RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000371746.7

LHX3-201, Transcript of LIM homeobox 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LHX3, Length 2,403 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX3-201ENST00000371746 CIAPIN1Q6FI81 312 aa26.75■■□□□ 1.87
LHX3-201ENST00000371746 MTFR1LQ9H019 292 aa26.75■■□□□ 1.87
LHX3-201ENST00000371746 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa26.75■■□□□ 1.87
LHX3-201ENST00000371746 POTEMA6NI47 508 aa26.75■■□□□ 1.87
LHX3-201ENST00000371746 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
LHX3-201ENST00000371746 VSTM4Q8IW00 320 aa26.75■■□□□ 1.87
LHX3-201ENST00000371746 MTMR14Q8NCE2 650 aa26.75■■□□□ 1.87
LHX3-201ENST00000371746 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
LHX3-201ENST00000371746 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
LHX3-201ENST00000371746 PPP4R3AQ6IN85 833 aa26.74■■□□□ 1.87
LHX3-201ENST00000371746 UIMC1Q96RL1 719 aa26.74■■□□□ 1.87
LHX3-201ENST00000371746 AMNQ9BXJ7 453 aa26.74■■□□□ 1.87
LHX3-201ENST00000371746 RMND1Q9NWS8 449 aa26.74■■□□□ 1.87
LHX3-201ENST00000371746 LRWD1Q9UFC0 647 aa26.74■■□□□ 1.87
LHX3-201ENST00000371746 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP26.74■■□□□ 1.87
LHX3-201ENST00000371746 EGFRP00533 1210 aa26.73■■□□□ 1.87
LHX3-201ENST00000371746 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP26.73■■□□□ 1.87
LHX3-201ENST00000371746 FKBP1CQ5VVH2 108 aa26.73■■□□□ 1.87
LHX3-201ENST00000371746 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa26.73■■□□□ 1.87
LHX3-201ENST00000371746 MYOZ2Q9NPC6 264 aa26.73■■□□□ 1.87
LHX3-201ENST00000371746 MEIS2O14770 477 aa26.73■■□□□ 1.87
LHX3-201ENST00000371746 FBXO11Q86XK2 927 aa26.73■■□□□ 1.87
LHX3-201ENST00000371746 CCDC150Q8NCX0 1101 aa26.73■■□□□ 1.87
LHX3-201ENST00000371746 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
LHX3-201ENST00000371746 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
LHX3-201ENST00000371746 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
LHX3-201ENST00000371746 KMT5BQ4FZB7 885 aa26.72■■□□□ 1.87
LHX3-201ENST00000371746 HAS1Q92839 578 aa26.72■■□□□ 1.87
LHX3-201ENST00000371746 KLRC4O43908 158 aa26.71■■□□□ 1.87
LHX3-201ENST00000371746 PRCPP42785 496 aa26.71■■□□□ 1.87
LHX3-201ENST00000371746 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
LHX3-201ENST00000371746 TMEM266Q2M3C6 531 aa26.71■■□□□ 1.87
LHX3-201ENST00000371746 ANO3Q9BYT9 981 aa26.71■■□□□ 1.87
LHX3-201ENST00000371746 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
LHX3-201ENST00000371746 PRR12Q9ULL5 1215 aa26.71■■□□□ 1.87
LHX3-201ENST00000371746 BCS1LQ9Y276 419 aa26.71■■□□□ 1.87
LHX3-201ENST00000371746 TMX2Q9Y320 296 aa26.71■■□□□ 1.87
LHX3-201ENST00000371746 GOLGA8FQ08AF8 430 aa26.71■■□□□ 1.87
LHX3-201ENST00000371746 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa26.71■■□□□ 1.87
LHX3-201ENST00000371746 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
LHX3-201ENST00000371746 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
LHX3-201ENST00000371746 FAM83AQ86UY5 434 aa26.71■■□□□ 1.87
LHX3-201ENST00000371746 CUEDC2Q9H467 287 aa26.71■■□□□ 1.87
LHX3-201ENST00000371746 FAM83BQ5T0W9 1011 aa26.7■■□□□ 1.87
LHX3-201ENST00000371746 CDKAL1Q5VV42 579 aa26.7■■□□□ 1.87
LHX3-201ENST00000371746 CALML4Q96GE6 196 aa26.7■■□□□ 1.87
LHX3-201ENST00000371746 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.87
LHX3-201ENST00000371746 NUDT12Q9BQG2 462 aa26.7■■□□□ 1.87
LHX3-201ENST00000371746 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa26.7■■□□□ 1.86
LHX3-201ENST00000371746 USP27XA6NNY8 438 aa26.7■■□□□ 1.86
LHX3-201ENST00000371746 PAK1Q13153 545 aa26.7■■□□□ 1.86
LHX3-201ENST00000371746 GRB10Q13322 594 aa26.7■■□□□ 1.86
LHX3-201ENST00000371746 BTNL9Q6UXG8 535 aa26.7■■□□□ 1.86
LHX3-201ENST00000371746 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
LHX3-201ENST00000371746 NELFBQ8WX92 580 aa26.7■■□□□ 1.86
LHX3-201ENST00000371746 TRIM9Q9C026 710 aa26.7■■□□□ 1.86
LHX3-201ENST00000371746 GLT8D2Q9H1C3 349 aa26.7■■□□□ 1.86
LHX3-201ENST00000371746 PGAP2Q9UHJ9 254 aa26.69■■□□□ 1.86
LHX3-201ENST00000371746 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa26.69■■□□□ 1.86
LHX3-201ENST00000371746 MYL1P05976 194 aa26.69■■□□□ 1.86
LHX3-201ENST00000371746 STAT2P52630 851 aa26.69■■□□□ 1.86
LHX3-201ENST00000371746 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
LHX3-201ENST00000371746 RWDD2AQ9UIY3 292 aa26.69■■□□□ 1.86
LHX3-201ENST00000371746 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
LHX3-201ENST00000371746 PNMA5Q96PV4 448 aa26.68■■□□□ 1.86
LHX3-201ENST00000371746 MAGEF1Q9HAY2 307 aa26.68■■□□□ 1.86
LHX3-201ENST00000371746 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa26.68■■□□□ 1.86
LHX3-201ENST00000371746 MYH7BA7E2Y1 1941 aa26.68■■□□□ 1.86
LHX3-201ENST00000371746 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
LHX3-201ENST00000371746 KCNB1Q14721 858 aa26.68■■□□□ 1.86
LHX3-201ENST00000371746 RAB34Q9BZG1 259 aa26.68■■□□□ 1.86
LHX3-201ENST00000371746 GOPCQ9HD26 462 aa26.68■■□□□ 1.86
LHX3-201ENST00000371746 OPLAHO14841 1288 aa26.67■■□□□ 1.86
LHX3-201ENST00000371746 MARCH6O60337 910 aa26.67■■□□□ 1.86
LHX3-201ENST00000371746 TBC1D12O60347 775 aa26.67■■□□□ 1.86
LHX3-201ENST00000371746 CAP2P40123 477 aa26.67■■□□□ 1.86
LHX3-201ENST00000371746 SNX29Q8TEQ0 813 aa26.67■■□□□ 1.86
LHX3-201ENST00000371746 A0A1B0GTH6 734 aa26.67■■□□□ 1.86
LHX3-201ENST00000371746 RHOBTB3O94955 611 aa26.67■■□□□ 1.86
LHX3-201ENST00000371746 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
LHX3-201ENST00000371746 RASSF7Q02833 373 aa26.67■■□□□ 1.86
LHX3-201ENST00000371746 PDIA5Q14554 519 aa26.67■■□□□ 1.86
LHX3-201ENST00000371746 RASA3Q14644 834 aa26.67■■□□□ 1.86
LHX3-201ENST00000371746 ADSSL1Q8N142 457 aa26.67■■□□□ 1.86
LHX3-201ENST00000371746 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa26.67■■□□□ 1.86
LHX3-201ENST00000371746 ASIC1P78348 528 aa26.66■■□□□ 1.86
LHX3-201ENST00000371746 NR1I3Q14994 352 aa26.66■■□□□ 1.86
LHX3-201ENST00000371746 TNIP1Q15025 636 aa26.66■■□□□ 1.86
LHX3-201ENST00000371746 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
LHX3-201ENST00000371746 CCDC125Q86Z20 511 aa26.66■■□□□ 1.86
LHX3-201ENST00000371746 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa26.66■■□□□ 1.86
LHX3-201ENST00000371746 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
LHX3-201ENST00000371746 TRIM49BA6NDI0 452 aa26.66■■□□□ 1.86
LHX3-201ENST00000371746 TEX33O43247 280 aa26.66■■□□□ 1.86
LHX3-201ENST00000371746 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa26.66■■□□□ 1.86
LHX3-201ENST00000371746 PCDHA12Q9UN75 941 aa26.66■■□□□ 1.86
LHX3-201ENST00000371746 PMS1P54277 932 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
LHX3-201ENST00000371746 ARHGAP4P98171 946 aa26.65■■□□□ 1.86
LHX3-201ENST00000371746 AP3B2Q13367 1082 aa26.65■■□□□ 1.86
LHX3-201ENST00000371746 MCM6Q14566 821 aa26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.9 ms