RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000353468.4

SIGMAR1-202, Transcript of sigma non-opioid intracellular receptor 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SIGMAR1, Length 1,582 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIGMAR1-202ENST00000353468 TRAPPC10P48553 1259 aa22.97■■□□□ 1.27
SIGMAR1-202ENST00000353468 INF2Q27J81 1249 aa22.97■■□□□ 1.27
SIGMAR1-202ENST00000353468 DEFB115Q30KQ5 88 aa22.97■■□□□ 1.27
SIGMAR1-202ENST00000353468 CYP4F22Q6NT55 531 aa22.97■■□□□ 1.27
SIGMAR1-202ENST00000353468 PGBD1Q96JS3 809 aa22.97■■□□□ 1.27
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SIGMAR1-202ENST00000353468 GDPD2Q9HCC8 539 aa22.97■■□□□ 1.27
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SIGMAR1-202ENST00000353468 SPATA32Q96LK8 384 aa22.95■■□□□ 1.26
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SIGMAR1-202ENST00000353468 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa22.95■■□□□ 1.26
SIGMAR1-202ENST00000353468 SLC25A27O95847 323 aa22.94■■□□□ 1.26
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SIGMAR1-202ENST00000353468 TTC38Q5R3I4 469 aa22.94■■□□□ 1.26
SIGMAR1-202ENST00000353468 NEK8Q86SG6 692 aa22.94■■□□□ 1.26
SIGMAR1-202ENST00000353468 FCHSD1Q86WN1 690 aa22.94■■□□□ 1.26
SIGMAR1-202ENST00000353468 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
SIGMAR1-202ENST00000353468 ZIC5Q96T25 663 aa22.94■■□□□ 1.26
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SIGMAR1-202ENST00000353468 TM4SF4P48230 202 aa22.93■■□□□ 1.26
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SIGMAR1-202ENST00000353468 RNF207Q6ZRF8 634 aa22.93■■□□□ 1.26
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SIGMAR1-202ENST00000353468 STK38Q15208 465 aa22.93■■□□□ 1.26
SIGMAR1-202ENST00000353468 ZNF174Q15697 407 aa22.93■■□□□ 1.26
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SIGMAR1-202ENST00000353468 SLC39A14Q15043 492 aa22.92■■□□□ 1.26
SIGMAR1-202ENST00000353468 PTPAQ15257 358 aa22.92■■□□□ 1.26
SIGMAR1-202ENST00000353468 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
SIGMAR1-202ENST00000353468 LETM2Q2VYF4 491 aa22.92■■□□□ 1.26
SIGMAR1-202ENST00000353468 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa22.92■■□□□ 1.26
SIGMAR1-202ENST00000353468 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa22.92■■□□□ 1.26
SIGMAR1-202ENST00000353468 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
SIGMAR1-202ENST00000353468 CEP131Q9UPN4 1083 aa22.92■■□□□ 1.26
SIGMAR1-202ENST00000353468 DDX11L8A8MPP1 907 aa22.91■■□□□ 1.26
SIGMAR1-202ENST00000353468 EDIL3O43854 480 aa22.91■■□□□ 1.26
SIGMAR1-202ENST00000353468 ERCC3P19447 782 aa22.91■■□□□ 1.26
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SIGMAR1-202ENST00000353468 MORF4L1Q9UBU8 362 aa22.91■■□□□ 1.26
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SIGMAR1-202ENST00000353468 MCM7P33993 719 aa22.9■■□□□ 1.26
SIGMAR1-202ENST00000353468 SREBF1P36956 1147 aa22.9■■□□□ 1.26
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SIGMAR1-202ENST00000353468 SLC30A10Q6XR72 485 aa22.9■■□□□ 1.26
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SIGMAR1-202ENST00000353468 KCNG4Q8TDN1 519 aa22.89■■□□□ 1.26
SIGMAR1-202ENST00000353468 CRYGNQ8WXF5 182 aa22.89■■□□□ 1.26
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SIGMAR1-202ENST00000353468 MYH7BA7E2Y1 1941 aa22.89■■□□□ 1.25
SIGMAR1-202ENST00000353468 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
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