RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330233.11

CRIP1-201, Transcript of cysteine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CRIP1, Length 1,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1-201ENST00000330233 GHRHRQ02643 423 aa30.87■■■□□ 2.53
CRIP1-201ENST00000330233 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP30.87■■■□□ 2.53
CRIP1-201ENST00000330233 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa30.87■■■□□ 2.53
CRIP1-201ENST00000330233 SLC26A6Q9BXS9 759 aa30.87■■■□□ 2.53
CRIP1-201ENST00000330233 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP30.87■■■□□ 2.53
CRIP1-201ENST00000330233 FLRT1Q9NZU1 646 aa30.87■■■□□ 2.53
CRIP1-201ENST00000330233 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP30.87■■■□□ 2.53
CRIP1-201ENST00000330233 CFBP00751 764 aa30.86■■■□□ 2.53
CRIP1-201ENST00000330233 CALML3P27482 149 aa30.86■■■□□ 2.53
CRIP1-201ENST00000330233 MCM2P49736 904 aa30.86■■■□□ 2.53
CRIP1-201ENST00000330233 TBC1D5Q92609 795 aa30.86■■■□□ 2.53
CRIP1-201ENST00000330233 GTF3C6Q969F1 213 aa30.86■■■□□ 2.53
CRIP1-201ENST00000330233 OPLAHO14841 1288 aa30.85■■■□□ 2.53
CRIP1-201ENST00000330233 IGHA2P01877 340 aa30.85■■■□□ 2.53
CRIP1-201ENST00000330233 SCG2P13521 617 aa30.85■■■□□ 2.53
CRIP1-201ENST00000330233 TINF2Q9BSI4 451 aa30.85■■■□□ 2.53
CRIP1-201ENST00000330233 MCM3APO60318 1980 aa30.84■■■□□ 2.53
CRIP1-201ENST00000330233 LCTP09848 1927 aa30.84■■■□□ 2.53
CRIP1-201ENST00000330233 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa30.84■■■□□ 2.53
CRIP1-201ENST00000330233 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP30.84■■■□□ 2.53
CRIP1-201ENST00000330233 LARGE1O95461 756 aa30.84■■■□□ 2.53
CRIP1-201ENST00000330233 INHAP05111 366 aa30.84■■■□□ 2.53
CRIP1-201ENST00000330233 POLR2MP0CAP2 368 aa30.84■■■□□ 2.53
CRIP1-201ENST00000330233 HSD17B4P51659 736 aa30.84■■■□□ 2.53
CRIP1-201ENST00000330233 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP30.84■■■□□ 2.53
CRIP1-201ENST00000330233 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa30.84■■■□□ 2.53
CRIP1-201ENST00000330233 SLC30A10Q6XR72 485 aa30.84■■■□□ 2.53
CRIP1-201ENST00000330233 NECAB1Q8N987 351 aa30.84■■■□□ 2.53
CRIP1-201ENST00000330233 DNERQ8NFT8 737 aa30.84■■■□□ 2.53
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF333Q96JL9 665 aa30.84■■■□□ 2.53
CRIP1-201ENST00000330233 BARHL2Q9NY43 387 aa30.84■■■□□ 2.53
CRIP1-201ENST00000330233 ASB14A6NK59 587 aa30.83■■■□□ 2.53
CRIP1-201ENST00000330233 PKN1Q16512 942 aa30.83■■■□□ 2.53
CRIP1-201ENST00000330233 WWC2Q6AWC2 1192 aa30.83■■■□□ 2.53
CRIP1-201ENST00000330233 PPP1R18Q6NYC8 613 aa30.83■■■□□ 2.53
CRIP1-201ENST00000330233 TEX2Q8IWB9 1127 aa30.83■■■□□ 2.53
CRIP1-201ENST00000330233 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP30.83■■■□□ 2.53
CRIP1-201ENST00000330233 ABHD8Q96I13 439 aa30.83■■■□□ 2.53
CRIP1-201ENST00000330233 PSTPIP2Q9H939 334 aa30.83■■■□□ 2.53
CRIP1-201ENST00000330233 SOWAHBA6NEL2 793 aa30.82■■■□□ 2.52
CRIP1-201ENST00000330233 B4DLN1 442 aa30.82■■■□□ 2.52
CRIP1-201ENST00000330233 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP30.82■■■□□ 2.52
CRIP1-201ENST00000330233 NAPAP54920 295 aa30.82■■■□□ 2.52
CRIP1-201ENST00000330233 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP30.82■■■□□ 2.52
CRIP1-201ENST00000330233 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP30.82■■■□□ 2.52
CRIP1-201ENST00000330233 CUL5Q93034 780 aa30.82■■■□□ 2.52
CRIP1-201ENST00000330233 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP30.82■■■□□ 2.52
CRIP1-201ENST00000330233 HTTP42858 3142 aa30.82■■■□□ 2.52
CRIP1-201ENST00000330233 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa30.82■■■□□ 2.52
CRIP1-201ENST00000330233 DEXIO95424 95 aa30.81■■■□□ 2.52
CRIP1-201ENST00000330233 FGD4Q96M96 766 aa30.81■■■□□ 2.52
CRIP1-201ENST00000330233 GLT8D2Q9H1C3 349 aa30.81■■■□□ 2.52
CRIP1-201ENST00000330233 STXBP3O00186 592 aa30.8■■■□□ 2.52
CRIP1-201ENST00000330233 CYP2C19P33261 490 aa30.8■■■□□ 2.52
CRIP1-201ENST00000330233 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP30.8■■■□□ 2.52
CRIP1-201ENST00000330233 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa30.8■■■□□ 2.52
CRIP1-201ENST00000330233 NRBP1Q9UHY1 535 aa30.8■■■□□ 2.52
CRIP1-201ENST00000330233 RPTORQ8N122 1335 aa30.8■■■□□ 2.52
CRIP1-201ENST00000330233 PIK3CDO00329 1044 aa30.79■■■□□ 2.52
CRIP1-201ENST00000330233 PPFIA3O75145 1194 aa30.79■■■□□ 2.52
CRIP1-201ENST00000330233 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP30.79■■■□□ 2.52
CRIP1-201ENST00000330233 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP30.79■■■□□ 2.52
CRIP1-201ENST00000330233 TRIM32Q13049 653 aa30.79■■■□□ 2.52
CRIP1-201ENST00000330233 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP30.79■■■□□ 2.52
CRIP1-201ENST00000330233 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP30.79■■■□□ 2.52
CRIP1-201ENST00000330233 SH3GLB2Q9NR46 395 aa30.79■■■□□ 2.52
CRIP1-201ENST00000330233 STK36Q9NRP7 1315 aa30.79■■■□□ 2.52
CRIP1-201ENST00000330233 CTDNEP1O95476 244 aa30.78■■■□□ 2.52
CRIP1-201ENST00000330233 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP30.78■■■□□ 2.52
CRIP1-201ENST00000330233 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa30.78■■■□□ 2.52
CRIP1-201ENST00000330233 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP30.78■■■□□ 2.52
CRIP1-201ENST00000330233 TAAR1Q96RJ0 339 aa30.78■■■□□ 2.52
CRIP1-201ENST00000330233 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP30.78■■■□□ 2.52
CRIP1-201ENST00000330233 CNPY2Q9Y2B0 182 aa30.78■■■□□ 2.52
CRIP1-201ENST00000330233 SMCO2A6NFE2 343 aa30.77■■■□□ 2.52
CRIP1-201ENST00000330233 ARMCX2Q7L311 632 aa30.77■■■□□ 2.52
CRIP1-201ENST00000330233 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP30.77■■■□□ 2.52
CRIP1-201ENST00000330233 WASF1Q92558 559 aa30.77■■■□□ 2.52
CRIP1-201ENST00000330233 RMDN3Q96TC7 470 aa30.77■■■□□ 2.52
CRIP1-201ENST00000330233 MEIS2O14770 477 aa30.76■■■□□ 2.52
CRIP1-201ENST00000330233 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP30.76■■■□□ 2.52
CRIP1-201ENST00000330233 CCDC83Q8IWF9 413 aa30.76■■■□□ 2.52
CRIP1-201ENST00000330233 CCDC148Q8NFR7 591 aa30.76■■■□□ 2.52
CRIP1-201ENST00000330233 MORC4Q8TE76 937 aa30.76■■■□□ 2.52
CRIP1-201ENST00000330233 IWS1Q96ST2 819 aa30.76■■■□□ 2.52
CRIP1-201ENST00000330233 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa30.76■■■□□ 2.52
CRIP1-201ENST00000330233 RIC8AQ9NPQ8 531 aa30.76■■■□□ 2.52
CRIP1-201ENST00000330233 COL20A1Q9P218 1284 aa30.76■■■□□ 2.52
CRIP1-201ENST00000330233 ASTN1O14525 1302 aa30.76■■■□□ 2.51
CRIP1-201ENST00000330233 ESYT2A0FGR8 921 aa30.75■■■□□ 2.51
CRIP1-201ENST00000330233 CCL5P13501 91 aa30.75■■■□□ 2.51
CRIP1-201ENST00000330233 CENPFP49454 3210 aa30.75■■■□□ 2.51
CRIP1-201ENST00000330233 ADCY7P51828 1080 aa30.75■■■□□ 2.51
CRIP1-201ENST00000330233 ARHGEF16Q5VV41 709 aa30.75■■■□□ 2.51
CRIP1-201ENST00000330233 TYW1BQ6NUM6 668 aa30.75■■■□□ 2.51
CRIP1-201ENST00000330233 FCHSD1Q86WN1 690 aa30.75■■■□□ 2.51
CRIP1-201ENST00000330233 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP30.75■■■□□ 2.51
CRIP1-201ENST00000330233 TMEM106CQ9BVX2 250 aa30.75■■■□□ 2.51
CRIP1-201ENST00000330233 RNF208Q9H0X6 261 aa30.75■■■□□ 2.51
CRIP1-201ENST00000330233 C6orf50Q9HD87 102 aa30.75■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.1 ms