RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368205.7

PTPRK-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 662 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-202ENST00000368205 ZNF394Q53GI3 561 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRK-202ENST00000368205 FBXW10Q5XX13 1052 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRK-202ENST00000368205 CABP7Q86V35 215 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRK-202ENST00000368205 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
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PTPRK-202ENST00000368205 HAUS7Q99871 368 aa6.94□□□□□ -1.3
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PTPRK-202ENST00000368205 MCMBPQ9BTE3 642 aa6.94□□□□□ -1.3
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PTPRK-202ENST00000368205 MC3RP41968 323 aa6.93□□□□□ -1.3
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PTPRK-202ENST00000368205 CPA5Q8WXQ8 436 aa6.93□□□□□ -1.3
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PTPRK-202ENST00000368205 USP40Q9NVE5 1235 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRK-202ENST00000368205 NUDT5Q9UKK9 219 aa6.92□□□□□ -1.3
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PTPRK-202ENST00000368205 MTA3Q9BTC8 594 aa6.91□□□□□ -1.3
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PTPRK-202ENST00000368205 GRB10Q13322 594 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRK-202ENST00000368205 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
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PTPRK-202ENST00000368205 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
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PTPRK-202ENST00000368205 ADCY4Q8NFM4 1077 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRK-202ENST00000368205 CRBNQ96SW2 442 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRK-202ENST00000368205 FBLN5Q9UBX5 448 aa6.9□□□□□ -1.3
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PTPRK-202ENST00000368205 BACE2Q9Y5Z0 518 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRK-202ENST00000368205 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRK-202ENST00000368205 STXBP3O00186 592 aa6.89□□□□□ -1.31
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PTPRK-202ENST00000368205 SOX9P48436 509 aa6.89□□□□□ -1.31
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PTPRK-202ENST00000368205 AMPD2Q01433 879 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRK-202ENST00000368205 WWC2Q6AWC2 1192 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRK-202ENST00000368205 CCDC81Q6ZN84 652 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRK-202ENST00000368205 FERMT3Q86UX7 667 aa6.88□□□□□ -1.31
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PTPRK-202ENST00000368205 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRK-202ENST00000368205 RXFP1Q9HBX9 757 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRK-202ENST00000368205 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
PTPRK-202ENST00000368205 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP6.88□□□□□ -1.31
PTPRK-202ENST00000368205 NTMQ9P121 344 aa6.88□□□□□ -1.31
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PTPRK-202ENST00000368205 PAMP19021 973 aa6.87□□□□□ -1.31
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PTPRK-202ENST00000368205 GJA9P57773 515 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRK-202ENST00000368205 SLC7A5Q01650 507 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRK-202ENST00000368205 ZNF827Q17R98 1081 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRK-202ENST00000368205 LINC00482Q8N8I6 264 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRK-202ENST00000368205 NOX5Q96PH1 765 aa6.87□□□□□ -1.31
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PTPRK-202ENST00000368205 CNR2P34972 360 aa6.86□□□□□ -1.31
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PTPRK-202ENST00000368205 DPY19L1Q2PZI1 675 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRK-202ENST00000368205 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
PTPRK-202ENST00000368205 CPNE8Q86YQ8 564 aa6.86□□□□□ -1.31
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PTPRK-202ENST00000368205 RASGRP4Q8TDF6 673 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRK-202ENST00000368205 KLHL6Q8WZ60 621 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRK-202ENST00000368205 FGD4Q96M96 766 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRK-202ENST00000368205 GULP1Q9UBP9 304 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRK-202ENST00000368205 PCDHB10Q9UN67 800 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRK-202ENST00000368205 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRK-202ENST00000368205 C7orf72A4D263 438 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRK-202ENST00000368205 TTLL7Q6ZT98 887 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRK-202ENST00000368205 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
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