RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359315.6

TPGS1-201, Transcript of tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TPGS1, Length 1,114 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1-201ENST00000359315 COL6A1P12109 1028 aa31.3■■■□□ 2.6
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TPGS1-201ENST00000359315 MORC4Q8TE76 937 aa31.3■■■□□ 2.6
TPGS1-201ENST00000359315 C11orf49Q9H6J7 331 aa31.3■■■□□ 2.6
TPGS1-201ENST00000359315 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa31.29■■■□□ 2.6
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TPGS1-201ENST00000359315 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP31.28■■■□□ 2.6
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TPGS1-201ENST00000359315 ADCYAP1R1P41586 468 aa31.27■■■□□ 2.6
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TPGS1-201ENST00000359315 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa31.27■■■□□ 2.6
TPGS1-201ENST00000359315 LZTS2Q9BRK4 669 aa31.27■■■□□ 2.6
TPGS1-201ENST00000359315 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP31.27■■■□□ 2.6
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TPGS1-201ENST00000359315 TM6SF1Q9BZW5 370 aa31.21■■■□□ 2.59
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TPGS1-201ENST00000359315 PCDH10Q9P2E7 1040 aa31.19■■■□□ 2.58
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TPGS1-201ENST00000359315 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP31.18■■■□□ 2.58
TPGS1-201ENST00000359315 TRAF1Q13077 416 aa31.18■■■□□ 2.58
TPGS1-201ENST00000359315 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP31.18■■■□□ 2.58
TPGS1-201ENST00000359315 KLHDC9Q8NEP7 349 aa31.18■■■□□ 2.58
TPGS1-201ENST00000359315 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP31.18■■■□□ 2.58
TPGS1-201ENST00000359315 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP31.18■■■□□ 2.58
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TPGS1-201ENST00000359315 NID2Q14112 1375 aa31.17■■■□□ 2.58
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