RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365200.1

RNU6-1175P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1175, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1175P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1175P-201ENST00000365200 AMPD2Q01433 879 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-1175P-201ENST00000365200 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-1175P-201ENST00000365200 GRB10Q13322 594 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-1175P-201ENST00000365200 VWA3BQ502W6 1294 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-1175P-201ENST00000365200 FRMD5Q7Z6J6 570 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-1175P-201ENST00000365200 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-1175P-201ENST00000365200 CABP7Q86V35 215 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-1175P-201ENST00000365200 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-1175P-201ENST00000365200 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-1175P-201ENST00000365200 SYT8Q8NBV8 401 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-1175P-201ENST00000365200 NETO2Q8NC67 525 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-1175P-201ENST00000365200 FNIP1Q8TF40 1166 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-1175P-201ENST00000365200 ALG3Q92685 438 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-1175P-201ENST00000365200 TSPAN17Q96FV3 270 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-1175P-201ENST00000365200 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-1175P-201ENST00000365200 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-1175P-201ENST00000365200 SUSD2Q9UGT4 822 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-1175P-201ENST00000365200 BACE2Q9Y5Z0 518 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-1175P-201ENST00000365200 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-1175P-201ENST00000365200 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-1175P-201ENST00000365200 C2orf71A6NGG8 1288 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-1175P-201ENST00000365200 STXBP3O00186 592 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-1175P-201ENST00000365200 VAMP4O75379 141 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-1175P-201ENST00000365200 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-1175P-201ENST00000365200 ASGR2P07307 311 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-1175P-201ENST00000365200 CELA3BP08861 270 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-1175P-201ENST00000365200 GJA8P48165 433 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-1175P-201ENST00000365200 KCNC1P48547 511 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-1175P-201ENST00000365200 SEPHS1P49903 392 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-1175P-201ENST00000365200 SLURP1P55000 103 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-1175P-201ENST00000365200 CASP7P55210 303 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-1175P-201ENST00000365200 HTRA3P83110 453 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-1175P-201ENST00000365200 DPY19L1Q2PZI1 675 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-1175P-201ENST00000365200 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-1175P-201ENST00000365200 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-1175P-201ENST00000365200 LZTR1Q8N653 840 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-1175P-201ENST00000365200 KLHL6Q8WZ60 621 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-1175P-201ENST00000365200 FGD4Q96M96 766 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-1175P-201ENST00000365200 NUDT5Q9UKK9 219 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-1175P-201ENST00000365200 PCDHB10Q9UN67 800 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-1175P-201ENST00000365200 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-1175P-201ENST00000365200 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-1175P-201ENST00000365200 FAN1Q9Y2M0 1017 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-1175P-201ENST00000365200 SH3D21A4FU49 640 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1175P-201ENST00000365200 ANKRD34BA5PLL1 514 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1175P-201ENST00000365200 PAMP19021 973 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1175P-201ENST00000365200 NASPP49321 788 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1175P-201ENST00000365200 SLC9A5Q14940 896 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1175P-201ENST00000365200 PPP2R5EQ16537 467 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1175P-201ENST00000365200 LIPIQ6XZB0 460 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1175P-201ENST00000365200 SAPCD2Q86UD0 394 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1175P-201ENST00000365200 PEX11GQ96HA9 241 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1175P-201ENST00000365200 SHDQ96IW2 340 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1175P-201ENST00000365200 SEC16BQ96JE7 1060 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1175P-201ENST00000365200 MTA3Q9BTC8 594 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1175P-201ENST00000365200 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1175P-201ENST00000365200 ADAM7Q9H2U9 754 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1175P-201ENST00000365200 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1175P-201ENST00000365200 RWDD3Q9Y3V2 267 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1175P-201ENST00000365200 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-1175P-201ENST00000365200 NPHS1O60500 1241 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-1175P-201ENST00000365200 ZBTB7AO95365 584 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-1175P-201ENST00000365200 PMLP29590 882 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-1175P-201ENST00000365200 MC3RP41968 323 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-1175P-201ENST00000365200 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
RNU6-1175P-201ENST00000365200 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
RNU6-1175P-201ENST00000365200 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-1175P-201ENST00000365200 KIAA1211LQ6NV74 962 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-1175P-201ENST00000365200 VHLLQ6RSH7 139 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-1175P-201ENST00000365200 DBX2Q6ZNG2 339 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-1175P-201ENST00000365200 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
RNU6-1175P-201ENST00000365200 NT5DC4Q86YG4 428 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-1175P-201ENST00000365200 CPNE8Q86YQ8 564 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-1175P-201ENST00000365200 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
RNU6-1175P-201ENST00000365200 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
RNU6-1175P-201ENST00000365200 CPLX3Q8WVH0 158 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-1175P-201ENST00000365200 CPA5Q8WXQ8 436 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-1175P-201ENST00000365200 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP3.53□□□□□ -1.84
RNU6-1175P-201ENST00000365200 GULP1Q9UBP9 304 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-1175P-201ENST00000365200 FBLN5Q9UBX5 448 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-1175P-201ENST00000365200 STRIP2Q9ULQ0 834 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-1175P-201ENST00000365200 A0A1B0GTL3 188 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1175P-201ENST00000365200 C7orf72A4D263 438 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1175P-201ENST00000365200 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1175P-201ENST00000365200 NAT2P11245 290 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1175P-201ENST00000365200 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1175P-201ENST00000365200 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1175P-201ENST00000365200 RTP5Q14D33 572 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1175P-201ENST00000365200 NT5DC1Q5TFE4 455 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1175P-201ENST00000365200 WWC2Q6AWC2 1192 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1175P-201ENST00000365200 POMZP3Q6PJE2 187 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1175P-201ENST00000365200 BVESQ8NE79 360 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1175P-201ENST00000365200 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1175P-201ENST00000365200 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1175P-201ENST00000365200 COPS5Q92905 334 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1175P-201ENST00000365200 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1175P-201ENST00000365200 MMP19Q99542 508 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1175P-201ENST00000365200 APBA2Q99767 749 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1175P-201ENST00000365200 SPATA25Q9BR10 227 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1175P-201ENST00000365200 BCAS3Q9H6U6 928 aa3.52□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.9 ms