RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 CNTNAP1P78357 1384 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 SGSM2O43147 1006 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 OFD1O75665 1012 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 GH1P01241 217 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 ME1P48163 572 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 LONRF3Q496Y0 759 aa5.02□□□□□ -1.61
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PTPRC-201ENST00000348564 ZNF697Q5TEC3 545 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 KRT79Q5XKE5 535 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM47Q9BQJ4 181 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
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PTPRC-201ENST00000348564 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 NUP188Q5SRE5 1749 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 A0A0D9SFI3 127 aa5.02□□□□□ -1.61
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PTPRC-201ENST00000348564 CTR9Q6PD62 1173 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 OTUD6AQ7L8S5 288 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 CATSPER4Q7RTX7 472 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 DCAF4Q8WV16 495 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP5.02□□□□□ -1.61
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PTPRC-201ENST00000348564 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 FAM198AQ9UFP1 575 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF609O15014 1411 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 RPTORQ8N122 1335 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP5.02□□□□□ -1.61
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PTPRC-201ENST00000348564 MYBP10242 640 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 CREB3L3Q68CJ9 461 aa5.02□□□□□ -1.61
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PTPRC-201ENST00000348564 NEDD1Q8NHV4 660 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 IDI2Q9BXS1 227 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 USP26Q9BXU7 913 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 FOSP01100 380 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
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PTPRC-201ENST00000348564 ODF2Q5BJF6 829 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 TREML2Q5T2D2 321 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
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PTPRC-201ENST00000348564 NECAB1Q8N987 351 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 SLC7A3Q8WY07 619 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 NLRP4Q96MN2 994 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 TINF2Q9BSI4 451 aa5.01□□□□□ -1.61
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PTPRC-201ENST00000348564 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
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PTPRC-201ENST00000348564 TLE2Q04725 743 aa5.01□□□□□ -1.61
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PTPRC-201ENST00000348564 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa5.01□□□□□ -1.61
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PTPRC-201ENST00000348564 THNSL1Q8IYQ7 743 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 PDILTQ8N807 584 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC150Q8NCX0 1101 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 DEPTORQ8TB45 409 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 MFSD1Q9H3U5 465 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 CEP131Q9UPN4 1083 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 LY75O60449 1722 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 RIC1Q4ADV7 1423 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 PEX10O60683 326 aa5.01□□□□□ -1.61
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PTPRC-201ENST00000348564 PCP11498 1178 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM62Q0P6H9 643 aa5.01□□□□□ -1.61
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PTPRC-201ENST00000348564 MTMR4Q9NYA4 1195 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 NYAP2Q9P242 653 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 PRR12Q9ULL5 1215 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 FAM13AO94988 1023 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 FGBP02675 491 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 NR3C2P08235 984 aa5.01□□□□□ -1.61
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PTPRC-201ENST00000348564 DSG3P32926 999 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 ACVR2BQ13705 512 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 RABEP1Q15276 862 aa5.01□□□□□ -1.61
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