RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340994.4

PKHD1-201, Transcript of PKHD1, fibrocystin/polyductin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PKHD1, Length 11,589 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1-201ENST00000340994 STAT2P52630 851 aa8.92□□□□□ -0.98
PKHD1-201ENST00000340994 EP400NLQ6ZTU2 488 aa8.92□□□□□ -0.98
PKHD1-201ENST00000340994 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
PKHD1-201ENST00000340994 DYDC2Q96IM9 177 aa8.92□□□□□ -0.98
PKHD1-201ENST00000340994 VIPAS39Q9H9C1 493 aa8.92□□□□□ -0.98
PKHD1-201ENST00000340994 SHROOM2Q13796 1616 aa8.92□□□□□ -0.98
PKHD1-201ENST00000340994 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
PKHD1-201ENST00000340994 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP8.92□□□□□ -0.98
PKHD1-201ENST00000340994 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa8.92□□□□□ -0.98
PKHD1-201ENST00000340994 PODXLO00592 558 aa8.92□□□□□ -0.98
PKHD1-201ENST00000340994 DEFA1P59665 94 aa8.92□□□□□ -0.98
PKHD1-201ENST00000340994 DEFA3P59666 94 aa8.92□□□□□ -0.98
PKHD1-201ENST00000340994 LONRF3Q496Y0 759 aa8.92□□□□□ -0.98
PKHD1-201ENST00000340994 HDAC11Q96DB2 347 aa8.92□□□□□ -0.98
PKHD1-201ENST00000340994 SESN1Q9Y6P5 492 aa8.92□□□□□ -0.98
PKHD1-201ENST00000340994 CCDC78A2IDD5 438 aa8.92□□□□□ -0.98
PKHD1-201ENST00000340994 KLC1Q07866 573 aa8.92□□□□□ -0.98
PKHD1-201ENST00000340994 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
PKHD1-201ENST00000340994 PARD6BQ9BYG5 372 aa8.92□□□□□ -0.98
PKHD1-201ENST00000340994 BLOC1S6Q9UL45 172 aa8.92□□□□□ -0.98
PKHD1-201ENST00000340994 LRMPQ12912 555 aa8.92□□□□□ -0.98
PKHD1-201ENST00000340994 ARHGAP44Q17R89 818 aa8.92□□□□□ -0.98
PKHD1-201ENST00000340994 RNF34Q969K3 372 aa8.92□□□□□ -0.98
PKHD1-201ENST00000340994 SNX5Q9Y5X3 404 aa8.92□□□□□ -0.98
PKHD1-201ENST00000340994 MRC2Q9UBG0 1479 aa8.92□□□□□ -0.98
PKHD1-201ENST00000340994 C4BPBP20851 252 aa8.92□□□□□ -0.98
PKHD1-201ENST00000340994 ADCY7P51828 1080 aa8.92□□□□□ -0.98
PKHD1-201ENST00000340994 CEP55Q53EZ4 464 aa8.92□□□□□ -0.98
PKHD1-201ENST00000340994 NEK8Q86SG6 692 aa8.92□□□□□ -0.98
PKHD1-201ENST00000340994 MYOCDQ8IZQ8 938 aa8.92□□□□□ -0.98
PKHD1-201ENST00000340994 FAM210AQ96ND0 272 aa8.92□□□□□ -0.98
PKHD1-201ENST00000340994 ECE1P42892 770 aa8.92□□□□□ -0.98
PKHD1-201ENST00000340994 TRAPPC10P48553 1259 aa8.92□□□□□ -0.98
PKHD1-201ENST00000340994 PRPSAP1Q14558 356 aa8.92□□□□□ -0.98
PKHD1-201ENST00000340994 LETM2Q2VYF4 491 aa8.92□□□□□ -0.98
PKHD1-201ENST00000340994 SLC44A4Q53GD3 710 aa8.92□□□□□ -0.98
PKHD1-201ENST00000340994 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
PKHD1-201ENST00000340994 GPT2Q8TD30 523 aa8.92□□□□□ -0.98
PKHD1-201ENST00000340994 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa8.92□□□□□ -0.98
PKHD1-201ENST00000340994 H2AFZP0C0S5 128 aa8.92□□□□□ -0.98
PKHD1-201ENST00000340994 CRYMQ14894 314 aa8.92□□□□□ -0.98
PKHD1-201ENST00000340994 MYSM1Q5VVJ2 828 aa8.92□□□□□ -0.98
PKHD1-201ENST00000340994 H2AFVQ71UI9 128 aa8.92□□□□□ -0.98
PKHD1-201ENST00000340994 SLFN12Q8IYM2 578 aa8.92□□□□□ -0.98
PKHD1-201ENST00000340994 MAML1Q92585 1016 aa8.92□□□□□ -0.98
PKHD1-201ENST00000340994 DSCC1Q9BVC3 393 aa8.92□□□□□ -0.98
PKHD1-201ENST00000340994 SLFN14P0C7P3 912 aa8.92□□□□□ -0.98
PKHD1-201ENST00000340994 BLVRAP53004 296 aa8.92□□□□□ -0.98
PKHD1-201ENST00000340994 TAF12Q16514 161 aa8.92□□□□□ -0.98
PKHD1-201ENST00000340994 KIRREL3Q8IZU9 778 aa8.92□□□□□ -0.98
PKHD1-201ENST00000340994 MAGEB6Q8N7X4 407 aa8.92□□□□□ -0.98
PKHD1-201ENST00000340994 FBXL13Q8NEE6 735 aa8.92□□□□□ -0.98
PKHD1-201ENST00000340994 BPIFA3Q9BQP9 254 aa8.92□□□□□ -0.98
PKHD1-201ENST00000340994 ANLNQ9NQW6 1124 aa8.92□□□□□ -0.98
PKHD1-201ENST00000340994 SNRKQ9NRH2 765 aa8.92□□□□□ -0.98
PKHD1-201ENST00000340994 MPP6Q9NZW5 540 aa8.92□□□□□ -0.98
PKHD1-201ENST00000340994 PDP2Q9P2J9 529 aa8.92□□□□□ -0.98
PKHD1-201ENST00000340994 H0Y626 953 aa8.91□□□□□ -0.98
PKHD1-201ENST00000340994 TRIM16O95361 564 aa8.91□□□□□ -0.98
PKHD1-201ENST00000340994 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
PKHD1-201ENST00000340994 RNF169Q8NCN4 708 aa8.91□□□□□ -0.98
PKHD1-201ENST00000340994 CD2APQ9Y5K6 639 aa8.91□□□□□ -0.98
PKHD1-201ENST00000340994 ESYT2A0FGR8 921 aa8.91□□□□□ -0.98
PKHD1-201ENST00000340994 GRID2IPA4D2P6 1211 aa8.91□□□□□ -0.98
PKHD1-201ENST00000340994 SH3GL2Q99962 352 aa8.91□□□□□ -0.98
PKHD1-201ENST00000340994 ZFP69BQ9UJL9 534 aa8.91□□□□□ -0.98
PKHD1-201ENST00000340994 SBNO1A3KN83 1393 aa8.91□□□□□ -0.98
PKHD1-201ENST00000340994 TFAP4Q01664 338 aa8.91□□□□□ -0.98
PKHD1-201ENST00000340994 BFSP1Q12934 665 aa8.91□□□□□ -0.98
PKHD1-201ENST00000340994 C1orf146Q5VVC0 180 aa8.91□□□□□ -0.98
PKHD1-201ENST00000340994 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
PKHD1-201ENST00000340994 EPB41L5Q9HCM4 733 aa8.91□□□□□ -0.98
PKHD1-201ENST00000340994 USP40Q9NVE5 1235 aa8.91□□□□□ -0.98
PKHD1-201ENST00000340994 PNMA2Q9UL42 364 aa8.91□□□□□ -0.98
PKHD1-201ENST00000340994 CCPG1Q9ULG6 757 aa8.91□□□□□ -0.98
PKHD1-201ENST00000340994 SNX14Q9Y5W7 946 aa8.91□□□□□ -0.98
PKHD1-201ENST00000340994 ZMYM6O95789 1325 aa8.91□□□□□ -0.98
PKHD1-201ENST00000340994 FLT4P35916 1363 aa8.91□□□□□ -0.98
PKHD1-201ENST00000340994 EHHADHQ08426 723 aa8.91□□□□□ -0.98
PKHD1-201ENST00000340994 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
PKHD1-201ENST00000340994 IFNAR2P48551 515 aa8.91□□□□□ -0.98
PKHD1-201ENST00000340994 PDE1BQ01064 536 aa8.91□□□□□ -0.98
PKHD1-201ENST00000340994 DR1Q01658 176 aa8.91□□□□□ -0.98
PKHD1-201ENST00000340994 SENP1Q9P0U3 644 aa8.91□□□□□ -0.98
PKHD1-201ENST00000340994 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa8.91□□□□□ -0.98
PKHD1-201ENST00000340994 IQCA1LA6NCM1 817 aa8.91□□□□□ -0.98
PKHD1-201ENST00000340994 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa8.91□□□□□ -0.98
PKHD1-201ENST00000340994 NUDCD1Q96RS6 583 aa8.91□□□□□ -0.98
PKHD1-201ENST00000340994 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa8.91□□□□□ -0.98
PKHD1-201ENST00000340994 WASLO00401 505 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
PKHD1-201ENST00000340994 KRT37O76014 449 aa8.91□□□□□ -0.98
PKHD1-201ENST00000340994 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP8.91□□□□□ -0.98
PKHD1-201ENST00000340994 MYO1EQ12965 1108 aa8.91□□□□□ -0.98
PKHD1-201ENST00000340994 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa8.91□□□□□ -0.98
PKHD1-201ENST00000340994 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
PKHD1-201ENST00000340994 HORMAD1Q86X24 394 aa8.91□□□□□ -0.98
PKHD1-201ENST00000340994 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
PKHD1-201ENST00000340994 C3orf20Q8ND61 904 aa8.91□□□□□ -0.98
PKHD1-201ENST00000340994 HOOK2Q96ED9 719 aa8.91□□□□□ -0.98
PKHD1-201ENST00000340994 YIPF3Q9GZM5 350 aa8.91□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.5 ms