RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362817.1

RNU1-38P-201, Transcript of RNA, U1 small nuclear 38, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU1-38P, Length 144 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU1-38P-201ENST00000362817 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
RNU1-38P-201ENST00000362817 SOWAHDA6NJG2 315 aa9.18□□□□□ -0.94
RNU1-38P-201ENST00000362817 TRAF5O00463 557 aa9.18□□□□□ -0.94
RNU1-38P-201ENST00000362817 SURF6O75683 361 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
RNU1-38P-201ENST00000362817 PHKA1P46020 1223 aa9.18□□□□□ -0.94
RNU1-38P-201ENST00000362817 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP9.18□□□□□ -0.94
RNU1-38P-201ENST00000362817 ADGRE1Q14246 886 aa9.18□□□□□ -0.94
RNU1-38P-201ENST00000362817 MFSD14BQ5SR56 506 aa9.18□□□□□ -0.94
RNU1-38P-201ENST00000362817 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
RNU1-38P-201ENST00000362817 DZANK1Q9NVP4 752 aa9.18□□□□□ -0.94
RNU1-38P-201ENST00000362817 MYH13Q9UKX3 1938 aa9.18□□□□□ -0.94
RNU1-38P-201ENST00000362817 AKAP2Q9Y2D5 859 aa9.18□□□□□ -0.94
RNU1-38P-201ENST00000362817 A0A1B0GUL7 405 aa9.17□□□□□ -0.94
RNU1-38P-201ENST00000362817 F8W031 263 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
RNU1-38P-201ENST00000362817 DLL1O00548 723 aa9.17□□□□□ -0.94
RNU1-38P-201ENST00000362817 WNT10BO00744 389 aa9.17□□□□□ -0.94
RNU1-38P-201ENST00000362817 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
RNU1-38P-201ENST00000362817 MMP14P50281 582 aa9.17□□□□□ -0.94
RNU1-38P-201ENST00000362817 KCNA1Q09470 495 aa9.17□□□□□ -0.94
RNU1-38P-201ENST00000362817 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
RNU1-38P-201ENST00000362817 MBTPS1Q14703 1052 aa9.17□□□□□ -0.94
RNU1-38P-201ENST00000362817 NBPF9Q3BBW0 867 aa9.17□□□□□ -0.94
RNU1-38P-201ENST00000362817 CST9Q5W186 159 aa9.17□□□□□ -0.94
RNU1-38P-201ENST00000362817 DLK2Q6UY11 383 aa9.17□□□□□ -0.94
RNU1-38P-201ENST00000362817 CDC37L1Q7L3B6 337 aa9.17□□□□□ -0.94
RNU1-38P-201ENST00000362817 USP48Q86UV5 1035 aa9.17□□□□□ -0.94
RNU1-38P-201ENST00000362817 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
RNU1-38P-201ENST00000362817 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa9.17□□□□□ -0.94
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
RNU1-38P-201ENST00000362817 LACRTQ9GZZ8 138 aa9.17□□□□□ -0.94
RNU1-38P-201ENST00000362817 ADAM19Q9H013 955 aa9.17□□□□□ -0.94
RNU1-38P-201ENST00000362817 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
RNU1-38P-201ENST00000362817 GGA3Q9NZ52 723 aa9.17□□□□□ -0.94
RNU1-38P-201ENST00000362817 HDAC9Q9UKV0 1011 aa9.17□□□□□ -0.94
RNU1-38P-201ENST00000362817 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa9.17□□□□□ -0.94
RNU1-38P-201ENST00000362817 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
RNU1-38P-201ENST00000362817 TRPM7Q96QT4 1865 aa9.17□□□□□ -0.94
RNU1-38P-201ENST00000362817 AOX1Q06278 1338 aa9.16□□□□□ -0.94
RNU1-38P-201ENST00000362817 ADM5C9JUS6 153 aa9.16□□□□□ -0.94
RNU1-38P-201ENST00000362817 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
RNU1-38P-201ENST00000362817 EREGO14944 169 aa9.16□□□□□ -0.94
RNU1-38P-201ENST00000362817 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
RNU1-38P-201ENST00000362817 CFAP100Q494V2 611 aa9.16□□□□□ -0.94
RNU1-38P-201ENST00000362817 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
RNU1-38P-201ENST00000362817 KRT26Q7Z3Y9 468 aa9.16□□□□□ -0.94
RNU1-38P-201ENST00000362817 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
RNU1-38P-201ENST00000362817 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa9.16□□□□□ -0.94
RNU1-38P-201ENST00000362817 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
RNU1-38P-201ENST00000362817 NEUROD6Q96NK8 337 aa9.16□□□□□ -0.94
RNU1-38P-201ENST00000362817 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa9.16□□□□□ -0.94
RNU1-38P-201ENST00000362817 GPR108Q9NPR9 543 aa9.16□□□□□ -0.94
RNU1-38P-201ENST00000362817 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
RNU1-38P-201ENST00000362817 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
RNU1-38P-201ENST00000362817 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa9.16□□□□□ -0.94
RNU1-38P-201ENST00000362817 ECM29Q5VYK3 1845 aa9.15□□□□□ -0.94
RNU1-38P-201ENST00000362817 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa9.15□□□□□ -0.94
RNU1-38P-201ENST00000362817 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
RNU1-38P-201ENST00000362817 SETDB1Q15047 1291 aa9.15□□□□□ -0.94
RNU1-38P-201ENST00000362817 TNNI3KQ59H18 835 aa9.15□□□□□ -0.94
RNU1-38P-201ENST00000362817 SHISA2Q6UWI4 295 aa9.15□□□□□ -0.94
RNU1-38P-201ENST00000362817 WNT8BQ93098 351 aa9.15□□□□□ -0.94
RNU1-38P-201ENST00000362817 DMRTB1Q96MA1 342 aa9.15□□□□□ -0.94
RNU1-38P-201ENST00000362817 FAM129BQ96TA1 746 aa9.15□□□□□ -0.94
RNU1-38P-201ENST00000362817 TRAIPQ9BWF2 469 aa9.15□□□□□ -0.94
RNU1-38P-201ENST00000362817 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
RNU1-38P-201ENST00000362817 DENND2AQ9ULE3 1009 aa9.15□□□□□ -0.94
RNU1-38P-201ENST00000362817 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
RNU1-38P-201ENST00000362817 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa9.15□□□□□ -0.94
RNU1-38P-201ENST00000362817 SALL1Q9NSC2 1324 aa9.14□□□□□ -0.95
RNU1-38P-201ENST00000362817 CELF2O95319 508 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
RNU1-38P-201ENST00000362817 RASGRF1Q13972 1273 aa9.14□□□□□ -0.95
RNU1-38P-201ENST00000362817 DLGAP5Q15398 846 aa9.14□□□□□ -0.95
RNU1-38P-201ENST00000362817 KLHL23Q8NBE8 558 aa9.14□□□□□ -0.95
RNU1-38P-201ENST00000362817 WDR66Q8TBY9 1149 aa9.14□□□□□ -0.95
RNU1-38P-201ENST00000362817 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
RNU1-38P-201ENST00000362817 CRBNQ96SW2 442 aa9.14□□□□□ -0.95
RNU1-38P-201ENST00000362817 OSMRQ99650 979 aa9.14□□□□□ -0.95
RNU1-38P-201ENST00000362817 DBNDD2Q9BQY9 259 aa9.14□□□□□ -0.95
RNU1-38P-201ENST00000362817 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
RNU1-38P-201ENST00000362817 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa9.14□□□□□ -0.95
RNU1-38P-201ENST00000362817 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
RNU1-38P-201ENST00000362817 PCNTO95613 3336 aa9.13□□□□□ -0.95
RNU1-38P-201ENST00000362817 HMMRO75330 724 aa9.13□□□□□ -0.95
RNU1-38P-201ENST00000362817 PRDX5P30044 214 aa9.13□□□□□ -0.95
RNU1-38P-201ENST00000362817 CRKP46108 304 aa9.13□□□□□ -0.95
RNU1-38P-201ENST00000362817 ERC1Q8IUD2 1116 aa9.13□□□□□ -0.95
RNU1-38P-201ENST00000362817 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
RNU1-38P-201ENST00000362817 CDCA5Q96FF9 252 aa9.13□□□□□ -0.95
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa9.13□□□□□ -0.95
RNU1-38P-201ENST00000362817 MRIQ9BWK5 157 aa9.13□□□□□ -0.95
RNU1-38P-201ENST00000362817 RBCK1Q9BYM8 510 aa9.13□□□□□ -0.95
RNU1-38P-201ENST00000362817 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZNF408Q9H9D4 720 aa9.13□□□□□ -0.95
RNU1-38P-201ENST00000362817 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
RNU1-38P-201ENST00000362817 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
RNU1-38P-201ENST00000362817 CNTNAP1P78357 1384 aa9.12□□□□□ -0.95
RNU1-38P-201ENST00000362817 CLRN2A0PK11 232 aa9.12□□□□□ -0.95
RNU1-38P-201ENST00000362817 H3BRJ5 948 aa9.12□□□□□ -0.95
RNU1-38P-201ENST00000362817 LINC01387J3KSC0 135 aa9.12□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.4 ms