1332 aa20.3■□□□□ 0.84
C9orf116-201ENST00000371786 DDX11L8A8MPP1 907 aa20.3■□□□□ 0.84
C9orf116-201ENST00000371786 EDIL3O43854 480 aa20.3■□□□□ 0.84
C9orf116-201ENST00000371786 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
C9orf116-201ENST00000371786 COPB2P35606 906 aa20.3■□□□□ 0.84
C9orf116-201ENST00000371786 RPS6P62753 249 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
C9orf116-201ENST00000371786 ERVK-9P63128 1117 aa20.3■□□□□ 0.84
C9orf116-201ENST00000371786 ERVK-24P63145 666 aa20.3■□□□□ 0.84
C9orf116-201ENST00000371786 GRM1Q13255 1194 aa20.3■□□□□ 0.84
C9orf116-201ENST00000371786 SLC39A14Q15043 492 aa20.3■□□□□ 0.84
C9orf116-201ENST00000371786 STK38Q15208 465 aa20.3■□□□□ 0.84
C9orf116-201ENST00000371786 ZNF174Q15697 407 aa20.3■□□□□ 0.84
C9orf116-201ENST00000371786 NSMFQ6X4W1 530 aa20.3■□□□□ 0.84
C9orf116-201ENST00000371786 RNF207Q6ZRF8 634 aa20.3■□□□□ 0.84
C9orf116-201ENST00000371786 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa20.3■□□□□ 0.84
C9orf116-201ENST00000371786 ZIC5Q96T25 663 aa20.3■□□□□ 0.84
C9orf116-201ENST00000371786 LMBRD1Q9NUN5 540 aa20.3■□□□□ 0.84
C9orf116-201ENST00000371786 MORF4L1Q9UBU8 362 aa20.3■□□□□ 0.84
C9orf116-201ENST00000371786 NOGQ13253 232 aa20.29■□□□□ 0.84
C9orf116-201ENST00000371786 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
C9orf116-201ENST00000371786 NCAPG2Q86XI2 1143 aa20.29■□□□□ 0.84
C9orf116-201ENST00000371786 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa20.29■□□□□ 0.84
C9orf116-201ENST00000371786 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
C9orf116-201ENST00000371786 CRYGNQ8WXF5 182 aa20.29■□□□□ 0.84
C9orf116-201ENST00000371786 CAPNS2Q96L46 248 aa20.29■□□□□ 0.84
C9orf116-201ENST00000371786 COL20A1Q9P218 1284 aa20.29■□□□□ 0.84
C9orf116-201ENST00000371786 CEP131Q9UPN4 1083 aa20.29■□□□□ 0.84
C9orf116-201ENST00000371786 SPTLC2O15270 562 aa20.28■□□□□ 0.84
C9orf116-201ENST00000371786 BMP15O95972 392 aa20.28■□□□□ 0.84
C9orf116-201ENST00000371786 ERCC3P19447 782 aa20.28■□□□□ 0.84
C9orf116-201ENST00000371786 SREBF1P36956 1147 aa20.28■□□□□ 0.84
C9orf116-201ENST00000371786 USP11P51784 963 aa20.28■□□□□ 0.84
C9orf116-201ENST00000371786 LETM2Q2VYF4 491 aa20.28■□□□□ 0.84
C9orf116-201ENST00000371786 SLC30A10Q6XR72 485 aa20.28■□□□□ 0.84
C9orf116-201ENST00000371786 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP20.28■□□□□ 0.84
C9orf116-201ENST00000371786 SHCBP1Q8NEM2 672 aa20.28■□□□□ 0.84
C9orf116-201ENST00000371786 KCNG4Q8TDN1 519 aa20.28■□□□□ 0.84
C9orf116-201ENST00000371786 EHMT1Q9H9B1 1298 aa20.28■□□□□ 0.84
C9orf116-201ENST00000371786 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
C9orf116-201ENST00000371786 ADGRA2Q96PE1 1338 aa20.27■□□□□ 0.84
C9orf116-201ENST00000371786 PTMSP20962 102 aa20.27■□□□□ 0.84
C9orf116-201ENST00000371786 MCM7P33993 719 aa20.27■□□□□ 0.84
C9orf116-201ENST00000371786 CCNA1P78396 465 aa20.27■□□□□ 0.84
C9orf116-201ENST00000371786 ARHGAP4P98171 946 aa20.27■□□□□ 0.84
C9orf116-201ENST00000371786 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.2 ms